Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | 100% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 0 (0.000) | 23 (0.880) | 18/272 | NT | 100% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 22 (0.840) | 18/272 | NT | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
GCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACTTCGC > REL606/2448350‑2448644 | ccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTc > 2:436651‑M1/144‑150 (MQ=255) gTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccaa > 1:18502‑M1/1‑146 (MQ=255) aatgaaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaact < 2:236603‑M1/150‑17 (MQ=255) agtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGcc > 1:671399‑M1/127‑150 (MQ=255) atccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgggagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt < 1:645802‑M1/27‑1 (MQ=255) agCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggt < 2:379236‑M1/150‑24 (MQ=255) agttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt > 2:294695‑M1/120‑150 (MQ=255) gttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 2:350702‑M1/119‑150 (MQ=255) aGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaa > 2:451777‑M1/1‑123 (MQ=255) gTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaag < 2:672542‑M1/150‑38 (MQ=255) taccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaaccattaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg < 1:123144‑M1/44‑1 (MQ=255) accaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatataaggcgtaataccacaacccttaatttagcgcttatgggATGATTCCTCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGgcttc < 1:370183‑M1/45‑3 (MQ=255) aattgctggccagttatcggaatggtaactgatcagaacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacacttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaaa > 1:290961‑M1/91‑150 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc > 2:13136‑M1/87‑150 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc > 2:371256‑M1/87‑150 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc > 2:123504‑M1/87‑150 (MQ=255) aCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaaga < 1:577309‑M1/150‑66 (MQ=255) gttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGa < 2:24797‑M1/72‑1 (MQ=255) gttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGa < 1:260227‑M1/72‑1 (MQ=255) gagacagaccctggtGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagac < 1:663931‑M1/143‑67 (MQ=255) agagacagccctggtgagtGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGGGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagac < 1:157239‑M1/142‑67 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGat > 1:323244‑M1/78‑150 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGat > 2:260970‑M1/78‑150 (MQ=255) gCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatatgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacga > 1:497765‑M1/1‑82 (MQ=255) aCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacctgtctc > 2:665892‑M1/1‑77 (MQ=255) aCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgccacgttaagacgatgcct > 1:322794‑M1/1‑77 (MQ=255) gagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAc > 2:627985‑M1/71‑150 (MQ=255) cccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacctgtctct > 2:157683‑M1/1‑76 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt > 2:346715‑M1/1‑68 (MQ=255) cgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCCCCCCGAGCTTATGCAATAg < 1:480698‑M1/98‑1 (MQ=255) gtcGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggc < 1:256142‑M1/149‑101 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggcc > 2:256874‑M1/1‑49 (MQ=255) tatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctgc > 2:647701‑M1/43‑150 (MQ=255) 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aatacaacaacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGtct > 1:200241‑M1/33‑150 (MQ=255) gCTGTAGGACCATACATATAACAGCCGGCGATAATTcccattagctctaacttgagggttgaaccatctgaagtatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtgggctgtcagggatactg < 1:580820‑M1/150‑115 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaacgatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactg > 2:447711‑M1/1‑36 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactg < 2:131952‑M1/150‑115 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACt < 1:328856‑M1/127‑1 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTc < 2:209660‑M1/128‑1 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTc < 1:378651‑M1/128‑1 (MQ=255) ccGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagc < 2:459561‑M1/150‑139 (MQ=255) atgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATg > 2:368143‑M1/6‑150 (MQ=255) tAATTcccagaagcgctaacttaaggcttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtacttcatttgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccatgaatggccacctgtaagctccagat < 1:446443‑M1/150‑146 (MQ=255) aaTTctcatacgcgctcacttactggttgaaccatctgtagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgagttgccacctgtaagctccagatg < 1:58299‑M1/150‑147 (MQ=255) aaTTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatg < 2:499179‑M1/150‑147 (MQ=255) | GCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACTTCGC > REL606/2448350‑2448644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |