New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | GFP_Plasmid_Sequ | 2831 = | 40317 (0.960) | 9 (0.000) | 5/174 | 101.4 | 0.026% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | GFP_Plasmid_Sequ | = 2819 | 34856 (0.960) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 40740 total aligned reads displayed.
CACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGAAC > GFP_Plasmid_Sequ/2730‑2932 | aCCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgc > 3:155585/1‑101 (MQ=255) ctctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctg < 1:292783/101‑1 (MQ=255) tctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctgg > 3:811620/1‑101 (MQ=255) ctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggc > 1:1512574/1‑101 (MQ=255) ctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggc > 3:573803/1‑101 (MQ=255) cTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttt < 3:292372/101‑1 (MQ=255) ttGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggcctttt > 1:62423/1‑101 (MQ=255) tGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttttg < 1:1420709/101‑1 (MQ=255) tGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCctggccttttgctggccttttg > 3:842690/1‑101 (MQ=255) gAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCtggccttttgctggccttttgc > 3:44853/1‑101 (MQ=255) gCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTc > 3:1464088/1‑101 (MQ=255) cGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTca > 1:655617/1‑101 (MQ=255) gTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTcac < 1:1387834/101‑1 (MQ=255) tCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTTCTGGCCTTTTGCTctca > 1:1329213/1‑101 (MQ=255) tCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTcaca > 1:594681/1‑101 (MQ=255) tCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTcaca < 1:1119134/101‑1 (MQ=255) cGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAt > 3:509406/1‑101 (MQ=255) gATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATg > 1:715069/1‑101 (MQ=255) gATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATg > 1:927415/1‑101 (MQ=255) tttttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTc < 3:968966/101‑1 (MQ=255) ttttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTcc > 1:1481350/1‑101 (MQ=255) ttttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTcc < 1:8978/101‑1 (MQ=255) ttttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAACCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGACTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTcc > 3:230951/1‑101 (MQ=255) ttGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCta < 1:47316/101‑2 (MQ=255) tgtgATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCttt > 3:1525865/1‑101 (MQ=255) tgtgATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCttt < 2:137186/101‑1 (MQ=255) tgATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTcc > 3:694767/1‑101 (MQ=255) gATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCt > 3:1338569/1‑101 (MQ=255) tGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGc > 1:1028576/1‑101 (MQ=255) gCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCg < 3:999562/101‑1 (MQ=255) gCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCg < 1:804882/101‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGtt > 1:1000064/1‑101 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGtt < 1:1147655/101‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAAGACCTGTCCTGCGtt < 4:146828/101‑1 (MQ=255) cGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTa > 3:14049/1‑101 (MQ=255) cGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCT‑GCCTTTTGCTCACATGTCCTTTTCTGCGTTAt > 3:1433468/1‑101 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTAt > 1:232907/1‑101 (MQ=255) tCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATc > 3:1308218/1‑101 (MQ=255) aGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATccc > 1:1178554/1‑101 (MQ=255) ggggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATcccc > 3:1275502/1‑101 (MQ=255) gggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCt > 3:606607/1‑101 (MQ=255) gggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCt > 3:72186/1‑101 (MQ=255) ggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTg < 1:1056488/101‑1 (MQ=255) gCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGAtt > 1:836162/1‑101 (MQ=255) gCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCtgtg > 1:1357724/1‑101 (MQ=255) ccTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTgg > 1:353923/1‑101 (MQ=255) cTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGa > 1:992069/1‑101 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATa < 3:1120422/101‑1 (MQ=255) tGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATaa > 3:416314/1‑101 (MQ=255) tGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATaa > 3:321547/1‑101 (MQ=255) ggAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAAc < 1:535104/101‑1 (MQ=255) ggAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAAc < 1:145096/101‑1 (MQ=255) gAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAAcc < 3:544577/101‑1 (MQ=255) gAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAAcc < 3:1245317/101‑1 (MQ=255) gAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAAcc > 3:1373099/1‑101 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg > 3:352817/1‑101 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg < 3:664625/101‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg < 3:1214099/101‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCg < 3:749945/101‑1 (MQ=255) aCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTAtt < 1:38597/101‑1 (MQ=255) cGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTa > 1:744211/1‑101 (MQ=255) gCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTagatc > 3:1586787/1‑97 (MQ=255) ccAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTAcc > 3:874389/1‑101 (MQ=255) aGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGc > 3:1181660/1‑101 (MQ=255) aGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGc > 1:1239025/1‑101 (MQ=255) aGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTATGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACTGTATTACCGc > 3:171206/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGcc < 3:476462/101‑1 (MQ=255) gCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGcc > 3:108590/1‑101 (MQ=255) cAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCt > 3:1152369/1‑101 (MQ=255) cAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTCGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCt > 1:413523/1‑101 (MQ=255) aaCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCtt < 1:503890/101‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATGCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtg > 1:1087495/1‑101 (MQ=255) gcgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtga > 1:172251/1‑101 (MQ=255) cgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgag > 1:959283/1‑101 (MQ=255) ggCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagt < 3:904862/101‑1 (MQ=255) gCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtg < 3:200489/101‑1 (MQ=255) gCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtg < 1:565348/101‑1 (MQ=255) cTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTtgagtgag > 3:937512/1‑101 (MQ=255) ttACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGa < 1:263577/101‑1 (MQ=255) aCGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATa < 3:384333/101‑1 (MQ=255) aCGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATa > 1:683613/1‑101 (MQ=255) cGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAc > 3:260031/1‑101 (MQ=255) ggTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAcc > 1:202803/1‑101 (MQ=255) ggTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATAcc > 3:1054810/1‑101 (MQ=255) gTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCg > 1:443876/1‑101 (MQ=255) gTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATGACCGNCGGGGAGGGAGCGGATActg < 4:52067/101‑3 (MQ=255) ttCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGc < 2:93526/101‑1 (MQ=255) tCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCt < 1:324230/101‑1 (MQ=255) tCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCt < 2:40396/101‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTc < 1:775066/101‑1 (MQ=255) ctggccttttgctggccttttgCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTcg < 3:1026265/101‑1 (MQ=255) ggccttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTcgcc < 1:126892/101‑1 (MQ=255) cttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCCGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCa > 3:1493294/1‑101 (MQ=255) ttttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAg < 1:1207678/101‑1 (MQ=255) ttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGcc < 1:1575608/101‑1 (MQ=255) ttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGcc < 1:1543905/101‑1 (MQ=255) ttgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGcc < 1:866119/101‑1 (MQ=255) tgctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCg > 1:1299977/1‑101 (MQ=255) tgctggccttttgctCACATGACCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCg < 3:781158/101‑1 (MQ=255) gctggccttttgctCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGa > 3:635295/1‑101 (MQ=255) | CACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTCCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGAAC > GFP_Plasmid_Sequ/2730‑2932 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |