| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | ADP1‑WT | 1722721 = | 0 (0.000) | 36 (1.070) | 30/250 | 0.0 | 100% | coding (1536/2397 nt) | quiA | quinate/shikimate dehydrogenase [pyrroloquinoline‑quinone] (NAD(P)‑independent quinate dehydrogenase) |
| ? | pYTK001_with_tdk_kan | = 1688 | 0 (0.000) | intergenic (–/+123) | –/CamR | –/– | |||||
CAACCAAGTTTGGTAGACTTCCCAATGAAAGATGGTACAACTAAACCTGCGGTTGTTATTGGCACTAAATCAGGTCAGTTTTATGTACTTGATCGTGTGACAGGTAAACCACTGACTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAAGAGTCTGAT > ADP1‑WT/1722605‑1722838 | ttttctccttcactacagaaacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATc < 2:46426‑M1/10‑1 (MQ=255) tacagaaacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTa < 1:8407‑M1/23‑1 (MQ=255) aaacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTg < 1:168612‑M1/28‑1 (MQ=255) aaacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTg < 1:370382‑M1/28‑1 (MQ=255) aacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTgg < 2:468816‑M1/29‑1 (MQ=255) tttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGata < 2:363910‑M1/35‑1 (MQ=255) ttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGatat > 2:93799‑M1/91‑126 (MQ=255) caaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCt > 1:355707‑M1/87‑126 (MQ=255) aatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCg < 2:207364‑M1/44‑1 (MQ=255) aatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCg < 1:15285‑M1/44‑1 (MQ=255) tggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACa > 2:306983‑M1/79‑126 (MQ=255) tggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACa > 1:46482‑M1/79‑126 (MQ=255) ggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCTAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACaa > 1:416661‑M1/78‑126 (MQ=255) ggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACaa > 1:377554‑M1/78‑126 (MQ=255) gtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAAt < 1:247045‑M1/50‑1 (MQ=255) attgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATAc < 2:280916‑M1/52‑1 (MQ=255) atcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTaaaa < 1:47881‑M1/59‑1 (MQ=255) tcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGTTATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAAc < 2:276991‑M1/60‑1 (MQ=255) tcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAAc > 2:246665‑M1/67‑126 (MQ=255) tgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCa > 2:201379‑M1/64‑126 (MQ=255) aataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGTTATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGt > 1:277407‑M1/57‑126 (MQ=255) aaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCa > 2:177859‑M1/54‑126 (MQ=255) atttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGc < 2:412895‑M1/86‑1 (MQ=255) tttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCa < 2:129761‑M1/87‑1 (MQ=255) ttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCaa > 1:281340‑M1/39‑126 (MQ=255) ttgatgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCaa < 1:143591‑M1/88‑1 (MQ=255) tgctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTg > 1:469494‑M1/35‑126 (MQ=255) ctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGt > 1:413493‑M1/33‑126 (MQ=255) ctcgatgagtttttctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGt > 2:8396‑M1/33‑126 (MQ=255) ctaagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTaa < 2:48825‑M1/108‑1 (MQ=255) taagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTaaa > 2:369863‑M1/18‑126 (MQ=255) taagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTaaa > 2:168363‑M1/18‑126 (MQ=255) aagcatgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAag < 2:111902‑M1/110‑1 (MQ=255) atgcggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAAGAGTc < 1:18236‑M1/114‑1 (MQ=255) cggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAAGAGTCTGa > 2:47821‑M1/10‑126 (MQ=255) ggagctggTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAAGAGTCTGat > 1:48888‑M1/9‑126 (MQ=255) | CAACCAAGTTTGGTAGACTTCCCAATGAAAGATGGTACAACTAAACCTGCGGTTGTTATTGGCACTAAATCAGGTCAGTTTTATGTACTTGATCGTGTGACAGGTAAACCACTGACTAAAGTGATCGAGCAGCCAATTAAAGTGGCTGATATTCCTGGCGAACAATACAGTAAAACTCAGCCGCGTTCAGTTGAAATGCCGCAAATTGGTAATCAGACACTTAAAGAGTCTGAT > ADP1‑WT/1722605‑1722838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |