| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 173 | 30 | 2 bp→GC | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 173 | 30 | 0 | A | G | 86.2% | 376.6 / 42.2 | 145 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/9); new base G (67/58); total (78/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
| * | 173 | 31 | 0 | A | C | 86.2% | 431.5 / 45.5 | 145 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/9); new base C (67/58); total (78/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGG > 173/1‑131 || ccgcatccgacatctaacgCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggat < 1:597331‑M1/92‑41 (MQ=255)ccgcatccgacatccaacgTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggat < 2:16588‑M1/92‑41 (MQ=255)ccgcatccgacatccaacgTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggat < 1:1307640‑M1/92‑41 (MQ=255) cgcatccgacatctaacGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggata < 1:374840‑M1/93‑42 (MQ=255) cgcatccgacatctaacGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggata > 1:1366277‑M1/9‑60 (MQ=255) gcatccgacatctaaCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataa > 1:429336‑M1/8‑59 (MQ=255) gcatccgacatctaaCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataa > 1:59531‑M1/8‑59 (MQ=255) gcatccgacatccaaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataa < 1:50944‑M1/94‑43 (MQ=255) gcatccgaCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCAcat > 2:243210/8‑101 (MQ=255) gcatccgaCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCAcat < 1:1306973/94‑1 (MQ=255) catccgacatctaACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataag < 1:706363‑M1/95‑44 (MQ=255) catccgacatctaACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataag > 2:1701354‑M1/7‑58 (MQ=255) catccgacatctaACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataag < 2:1098797‑M1/95‑44 (MQ=255) catccgacatctaACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataag < 1:152270‑M1/95‑44 (MQ=255) catccgacatccaACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataag > 1:1385401‑M1/7‑58 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataagg > 1:501776‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataagg > 2:788388‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataagg > 2:886949‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataagg > 1:1562459‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataagg > 2:707788‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatctAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataagg > 1:631831‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataagg > 1:1152555‑M1/6‑57 (MQ=255) atccgacatccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataagg > 2:1407147‑M1/6‑57 (MQ=255) ccgacatCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcg > 1:1078607‑M1/4‑55 (MQ=255) cgacaTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcgg > 2:1540420‑M1/3‑54 (MQ=255) cgacaTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcgg > 2:1435195‑M1/3‑54 (MQ=255) gacATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggt > 1:264893‑M1/2‑53 (MQ=255) gacATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggt < 1:1172263‑M1/100‑49 (MQ=255) gacATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggt < 2:957283‑M1/100‑49 (MQ=255) aCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggtt > 2:1446590‑M1/1‑52 (MQ=255) aCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggtt < 2:7773‑M1/101‑50 (MQ=255) aCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggtt > 1:1659466‑M1/1‑52 (MQ=255) aCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggtt < 2:1464262‑M1/101‑50 (MQ=255) aCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggtt > 2:1302019‑M1/1‑52 (MQ=255) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggtt < 2:997255‑M1/101‑50 (MQ=255) cATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctcctccccgtaggttggataaggcggtta < 1:1416048‑M1/101‑51 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttac < 2:1232721‑M1/101‑52 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttac < 2:915805‑M1/101‑52 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttac < 1:881807‑M1/101‑52 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttac < 2:1548528‑M1/101‑52 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttac > 2:1265991‑M1/1‑50 (MQ=255) aTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttac > 1:1232726‑M1/1‑50 (MQ=255) aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttac < 2:1338398‑M1/101‑52 (MQ=255) tccaacgtCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacg > 2:1416042‑M1/4‑49 (MQ=255) tccaacgcCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacg < 2:875184‑M1/98‑53 (MQ=255) tccaacgcCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacg < 1:761505‑M1/98‑53 (MQ=255) tCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacg > 1:741102‑M1/1‑49 (MQ=255) tCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacg > 1:17588‑M1/1‑49 (MQ=255) ccaacgTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgc > 1:1015533‑M1/3‑48 (MQ=255) cTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgc > 2:209807‑M1/1‑48 (MQ=255) tAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgcc < 2:631826‑M1/101‑55 (MQ=255) caacGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgcc > 1:16588‑M1/2‑47 (MQ=255) caacGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgcc < 1:181715‑M1/100‑55 (MQ=255) aCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgc > 2:1072190‑M1/1‑45 (MQ=255) aCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgc > 1:206288‑M1/1‑45 (MQ=255) cgtccgagCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggccgcgtaaggcggttacgccgca > 2:1141430‑M1/4‑44 (MQ=255) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAata < 1:8453/101‑1 (MQ=255) cGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgca > 2:8453‑M1/1‑44 (MQ=255) gtccgaGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcat > 1:790425‑M1/3‑43 (MQ=255) gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcat < 2:839630‑M1/101‑59 (MQ=255) cccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggatacgccgcatc > 1:784511‑M1/1‑42 (MQ=255) cccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagagctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatc > 1:1643375‑M1/1‑42 (MQ=255) cccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatc < 1:387235‑M1/101‑60 (MQ=255) cccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatc < 2:1468091‑M1/101‑60 (MQ=255) cccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatc > 1:338545‑M1/1‑42 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatcc < 1:737581‑M1/101‑61 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatcc < 1:85755‑M1/101‑61 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATcc > 1:620272/1‑101 (MQ=255) caagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccg < 1:943997‑M1/99‑62 (MQ=255) gAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccga > 1:759234‑M1/1‑39 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgac > 1:1300825‑M1/1‑38 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCa > 2:217581/1‑101 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacat < 1:209807‑M1/101‑66 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacat < 2:1166489‑M1/101‑66 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacat > 1:839635‑M1/1‑36 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacat < 2:1650175‑M1/101‑66 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatc > 2:1590649‑M1/1‑35 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatc > 2:1343812‑M1/1‑35 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggttaaggcggttacgccgcatccgacatc > 1:1440888‑M1/1‑35 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatc > 2:1583706‑M1/1‑35 (MQ=255) cGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCAct > 2:419751/1‑101 (MQ=255) cGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCAct > 1:1328399/1‑101 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatct < 2:949637‑M1/101‑68 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcc < 2:759229‑M1/101‑68 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcc < 2:624361‑M1/101‑68 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcc > 2:737576‑M1/1‑34 (MQ=255) ggTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCActt > 1:1616747/1‑101 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctgcaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcta < 2:264893‑M1/101‑69 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttatgccgcatccgacatcta > 1:41989‑M1/1‑33 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcta < 2:564597‑M1/101‑69 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatcta < 2:361177‑M1/101‑69 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatctaac > 2:1021887‑M1/1‑31 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatctaac < 1:608991‑M1/101‑71 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaac < 2:1241047‑M1/101‑71 (MQ=255) tGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCActtctt < 1:1446596/101‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgc > 2:375608‑M1/1‑29 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGgcctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggttggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcc < 2:17588‑M1/101‑74 (MQ=255) cTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCttttt < 2:906719/101‑1 (MQ=255) gATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACACCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGa > 2:760961/1‑101 (MQ=255) aaGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACg > 1:929103/1‑101 (MQ=255) || ‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATAAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCACATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGG > 173/1‑131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |