New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 5 | 1 = | 0 (0.000) | 72 (1.080) | 53/200 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 70 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT > 70/1‑97 | ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATg > 1:611822‑M2/99‑101 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGtt > 2:419059‑M2/97‑101 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGttt > 1:75849‑M2/96‑101 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGttt > 2:12612‑M2/96‑101 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGttt < 2:167931‑M2/6‑1 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGttt < 1:12612‑M2/6‑1 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTc > 2:685037‑M2/95‑101 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCcaca > 1:859699‑M2/88‑101 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACAt > 1:1557‑M2/87‑101 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACAt < 1:1061270‑M2/15‑1 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACAt < 2:1519514‑M2/15‑1 (MQ=255) agtgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACAt < 1:999562‑M2/15‑1 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTc > 2:1060399‑M2/85‑101 (MQ=255) gaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCa < 2:1605250‑M2/18‑1 (MQ=255) gaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCa > 2:1617886‑M2/84‑101 (MQ=255) agaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAAc < 2:851312‑M2/20‑1 (MQ=255) agaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAAc < 1:1163569‑M2/20‑1 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACg > 1:894229‑M2/81‑101 (MQ=255) acgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGcc < 2:1581732‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCga < 1:1402223‑M2/25‑1 (MQ=255) cgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCgag < 1:1579497‑M2/26‑1 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCgaga > 2:1031088‑M2/75‑101 (MQ=255) catcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATag < 1:183055‑M2/31‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgtttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATaga > 2:59781‑M2/70‑101 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATaga < 1:1701236‑M2/32‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATaga < 1:1711169‑M2/32‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATaga > 2:1535790‑M2/70‑101 (MQ=255) tcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATagag < 1:1631163‑M2/33‑1 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAgg < 1:1708379‑M2/34‑1 (MQ=255) tcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGaa < 1:279945‑M2/36‑1 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcatatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAAt < 1:533774‑M2/40‑1 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAAtt < 1:27760‑M2/41‑1 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTaaa < 1:1617892‑M2/44‑1 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAgg < 1:326712‑M2/46‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAgggg > 2:1122889‑M2/54‑101 (MQ=255) aggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGAt < 1:39137‑M2/52‑1 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATaaaa > 2:542989‑M2/46‑101 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATaaaa < 1:1184124‑M2/56‑1 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATc > 1:308064‑M2/44‑101 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATcc > 2:1452701‑M2/43‑101 (MQ=255) cattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATccc > 1:157095‑M2/42‑101 (MQ=255) cattcttcagatggttcaacccttaagttaccgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGACATAAAATccc > 1:1656750‑M2/42‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAATTcccc > 1:149306‑M2/41‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATcccc > 2:246514‑M2/41‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATcccc > 1:161103‑M2/41‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATcccc > 2:1518595‑M2/41‑101 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATccccc > 2:1337784‑M2/40‑101 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATccccc > 2:321050‑M2/40‑101 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCt > 2:753724‑M2/38‑101 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTg > 1:613241‑M2/33‑101 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGt < 2:34216‑M2/71‑1 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGtt < 1:1031093‑M2/72‑1 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGtt < 1:1383592‑M2/72‑1 (MQ=255) gtttaaccgttaacgtagcgcttatgcgATTTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTa < 2:765608‑M2/73‑1 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTa > 2:1596557‑M2/29‑101 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTa < 1:624046‑M2/73‑1 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACt > 2:1651686‑M2/26‑101 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTa > 2:513485‑M2/25‑101 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTaa > 2:1635566‑M2/24‑101 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTAt < 1:87117‑M2/84‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTAt < 1:123461‑M2/84‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATgg > 2:44721‑M2/16‑101 (MQ=255) gcgcttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAAt > 2:1561473‑M2/12‑101 (MQ=255) cttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGt < 1:1430111‑M2/93‑1 (MQ=255) ttatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGtt > 2:246367‑M2/8‑101 (MQ=255) tatgggATGTTTCCCCCACATTCAGCGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTa < 1:693820‑M2/95‑1 (MQ=255) tatgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTa < 1:1029825‑M2/95‑1 (MQ=255) atgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTaa < 1:725506‑M2/96‑1 (MQ=255) atgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTaa < 1:419064‑M2/96‑1 (MQ=255) tgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAat < 2:40653‑M2/97‑1 (MQ=255) tgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAat < 1:456516‑M2/97‑1 (MQ=255) tgggATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAat < 2:982904‑M2/97‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT > 70/1‑97 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |