| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | 46 (0.880) +GTCATCGGGCATTATCTGAACA |
35/156 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 98 | = 17037 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CGCAATCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 98/16937‑17037 | cgcAATCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTa < 2:259513/101‑1 (MQ=255)cgcAATCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTa < 2:832129/101‑1 (MQ=255) gCAATCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAt > 1:1160241‑M2/1‑100 (MQ=255) aTCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgtt < 1:1367692‑M2/101‑5 (MQ=255) cTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcag > 1:847077‑M2/1‑94 (MQ=255) cGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagat < 1:487742‑M2/101‑10 (MQ=255) gACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagata > 1:545178‑M2/1‑91 (MQ=255) gACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagata < 2:474734‑M2/101‑11 (MQ=255) gACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagata < 1:1446269‑M2/101‑11 (MQ=255) aCGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataa < 1:993129‑M2/101‑12 (MQ=255) cGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataat > 2:790365‑M2/1‑89 (MQ=255) cGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataat < 1:844976‑M2/101‑13 (MQ=255) cGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataat < 2:35955‑M2/101‑13 (MQ=255) aTTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcc < 1:459570‑M2/101‑16 (MQ=255) aaTTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccga < 2:1337224‑M2/101‑19 (MQ=255) ttttGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatg > 1:1404197‑M2/1‑81 (MQ=255) ttGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgac > 2:583615‑M2/1‑79 (MQ=255) tGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgact < 2:388418‑M2/101‑24 (MQ=255) tGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgact < 2:462523‑M2/101‑24 (MQ=255) gTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactt < 1:277878‑M2/101‑25 (MQ=255) tttCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgacttt < 1:731738‑M2/101‑26 (MQ=255) tttCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgacttt < 1:81147‑M2/101‑26 (MQ=255) tctcTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgt > 2:1485327‑M2/1‑74 (MQ=255) ctctTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtc > 2:870517‑M2/1‑73 (MQ=255) ctTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGAAGAGGGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 2:123223‑M2/101‑31 (MQ=255) ttCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatg < 1:1183729‑M2/101‑32 (MQ=255) tCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc < 2:1204445‑M2/101‑33 (MQ=255) aCTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag > 1:1554919‑M2/1‑67 (MQ=255) aCTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 2:639734‑M2/101‑35 (MQ=255) tCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct < 1:1111357‑M2/101‑37 (MQ=255) cccTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctc < 1:1066369‑M2/101‑38 (MQ=255) ccTTTCCTGGAAAACAGCAGTGAGGGAGAATGGGCGATCACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgacctggtcctgcagcagc < 2:1590742‑M2/101‑39 (MQ=255) cTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca < 1:1226507‑M2/101‑40 (MQ=255) tttCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:1011130‑M2/101‑41 (MQ=255) tttCCTGGAAAACAGCAGAGACGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 2:1522925‑M2/1‑61 (MQ=255) tCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccg > 1:1258012‑M2/1‑59 (MQ=255) ggAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt > 1:1383910‑M2/1‑55 (MQ=255) gAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 2:388420‑M2/1‑54 (MQ=255) agcagAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 1:947190‑M2/1‑48 (MQ=255) agagagGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac > 2:1446263‑M2/1‑45 (MQ=255) agagGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 2:1439348‑M2/1‑43 (MQ=255) agagGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 1:1362667‑M2/1‑43 (MQ=255) agagGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 1:1349004‑M2/1‑43 (MQ=255) gagGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 2:1158621‑M2/101‑60 (MQ=255) agGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:1264378‑M2/101‑61 (MQ=255) agGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg > 2:1583370‑M2/1‑41 (MQ=255) agGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:681111‑M2/101‑61 (MQ=255) gagaATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact < 1:248145‑M2/101‑64 (MQ=255) gaATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 2:836313‑M2/101‑66 (MQ=255) gaATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc > 1:1579485‑M2/1‑36 (MQ=255) gTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 2:892499‑M2/1‑30 (MQ=255) gTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc < 1:881260‑M2/101‑72 (MQ=255) aCTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 1:1011135‑M2/1‑24 (MQ=255) aCTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 2:762347‑M2/1‑24 (MQ=255) cTCCAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtg > 2:1509628‑M2/1‑23 (MQ=255) ccAATTATTGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcc > 2:81147‑M2/1‑21 (MQ=255) attattGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccagg < 1:1695149‑M2/101‑84 (MQ=255) ttattGATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccacgt > 2:476960‑M2/1‑17 (MQ=255) actgaTAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgaccttgtcatgcaactccaccgattttgagaacgacagtaacttccgtcccagccttgccagatgt > 2:745310‑M2/3‑15 (MQ=255) gATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgaccttgtcatgcaactccaccgattttgagaacgacagtaacttccgtcccagccttgccagatgttgt > 1:613634‑M2/1‑12 (MQ=255) gATAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgaccttgtcatgcaactccaccgattttgagaacgacagtaacttccgtcccagccttgccagatgttgt > 1:251163‑M2/1‑12 (MQ=255) tAGTGTTTTAtgttcagataatgcccgatgaccttgtcatgcaactccaccgattttgagaacgacagtaacttccgtcccagccttgccagatgttgtct > 2:1045711‑M2/1‑10 (MQ=255) atgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggcgctgcctcagatttag < 2:1610068‑M2/101‑101 (MQ=255) | CGCAATCCTCGACGGATTAATTTTGTTTCTCTTCACTCCCTTTCCTGGAAAACAGCAGAGAGGGAGAATGGGTAATGACTCCAATTATTGATAGTGTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 98/16937‑17037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |