New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 222 | = 1443 | 0 (0.000) | 64 (0.970) | 48/198 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 81 | 9928 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GGCCAGGTGCAGGAATATGACATCAGCACCGCCTCGATGCCATACCTTACTCGCCCAGGCCAGGTTCGTTATAAAGTCATGATGGGACGTCCGCAAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGATAA > 81/9832‑10028 | aattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTg < 2:878050‑M2/5‑1 (MQ=255) attagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTgg > 2:804899‑M2/96‑101 (MQ=255) ttagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTggg < 1:1061714‑M2/7‑1 (MQ=255) tagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacagagnnnnt < 2:7620‑M2/8‑6 (MQ=255) agcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGc < 2:145021‑M2/9‑1 (MQ=255) gcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGcc < 1:956307‑M2/10‑1 (MQ=255) gcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGcc > 2:1597352‑M2/92‑101 (MQ=255) cctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGcca > 2:1638328‑M2/91‑101 (MQ=255) ctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGccac > 1:939168‑M2/90‑101 (MQ=255) ctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGccac > 2:396305‑M2/90‑101 (MQ=255) ctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGccac < 1:729903‑M2/12‑1 (MQ=255) aattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATg < 1:1231174‑M2/16‑1 (MQ=255) ttaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTc < 1:1546565‑M2/18‑1 (MQ=255) taaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCAtgttc < 2:1023410‑M2/19‑3 (MQ=255) taaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCg > 2:357262‑M2/83‑101 (MQ=255) taaaaggactgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCg < 2:1250797‑M2/19‑1 (MQ=255) aaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGa > 1:677060‑M2/82‑101 (MQ=255) aaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGa > 1:461595‑M2/82‑101 (MQ=255) aaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttgggggcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGa > 1:1169707‑M2/82‑101 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAg < 2:460819‑M2/21‑1 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAg < 1:358497‑M2/21‑1 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAg < 1:657794‑M2/21‑1 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAg > 1:1336601‑M2/81‑101 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAg < 1:786759‑M2/21‑1 (MQ=255) ctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGa < 1:1459279‑M2/27‑1 (MQ=255) ctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGa > 2:269013‑M2/75‑101 (MQ=255) gactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGAtt > 2:475232‑M2/73‑101 (MQ=255) actccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGAttt < 2:1072394‑M2/30‑1 (MQ=255) actccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGAttt < 2:560163‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTtc > 1:1020949‑M2/69‑101 (MQ=255) attgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtctgtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTctct > 2:1321588‑M2/66‑101 (MQ=255) gaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGt < 2:1624408‑M2/39‑1 (MQ=255) aatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTg < 2:1642925‑M2/40‑1 (MQ=255) ggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAg < 2:23606‑M2/46‑1 (MQ=255) ggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAg < 1:955126‑M2/46‑1 (MQ=255) gaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGc > 2:1382146‑M2/55‑101 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggttagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGcct > 2:1257608‑M2/53‑101 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGcct < 1:368154‑M2/49‑1 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGcct < 2:414825‑M2/49‑1 (MQ=255) cagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGcctcc < 2:1365954‑M2/51‑1 (MQ=255) atgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATc < 1:1620247‑M2/60‑1 (MQ=255) gcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGc > 1:362995‑M2/40‑101 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCt > 2:206268‑M2/39‑101 (MQ=255) ctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTa > 2:618962‑M2/38‑101 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACg > 1:915288‑M2/35‑101 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGt > 1:1038338‑M2/33‑101 (MQ=255) gtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGt > 1:601737‑M2/33‑101 (MQ=255) tttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGtt > 2:281134‑M2/32‑101 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTg < 2:844421‑M2/71‑1 (MQ=255) ttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTg > 2:354076‑M2/31‑101 (MQ=255) ctgtccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCg < 1:597040‑M2/75‑1 (MQ=255) tccaactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCta > 1:1368386‑M2/24‑101 (MQ=255) aactttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTatat < 2:1224653‑M2/81‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATggc > 1:55026‑M2/18‑101 (MQ=255) tttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATggc < 2:1043435‑M2/84‑1 (MQ=255) tttttggggtcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATggc > 2:1682170‑M2/18‑101 (MQ=255) ttagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTg < 1:1257613‑M2/93‑1 (MQ=255) gcagtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTg < 2:1623752‑M2/93‑1 (MQ=255) tgtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTggg < 1:1321594‑M2/95‑1 (MQ=255) agtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTggg > 2:611128‑M2/7‑101 (MQ=255) agtacaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTggg < 1:797318‑M2/95‑1 (MQ=255) acaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGgaga < 2:126480‑M2/98‑1 (MQ=255) acaGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGgaga < 1:1577727‑M2/98‑1 (MQ=255) caGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGAt < 1:649133‑M2/99‑1 (MQ=255) gagTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGATaa < 2:162335/101‑1 (MQ=255) gagTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGATaa > 2:1501452/1‑101 (MQ=255) | GGCCAGGTGCAGGAATATGACATCAGCACCGCCTCGATGCCATACCTTACTCGCCCAGGCCAGGTTCGTTATAAAGTCATGATGGGACGTCCGCAAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGATAA > 81/9832‑10028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |