| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 219 | 1 = | 0 (0.000) | 328 (4.920) | 140/200 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 225 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA > 225/1‑101 | gggtgaagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatg < 1:1697507‑M2/1‑1 (MQ=255)gggtgaagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatg < 2:332728‑M2/1‑1 (MQ=255)gggtgaagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatg < 2:1312894‑M2/1‑1 (MQ=255) gtgaagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGaa > 1:1313828‑M2/99‑101 (MQ=255) gtgaagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGaa > 1:1550224‑M2/99‑101 (MQ=255) aagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAAt < 1:551392‑M2/6‑1 (MQ=255) aagtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAAt < 1:241146‑M2/6‑1 (MQ=255) agtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATg > 2:905282‑M2/95‑101 (MQ=255) agtcgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATg < 1:438971‑M2/7‑1 (MQ=255) cgtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGc < 1:113182‑M2/10‑1 (MQ=255) gtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCa > 1:402013‑M2/91‑101 (MQ=255) gtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCa < 2:103447‑M2/11‑1 (MQ=255) gtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCa > 1:880344‑M2/91‑101 (MQ=255) gtaacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagcgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCa < 1:1468691‑M2/11‑1 (MQ=255) taacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAg > 1:1230172‑M2/90‑101 (MQ=255) aacaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGt > 1:329118‑M2/89‑101 (MQ=255) acaaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTa < 2:88123‑M2/14‑1 (MQ=255) caaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaa > 2:245346‑M2/87‑101 (MQ=255) caaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaa < 1:864179‑M2/15‑1 (MQ=255) aaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaaa < 1:96803‑M2/16‑1 (MQ=255) aaggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaaa > 1:266475‑M2/86‑101 (MQ=255) aggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaaaa > 1:343700‑M2/85‑101 (MQ=255) aggtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTaaaa > 2:1406228‑M2/85‑101 (MQ=255) gtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCTGTAAAAcc < 1:808888‑M2/19‑1 (MQ=255) gtaaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAAcc > 1:995477‑M2/83‑101 (MQ=255) taaccgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACct < 1:519409‑M2/20‑1 (MQ=255) accgtaggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACctct < 2:866891‑M2/22‑1 (MQ=255) taggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAg > 1:1163572‑M2/76‑101 (MQ=255) taggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAg < 1:1619956‑M2/26‑1 (MQ=255) ggggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGc > 1:607180‑M2/74‑101 (MQ=255) gggaacctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCt < 2:1091377‑M2/29‑1 (MQ=255) acctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgttctttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTTTa > 2:1614736‑M2/69‑101 (MQ=255) ctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc > 2:1425616‑M2/67‑101 (MQ=255) ctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc > 2:740082‑M2/67‑101 (MQ=255) ctgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc > 2:1633303‑M2/67‑101 (MQ=255) tgcggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCt < 1:1209317‑M2/36‑1 (MQ=255) cggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCa > 2:1525395‑M2/64‑101 (MQ=255) ggttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAg < 1:688434‑M2/39‑1 (MQ=255) gttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAgg > 1:221728‑M2/62‑101 (MQ=255) gttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAgg > 2:105840‑M2/62‑101 (MQ=255) ttggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAggt < 2:350506‑M2/41‑1 (MQ=255) gtggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAggt < 1:1709796‑M2/41‑1 (MQ=255) ggatcacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAggtgg < 2:483258‑M2/43‑1 (MQ=255) cacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTag < 2:549952‑M2/47‑1 (MQ=255) cacctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTag < 1:1512599‑M2/47‑1 (MQ=255) acctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTaga < 1:1252759‑M2/48‑1 (MQ=255) ctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAgc < 2:402008‑M2/50‑1 (MQ=255) ctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAgc > 2:455287‑M2/52‑101 (MQ=255) ctccttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAgc < 1:291419‑M2/50‑1 (MQ=255) tccttaccttaaagaatcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAgcg > 1:1262765‑M2/51‑101 (MQ=255) cttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCa > 1:1199611‑M2/49‑101 (MQ=255) cttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCa > 1:847644‑M2/49‑101 (MQ=255) cttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCa > 2:376466‑M2/49‑101 (MQ=255) ttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCAc > 1:1336161‑M2/48‑101 (MQ=255) ttaccttaaagaagcgtactttgcagtgctcacacagattgtctgatGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCAc > 2:1188821‑M2/48‑101 (MQ=255) 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atGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCTCCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAc < 1:546357‑M2/99‑1 (MQ=255) atGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAc > 1:1381659‑M2/3‑101 (MQ=255) atGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAc > 2:299686‑M2/3‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA > 225/1‑101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |