New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 206 | 1 = | 0 (0.000) | 45 (0.790) +TGCGGATACCGCCG |
38/172 | 0.8 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 62 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTAT > 62/1‑100 | aaactggtggggcataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgc > 1:731800‑M2/101‑101 (MQ=255) ctggtggggcataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGt < 1:1451357‑M2/4‑1 (MQ=255) tggggcataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgccgtttgc > 2:652267‑M2/94‑98 (MQ=255) ggggcataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCg > 2:672644‑M2/93‑101 (MQ=255) ataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctctgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcgggtaccgccgCCGTTGCCgctctc > 1:514338‑M2/88‑100 (MQ=255) ataaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcttttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCgttctt > 2:788226‑M2/88‑100 (MQ=255) aaaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACt > 1:314792‑M2/86‑101 (MQ=255) aaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCtaccg > 1:930624‑M2/85‑99 (MQ=255) aaccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGGTGCCGCTCTAATg > 1:1020637‑M2/85‑101 (MQ=255) ccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGt > 1:1322391‑M2/83‑101 (MQ=255) ccaggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGt < 1:538881‑M2/19‑1 (MQ=255) aggcgggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGc > 1:315437‑M2/81‑101 (MQ=255) gggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCCCTCTACTGGTGCCgat > 2:1589288‑M2/77‑101 (MQ=255) gggctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGGTGCCGCTCTACTGGTGCCgat > 1:958540‑M2/77‑101 (MQ=255) ctgggctgcgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCggtgat > 2:1051539‑M2/74‑101 (MQ=255) ctgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCgatgat < 2:1518723‑M2/28‑1 (MQ=255) tgggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGatgatg < 1:672649‑M2/29‑1 (MQ=255) gggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgc < 2:840898‑M2/30‑1 (MQ=255) gggctacgtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgc < 2:660728‑M2/30‑1 (MQ=255) gtcggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGCTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAgcgc > 1:94892‑M2/65‑101 (MQ=255) ggcgtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCaa > 2:259678‑M2/62‑101 (MQ=255) gtgctggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTa > 2:342915‑M2/59‑101 (MQ=255) gctgccagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATc < 1:692109‑M2/45‑1 (MQ=255) tggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccggcgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCCGCGCCAACTATCCg > 2:316261‑M2/55‑101 (MQ=255) tggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCg < 2:743776‑M2/47‑1 (MQ=255) tggcagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCg > 1:1385263‑M2/55‑101 (MQ=255) cagctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGAACCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTc > 2:1301118‑M2/52‑101 (MQ=255) agctatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCa > 2:898262‑M2/51‑101 (MQ=255) tatgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAAcc > 1:1428373‑M2/48‑101 (MQ=255) atgattatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCg > 2:623349‑M2/47‑101 (MQ=255) attatggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGggc > 1:1052152‑M2/44‑101 (MQ=255) ggcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGcggcgg < 2:39144‑M2/63‑1 (MQ=255) gcgagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCggg > 1:680344‑M2/38‑101 (MQ=255) cgagcctttctggttctgccgtggcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCgggg < 2:731795‑M2/65‑1 (MQ=255) gagcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGc > 2:1274820‑M2/36‑101 (MQ=255) agcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCt < 2:1473216‑M2/67‑1 (MQ=255) agcctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCt > 1:1617594‑M2/35‑101 (MQ=255) ctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGAt > 2:1361168‑M2/32‑101 (MQ=255) ctttctggttctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGAt > 1:1189753‑M2/32‑101 (MQ=255) tctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTgg < 2:930619‑M2/79‑1 (MQ=255) ctgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTggc > 2:326913‑M2/22‑101 (MQ=255) tgccgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTggcg > 2:1408093‑M2/21‑101 (MQ=255) cgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCa > 2:1079204‑M2/18‑101 (MQ=255) cgttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCa > 2:494199‑M2/18‑101 (MQ=255) gttgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCAt > 1:1180837‑M2/17‑101 (MQ=255) tgcggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTa < 2:796233‑M2/87‑1 (MQ=255) cggataccgccgCCGCTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCACTATc > 2:195060‑M2/13‑101 (MQ=255) ggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATcg > 1:904425‑M2/12‑101 (MQ=255) ggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATcg > 2:555952‑M2/12‑101 (MQ=255) ggataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATcg < 2:94892‑M2/90‑1 (MQ=255) gataccgccgCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATcgc > 2:611852‑M2/11‑101 (MQ=255) gCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAattat > 2:136012‑M2/2‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTAT > 62/1‑100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |