New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 197 | 1 = | 0 (0.000) | 66 (1.000) | 57/198 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 202 | = 4398 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
ATCTGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑A > 202/4301‑4399 | aTCTGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCAAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagc < 2:1199231‑M2/101‑4 (MQ=255) tCTGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagcc > 2:726560‑M2/1‑97 (MQ=255) cTGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCAGTCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccg > 2:865366‑M2/1‑96 (MQ=255) tGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgc < 1:87902‑M2/101‑7 (MQ=255) aTGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctac > 2:98124‑M2/1‑92 (MQ=255) cTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccac < 2:131831‑M2/101‑13 (MQ=255) cTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccac < 1:978643‑M2/101‑13 (MQ=255) tcatcaTGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCCCCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccacc > 2:473610‑M2/1‑88 (MQ=255) catcatGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccg < 2:612742‑M2/101‑15 (MQ=255) catGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgctt > 2:271560‑M2/1‑84 (MQ=255) atGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttc < 1:369452‑M2/101‑19 (MQ=255) ccGAAATTTCGGGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcaca > 2:1098377‑M2/1‑80 (MQ=255) gAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaac > 2:445255‑M2/1‑78 (MQ=255) ttCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaa < 1:1450508‑M2/101‑29 (MQ=255) cGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaat > 1:1023229‑M2/1‑71 (MQ=255) aGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGTACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattg < 2:1591928‑M2/101‑33 (MQ=255) aGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattg > 1:1234900‑M2/1‑69 (MQ=255) tttCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcc < 1:864279‑M2/101‑35 (MQ=255) ttCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcct < 2:452626‑M2/101‑36 (MQ=255) cTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctcc > 2:1306065‑M2/1‑64 (MQ=255) tttatttaGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccg < 2:838394‑M2/101‑39 (MQ=255) ttatttaGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccgg < 2:111132‑M2/101‑40 (MQ=255) tatttaGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggt > 1:160750‑M2/1‑61 (MQ=255) tttaGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtag < 1:928566‑M2/101‑43 (MQ=255) tttaGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtag > 2:1231939‑M2/1‑59 (MQ=255) tttaGCCCGGCCATGATGCTGGCTGTGCCTTTGGCACCGCAGGCCGTTGGGAAAACCGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtag > 2:900879‑M2/1‑59 (MQ=255) cTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgat < 2:1312436‑M2/101‑49 (MQ=255) cTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgat < 1:11550‑M2/101‑49 (MQ=255) tGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatg < 1:763525‑M2/101‑50 (MQ=255) tGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatg < 1:938223‑M2/101‑50 (MQ=255) cccTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgatt < 2:472756‑M2/101‑53 (MQ=255) ccTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCaggcgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggaagcgcgatgattg < 2:1277589‑M2/101‑54 (MQ=255) ccTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattg < 1:462372‑M2/101‑54 (MQ=255) aTGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttga < 2:1111223‑M2/101‑58 (MQ=255) tggctgTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctg > 1:1185875‑M2/1‑40 (MQ=255) ggctgTGCCTTTTGCACGGCAGGCCGTTGCGAAATCGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctga > 2:117835‑M2/1‑39 (MQ=255) ctgTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaat > 2:925606‑M2/1‑37 (MQ=255) ctgTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaat > 1:434435‑M2/1‑37 (MQ=255) tgtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaata > 1:131831‑M2/1‑36 (MQ=255) tgtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaata < 1:1049992‑M2/101‑66 (MQ=255) gtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaatac < 2:1028742‑M2/101‑67 (MQ=255) gtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaatac < 1:1688500‑M2/101‑67 (MQ=255) gtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaatac > 1:636935‑M2/1‑35 (MQ=255) gtgCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcatccggtagcgcgatgattgttgatctgaatac < 1:564048‑M2/101‑67 (MQ=255) gCCTTTTGCGCCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaatacca > 2:941333‑M2/1‑33 (MQ=255) gCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaatacca < 1:119791‑M2/101‑69 (MQ=255) cTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaac < 1:1168595‑M2/101‑71 (MQ=255) cTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaac < 1:408162‑M2/101‑71 (MQ=255) cTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaac > 2:524526‑M2/1‑31 (MQ=255) tttGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccacctcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaa < 1:108100‑M2/101‑73 (MQ=255) gCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagt > 1:1708626‑M2/1‑26 (MQ=255) cACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtg < 2:460910‑M2/101‑77 (MQ=255) aCCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtga < 1:1146208‑M2/101‑78 (MQ=255) ccGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgat > 1:528334‑M2/1‑23 (MQ=255) cGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatc < 1:951230‑M2/101‑80 (MQ=255) cGCAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatc > 2:564043‑M2/1‑22 (MQ=255) cAGGCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatcta > 1:111132‑M2/1‑20 (MQ=255) ggCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctatt > 1:612747‑M2/1‑18 (MQ=255) gCCGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattc < 2:1231035‑M2/101‑85 (MQ=255) ccGTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcg > 1:1602550‑M2/1‑16 (MQ=255) gTTGCGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaa < 2:93856‑M2/101‑88 (MQ=255) cGAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaaccac < 2:1151658‑M2/101‑92 (MQ=255) gAAAACGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaaccacc < 1:1371610‑M2/101‑93 (MQ=255) aaaaCGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaaccaccc > 2:1228141‑M2/1‑8 (MQ=255) aaCGGCagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaaccacccgg < 1:111884‑M2/101‑96 (MQ=255) cagccgctaccaccgcttcacaaccggaaattgcctccggtagcgcgatgattgttgatctgaataccaacaaagtgatctattcgaaccacccggatctg > 2:709861‑M2/1‑1 (MQ=255) | ATCTGAATGCTCATCATGCCGAAATTTCGAGTTTCTTTATTTAGCCTGGCCCTGATGCTGGCTGTGCCTTTTGCACCGCAGGCCGTTGCGAAAACGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑A > 202/4301‑4399 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |