| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 186 | = 6614 | 0 (0.000) | 40 (0.650) | 27/186 | 2.5 | 72.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 211 | 2681 = | 30 (0.480) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GTTTGTTGGGTCTCGCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 211/2583‑2719 | tctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGa < 2:1098007‑M2/3‑1 (MQ=255)tctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGa > 1:1180229‑M2/99‑101 (MQ=255)tctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGa > 1:360727‑M2/99‑101 (MQ=255)nctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGa > 1:535656‑M2/99‑101 (MQ=255) tttGTTGGCTCTCGCTCCATTTCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGAt < 1:442662/101‑1 (MQ=255) ctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGAt > 1:293256‑M2/98‑101 (MQ=255) ctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGAt < 2:481873‑M2/4‑1 (MQ=255) ctcatcagctacagaatggataagatcactttcggggaataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGAt > 1:1495217‑M2/98‑101 (MQ=255) tgttgGGTCTCGCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATaa < 1:365527/101‑1 (MQ=255) catcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATaa > 2:1329945‑M2/96‑101 (MQ=255) atcagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccatgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATaaa > 1:714729‑M2/95‑101 (MQ=255) ttgGGTCTCGCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATaaaa < 1:1510766/101‑1 (MQ=255) cagctacagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATaaaaa > 2:1607850‑M2/93‑101 (MQ=255) 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cagaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCAt < 2:525764‑M2/15‑1 (MQ=255) gaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATcc < 2:1677298‑M2/17‑1 (MQ=255) gaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATcc > 1:92755‑M2/85‑101 (MQ=255) gaatggataagatcactttcggggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATcc < 2:402900‑M2/17‑1 (MQ=255) gCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATcc > 2:988267/1‑101 (MQ=255) gCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATcc < 2:269633/101‑1 (MQ=255) gCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATcc > 1:1326525/1‑101 (MQ=255) 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aaGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATc > 2:1545034/1‑101 (MQ=255) ggtataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATcc < 1:401661‑M2/39‑1 (MQ=255) aGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATcc < 2:424404/101‑1 (MQ=255) gtataaatttatatcaaccaacccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGAtcct < 2:595178‑M2/40‑2 (MQ=255) ataaatttatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGgatcctga > 1:849301‑M2/60‑98 (MQ=255) tCCATATTTTGCTGCCAGACCCATTGAATCTATATACTGAACCCGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATcctgag < 2:222029/101‑5 (MQ=38) tCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATcctgag > 1:1273861/1‑97 (MQ=255) 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tatatcaaccaaaccttgcggatctacatttatgaccggattcaacggatacTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCccaatcggatcctgactgataa > 1:1690256‑M2/53‑91 (MQ=255) | GTTTGTTGGGTCTCGCTCCATATCCGCCATTATTTAAGTGTCCATATTTTGATGCCAGTCCCATTGAATCTATATACTGAACCGGATTCAGCGGATACTGATAAAAATTCCATCCCCCCTTCAGCCCAATCGGATCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 211/2583‑2719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |