| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 165 | = 8501 | 0 (0.000) | 58 (0.890) +CT |
50/196 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 210 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTTC > 210/1‑101 | gttttactcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctgg > 1:1096938‑M2/100‑101 (MQ=255) ttttactcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctggt < 2:416891‑M2/3‑1 (MQ=255) tttactcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctggtg < 2:1417507‑M2/4‑1 (MQ=255) tactcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctggtggt < 2:635031‑M2/6‑1 (MQ=255) tactcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctggtggt > 2:1128781‑M2/96‑101 (MQ=255) tactcgcccgtggacgctggcggcggggattttcctgacgctcggcgttgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctggtggg > 1:124883‑M2/96‑100 (MQ=255) ctcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTc > 1:458634‑M2/94‑101 (MQ=255) tcgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCt > 1:1340282‑M2/93‑101 (MQ=255) cgcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTg < 1:1184175‑M2/10‑1 (MQ=255) gcccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTgg < 1:1067186‑M2/11‑1 (MQ=255) cccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTggg < 2:666486‑M2/12‑1 (MQ=255) cccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggcgGGTGGTTCTggg > 1:1562426‑M2/90‑101 (MQ=255) ccgtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGa < 2:103071‑M2/13‑1 (MQ=255) gtggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATc > 2:156369‑M2/87‑101 (MQ=255) tggacgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGGGGTTCTGGGATcc > 2:794606‑M2/86‑101 (MQ=255) cgctggcggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTa < 2:1249485‑M2/20‑1 (MQ=255) cggcgtggattttcctgacgcttggcattgtgctcggttccgcatgggcctatttcgaactcggctggggcggctGGTTGTTCTGGGCTCCGGTAGAAAAc < 2:173287‑M2/26‑1 (MQ=255) cggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAc < 1:303510‑M2/26‑1 (MQ=255) cggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAc < 2:330268‑M2/26‑1 (MQ=255) cggcgtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGGGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAAc > 2:667285‑M2/76‑101 (MQ=255) gtggattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCt < 1:1341621‑M2/30‑1 (MQ=255) gattttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGt > 1:19333‑M2/69‑101 (MQ=255) ttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAt < 2:1096933‑M2/37‑1 (MQ=255) ttcctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAt < 1:1139689‑M2/37‑1 (MQ=255) ttcccgacgcgcggtattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGACCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTAt < 2:688283‑M2/37‑1 (MQ=255) ctgacgctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGcc > 2:979878‑M2/62‑101 (MQ=255) ctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCTGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCt < 2:1041437‑M2/46‑1 (MQ=255) ctcggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCt < 2:1190187‑M2/46‑1 (MQ=255) cggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCtgg < 2:945007‑M2/48‑1 (MQ=255) cggcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCtgg > 2:765052‑M2/54‑101 (MQ=255) gcattgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCtggtg < 2:1112922‑M2/50‑1 (MQ=255) ttgtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTgggg < 1:618249‑M2/53‑1 (MQ=255) gtgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGAc < 1:1093852‑M2/55‑1 (MQ=255) tgctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACt < 1:667290‑M2/56‑1 (MQ=255) gctcggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTg < 2:458629‑M2/57‑1 (MQ=255) ggttccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCt > 1:353162‑M2/41‑101 (MQ=255) ccgcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGGGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATg > 1:793697‑M2/37‑101 (MQ=255) gcatgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGca > 1:1671321‑M2/35‑101 (MQ=255) atgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGcact < 2:45198‑M2/69‑1 (MQ=255) atgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGcact > 2:409948‑M2/33‑101 (MQ=255) atgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGcact > 1:836993‑M2/33‑101 (MQ=255) tgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGcactc < 2:1340276‑M2/70‑1 (MQ=255) tgggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGcactc > 1:1703626‑M2/32‑101 (MQ=255) tgggcctattacgaactcggctggggcggccGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAGAACGCCTCGTTTAAGCCGTGGCTGGGGGGGACTGCGCTGATGcactc > 1:1395340‑M2/32‑101 (MQ=255) gggcctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATgcactcc > 2:18507‑M2/31‑100 (MQ=255) ctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTgg < 2:923832‑M2/75‑1 (MQ=255) ctattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCCCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGGCTGCGCTGATGCACTCACTgg > 2:1611444‑M2/27‑101 (MQ=255) tattacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGc < 1:781934‑M2/76‑1 (MQ=255) tacgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGt < 1:990447‑M2/79‑1 (MQ=255) acgaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTc < 1:689862‑M2/80‑1 (MQ=255) gaactcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCAc < 1:456266‑M2/82‑1 (MQ=255) ctcggctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGa > 2:1557390‑M2/17‑101 (MQ=255) ctggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGaacaac < 1:794611‑M2/90‑1 (MQ=255) tggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAAcg < 1:1288299‑M2/91‑1 (MQ=255) ggggcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAAcgc > 2:48235‑M2/10‑101 (MQ=255) gcggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGcc < 2:319650‑M2/95‑1 (MQ=255) cggctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCa > 2:814057‑M2/6‑101 (MQ=255) gctGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGt > 2:416800‑M2/4‑101 (MQ=255) tGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGttt > 1:358966‑M2/2‑101 (MQ=255) ggtggtTCTGGGATCCGGTAGAAAACTCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTTc < 1:969507/101‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAACGCCTCGTTTATGCCGTGGCTGGTGGGGACTGCGCTGATGCACTCACTGGCGGTCACTGAACAACGCGCCAGTTTC > 210/1‑101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |