| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 16 | 47371 = | 52 (0.780) | 58 (0.870) | 54/200 | 0.3 | 52.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 16 | = 47452 | 53 (0.800) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTGGAGTATCACGAAGTGCTTTCCGCCGCCTTCGGTCATCAGGT > 16/47353‑47552 | aGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATg > 1:990602‑M2/1‑100 (MQ=255)aGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATg > 1:164831‑M2/1‑100 (MQ=255)aGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATg > 1:258075‑M2/1‑100 (MQ=255) gTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATga < 1:930006‑M2/101‑3 (MQ=255) accggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAAtctc > 1:414395‑M1/17‑101 (MQ=255) gCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagat > 2:136168‑M2/1‑96 (MQ=255) cggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTg > 2:1656770‑M1/15‑101 (MQ=255) ggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGc < 1:1686888‑M1/88‑1 (MQ=255) ggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGc > 2:120091‑M1/14‑101 (MQ=255) aaaGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatgg > 2:203285‑M2/1‑94 (MQ=255) ttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGCGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCtt < 1:265107‑M1/90‑1 (MQ=255) gtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCg > 2:1714360‑M1/10‑101 (MQ=255) gtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCg < 1:1260172‑M1/92‑1 (MQ=255) tacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGt > 2:1677056‑M1/9‑101 (MQ=255) ccGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccga < 2:1009226‑M2/101‑12 (MQ=255) ggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCa < 2:180979‑M1/96‑1 (MQ=255) tGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGc < 1:1085242‑M1/100‑1 (MQ=255) tGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGc < 1:457689‑M1/100‑1 (MQ=255) agaTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttac < 1:70178‑M2/101‑21 (MQ=255) agaTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttac > 2:1439579‑M2/1‑81 (MQ=255) agaTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCAt < 1:921826/101‑1 (MQ=255) gaTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttact > 1:1503010‑M2/1‑80 (MQ=255) atgtatgAATCCGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATcc < 2:1463917/95‑1 (MQ=255) aTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttacta < 1:1459427‑M2/101‑23 (MQ=255) aTGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATcc < 2:629155/101‑1 (MQ=255) tGTCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaa > 1:229646‑M2/1‑78 (MQ=255) ggCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCaa < 2:401006/101‑1 (MQ=255) gCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAAc > 2:473728/1‑101 (MQ=255) ccGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcgggtactaaaca < 2:1322413‑M2/101‑27 (MQ=255) cGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccg > 1:1170888‑M2/1‑74 (MQ=255) cGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccg < 2:873176‑M2/101‑28 (MQ=255) cGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACgg > 1:1357492/1‑101 (MQ=255) gAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGt > 1:1282698/1‑101 (MQ=255) aaTCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgca < 1:1413901‑M2/101‑30 (MQ=255) aTCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAg < 2:58913/101‑1 (MQ=255) ccgatcttgaaCCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGa < 2:884355/92‑1 (MQ=255) cGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGaa < 1:829138/101‑1 (MQ=255) ggTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGaaa > 2:1063531/1‑101 (MQ=255) gTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtc < 2:431012‑M2/101‑35 (MQ=255) ttACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtcc < 1:1174336‑M2/101‑36 (MQ=255) ttACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAAc < 1:853165/101‑1 (MQ=255) aCTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgc < 1:1196136‑M2/101‑38 (MQ=255) tgaaCCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGaagatcgg > 1:884360/3‑95 (MQ=255) cTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagggtccgcg < 2:829133‑M2/101‑39 (MQ=255) tAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCg < 2:1522540/101‑1 (MQ=255) tAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCg > 1:1133085/1‑101 (MQ=255) aCCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTa < 1:1457894/101‑1 (MQ=255) cGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTg < 1:1642608/101‑1 (MQ=255) 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cGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGAc < 2:1260167/101‑1 (MQ=255) gTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggat < 1:517989‑M2/101‑51 (MQ=255) tCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggatt > 1:633442‑M2/1‑50 (MQ=255) ccGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattg > 1:1131842‑M2/1‑49 (MQ=255) gCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggc > 1:1481031‑M2/1‑47 (MQ=255) ccAGTTATCTGGATTGGCGCGGAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcg > 2:231969‑M2/1‑46 (MQ=255) ccAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcg < 2:140255‑M2/101‑56 (MQ=255) ccAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcg < 2:618579‑M2/101‑56 (MQ=255) aGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcg > 2:156796‑M2/1‑44 (MQ=255) aGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTAtctctc > 1:444557/1‑101 (MQ=255) aGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTAtctctc > 2:1134712/1‑101 (MQ=255) ttATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTg > 1:635053/1‑101 (MQ=255) ttATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTg > 2:1041924/1‑101 (MQ=255) tATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTgg < 1:23823/101‑1 (MQ=255) 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aCCGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctc > 1:414395‑M2/1‑16 (MQ=255) aCCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTGGAGTATCACGAAGTGCTTTCcgccgc > 1:130886/1‑101 (MQ=255) ccGGTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctct > 2:662053‑M2/1‑15 (MQ=255) ggTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctctgc < 1:1686888‑M2/101‑89 (MQ=255) ggTTGTACGGAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctctgc > 2:120091‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTGGAGTATCACGAAGTGCTTTCCGCCGCCTTCg < 1:1560384/101‑1 (MQ=255) tGTACGGCATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGAAGAAAACCTCGTACTTGAGACTATCTCTCTGCAGTATCACGACATGCTTTCCGCCGCACTCgg > 2:627214/1‑101 (MQ=255) 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ggAATgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctctgcttcgtgca < 2:180979‑M2/101‑97 (MQ=255) aaTCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTGGAGTATCACGAAGTGCTTTCCGCCGCCTTCGGTCATCAg > 1:1451579/1‑101 (MQ=255) tgagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatctctgcttcgtgcaacgc < 1:1085242‑M2/101‑101 (MQ=255) | AGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGCATCCAACGGTAGAAAACCTCGTACTGGAGACTATCTCTCTGGAGTATCACGAAGTGCTTTCCGCCGCCTTCGGTCATCAGGT > 16/47353‑47552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |