| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 158 | 1340 = | 83 (1.250) | 126 (2.150) | 71/176 | 0.0 | 77.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 9 | 13 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCGTTCCGCCACCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCTTAGCG > 9/1‑112 | agaattcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGc < 2:1643396‑M2/14‑1 (MQ=255)agaattcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGc > 1:1453513‑M2/88‑101 (MQ=255) gaattcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCg < 2:387588‑M2/15‑1 (MQ=255) gaattcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCg > 2:263059‑M2/87‑101 (MQ=255) attcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTa > 2:344125‑M2/85‑101 (MQ=255) ttcggtggagcggtagttcagtcggttagaatccctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAg < 2:316011‑M2/18‑1 (MQ=255) ttcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAg < 2:1716643‑M2/18‑1 (MQ=255) ttcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAg < 1:711984‑M2/18‑1 (MQ=255) ttcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAg < 1:535542‑M2/18‑1 (MQ=255) ttcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAg < 1:771679‑M2/18‑1 (MQ=255) tcggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGt < 2:1391662‑M2/19‑1 (MQ=255) ggtggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTc < 1:629499‑M2/21‑1 (MQ=255) tggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCaa < 1:52888‑M2/23‑1 (MQ=255) tggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCaa > 2:1229070‑M2/79‑101 (MQ=255) ggagcggtagttcagtcggttagactacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAAt < 1:88257‑M2/24‑1 (MQ=255) ggagcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAAt < 2:226641‑M2/24‑1 (MQ=255) gcggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTgg < 1:702133‑M2/27‑1 (MQ=255) cggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGt > 1:1667430‑M2/74‑101 (MQ=255) ggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTa > 1:1650724‑M2/73‑101 (MQ=255) ggtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTa > 1:1128636‑M2/73‑101 (MQ=255) gtagttcagtcggttagaattcctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtcctttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTag < 2:184237‑M2/30‑1 (MQ=255) gtagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTag > 1:1070828‑M2/72‑101 (MQ=255) tagttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATAGGTaga < 1:964828‑M2/31‑1 (MQ=255) agttcagtcggttagaataccttcctgtcacgcggggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTagag > 2:1025577‑M2/70‑101 (MQ=255) gttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGc < 1:622994‑M2/33‑1 (MQ=255) gttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGCAGAGc < 2:1719620‑M2/33‑1 (MQ=255) ttcagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCa > 2:1699737‑M2/68‑101 (MQ=255) cagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCAcc > 1:961221‑M2/66‑101 (MQ=255) cagtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCAcc > 2:768248‑M2/66‑101 (MQ=255) agtcggttagaatccctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCg < 1:1546110‑M2/37‑1 (MQ=255) agtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCg < 1:1261611‑M2/37‑1 (MQ=255) agtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCg > 1:1709979‑M2/65‑101 (MQ=255) agtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCg > 1:413562‑M2/65‑101 (MQ=255) agtcggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCg < 2:330481‑M2/37‑1 (MQ=255) cggttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGtc > 2:1503406‑M2/62‑101 (MQ=255) gttagaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGtctc < 2:1402924‑M2/42‑1 (MQ=255) agaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCaa > 2:1066486‑M2/57‑101 (MQ=255) agaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCaa > 1:1097811‑M2/57‑101 (MQ=255) agaatacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCaa > 2:511095‑M2/57‑101 (MQ=255) tacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAAcc > 1:316565‑M2/53‑101 (MQ=255) tacctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAAcc > 2:696857‑M2/53‑101 (MQ=255) cctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCgg < 2:256078‑M2/51‑1 (MQ=255) ctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCggg > 1:562783‑M2/50‑101 (MQ=255) ctgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCggg > 1:891913‑M2/50‑101 (MQ=255) tgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgcccCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGgt < 2:215351‑M2/53‑1 (MQ=255) tgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGgt > 1:251915‑M2/49‑101 (MQ=255) tgcctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGgt > 1:1592145‑M2/49‑101 (MQ=255) cctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGgtgt < 2:976183‑M2/55‑1 (MQ=255) cctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGgtgt < 1:1606588‑M2/55‑1 (MQ=255) ctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGtt > 1:1301280‑M2/46‑101 (MQ=255) ctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGtt > 2:127058‑M2/46‑101 (MQ=255) ctgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGtt > 2:1208218‑M2/46‑101 (MQ=255) tgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTg < 1:2975‑M2/57‑1 (MQ=255) tgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTg > 2:495126‑M2/45‑101 (MQ=255) tgtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTg > 2:604826‑M2/45‑101 (MQ=255) gtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTgg > 2:1588978‑M2/44‑101 (MQ=255) gtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTgg < 2:1615230‑M2/58‑1 (MQ=255) gtcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGATCAATTGGCAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTgg > 1:544980‑M2/44‑101 (MQ=255) tcacgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTggg > 2:122150‑M2/43‑101 (MQ=255) acgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAg < 1:776091‑M2/61‑1 (MQ=255) cgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTTATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGCAGt > 1:1107898‑M2/40‑101 (MQ=255) cgcagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGt < 2:442936‑M2/62‑1 (MQ=255) cagggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTc > 1:740654‑M2/38‑101 (MQ=255) gggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGa > 1:1519001‑M2/36‑101 (MQ=255) gtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGtct > 1:234561‑M2/32‑101 (MQ=255) cgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGtctct > 2:1286102‑M2/30‑101 (MQ=255) cgcgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGCAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGtctct < 2:167330‑M2/72‑1 (MQ=255) cgggttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTcc > 2:1107689‑M2/28‑101 (MQ=255) gttcgagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGcc > 1:1164386‑M2/25‑101 (MQ=255) 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gagtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTg < 1:1119454‑M2/81‑1 (MQ=255) agtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGc > 2:702956‑M2/20‑101 (MQ=255) gtcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGcc < 1:39374‑M2/83‑1 (MQ=255) tcccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCa < 2:188709‑M2/84‑1 (MQ=255) cccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAg > 2:187518‑M2/17‑101 (MQ=255) ccgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGa > 1:71847‑M2/16‑101 (MQ=255) cgtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGaa < 2:1104759‑M2/87‑1 (MQ=255) gtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGaaa > 2:751122‑M2/14‑101 (MQ=255) gtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGaaa > 2:1382944‑M2/14‑101 (MQ=255) gtccgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGaaa < 1:789831‑M2/88‑1 (MQ=255) cgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatca < 1:1399063‑M2/91‑1 (MQ=255) cgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatca > 1:1567039‑M2/11‑101 (MQ=255) cgttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatca < 2:1620471‑M2/91‑1 (MQ=255) gttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatcat > 1:300707‑M2/10‑101 (MQ=255) gttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatcat < 2:891908‑M2/92‑1 (MQ=255) gttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatcat < 2:1592139‑M2/92‑1 (MQ=255) ttccgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAatcatc < 1:495131‑M2/93‑1 (MQ=255) cgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCtt < 1:1507306‑M2/96‑1 (MQ=255) cgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCtt > 1:782211‑M2/6‑101 (MQ=255) cgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCtt > 2:1281690‑M2/6‑101 (MQ=255) cgccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCtt > 1:262840‑M2/6‑101 (MQ=255) gctaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCTTa < 1:1050272‑M2/97‑1 (MQ=255) ccaCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCTTAg < 2:296977‑M2/98‑1 (MQ=255) aCCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCTTAGCg < 2:1453507‑M2/100‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCGTTCCGCCACCCTAATTAGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCAGAAATCATCCTTAGCG > 9/1‑112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |