New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 158 | 1340 = | 83 (1.250) | 62 (1.120) | 38/166 | 0.6 | 64.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 158 | = 9342 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GGAAAAAGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCGGAACGGACGGGA > 158/9242‑9359 | ggAAAAAGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAg < 2:504095/101‑1 (MQ=255) gAAAAAGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGt < 2:1564692‑M2/101‑2 (MQ=255) aaaaaGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtg < 2:916256‑M2/101‑3 (MQ=255) aaaaGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtgg < 2:638655‑M2/101‑4 (MQ=255) aaGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcg > 1:279508‑M2/1‑96 (MQ=255) agagCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcgg < 2:1075891‑M2/101‑7 (MQ=255) agCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaa > 1:1564698‑M2/1‑93 (MQ=255) gCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaac > 2:1099791‑M2/1‑92 (MQ=255) cGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacg < 2:266001‑M2/101‑11 (MQ=255) gTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacgg < 2:420105‑M2/101‑12 (MQ=255) gTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacgg < 2:800561‑M2/101‑12 (MQ=255) gTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacgg < 1:70590‑M2/101‑12 (MQ=255) gTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacgg < 1:1150885‑M2/101‑12 (MQ=255) aTGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGCGCGTTAACTGGAGGTTTCTTATTAAGtgcgggaccggacggg < 2:940221‑M2/101‑17 (MQ=255) tGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacggga < 2:313188‑M2/101‑18 (MQ=255) tGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacggga > 1:59942‑M2/1‑84 (MQ=255) tGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacggga > 2:472144‑M2/1‑84 (MQ=255) gCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTACCTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggac > 1:29831‑M2/1‑83 (MQ=255) agagGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactc < 2:1201991‑M2/101‑21 (MQ=255) gagGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcg > 2:258866‑M2/1‑80 (MQ=255) gagGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcg > 1:1449053‑M2/1‑80 (MQ=255) gagGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcg > 1:814550‑M2/1‑80 (MQ=255) gagGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcg < 2:962107‑M2/101‑22 (MQ=255) agGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcga < 1:1683746‑M2/101‑23 (MQ=255) gATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaac < 2:1541642‑M2/101‑25 (MQ=255) tttttGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaaccc > 1:1552906‑M2/1‑75 (MQ=255) tttGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgc > 1:928000‑M2/1‑73 (MQ=255) tGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcga < 2:585171‑M2/101‑31 (MQ=255) tCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccct > 2:1711206‑M2/1‑65 (MQ=255) tCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccct > 1:1410340‑M2/1‑65 (MQ=255) gCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgt < 1:886388‑M2/101‑41 (MQ=255) gCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgt > 1:1541648‑M2/1‑61 (MQ=255) gCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgt > 1:1107572‑M2/1‑61 (MQ=255) ataatgGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgac < 2:1430572‑M2/101‑44 (MQ=255) ataataGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgac < 2:520884‑M2/101‑44 (MQ=255) aataGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAAaggcggtacggacgggactcgaacccgcgaccaccttcgtgacag < 2:434616‑M2/101‑46 (MQ=255) taGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggc < 1:741821‑M2/101‑48 (MQ=255) aGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggca > 2:1449833‑M2/1‑53 (MQ=255) aGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggca < 2:148176‑M2/101‑49 (MQ=255) aGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtagcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggca < 1:10141‑M2/101‑49 (MQ=255) atatACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcagg < 1:1575838‑M2/101‑51 (MQ=255) tataCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacctgcgaccccctgcgagacaagcaggc < 2:1121150‑M2/101‑52 (MQ=255) tataCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggt < 2:834306‑M2/101‑52 (MQ=255) ataCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggta < 2:1113763‑M2/101‑53 (MQ=255) ataCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggga < 2:68718‑M2/101‑53 (MQ=255) taCAGACGAAAAAAAGCCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtat > 2:516753‑M2/1‑48 (MQ=255) taCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtat > 2:1153930‑M2/1‑48 (MQ=255) taCAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtat > 1:891726‑M2/1‑48 (MQ=255) cAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggacttgaacccgctacgccctgcgtgagaggcagggattt < 2:11202‑M2/101‑56 (MQ=255) cAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgccaggcaggtattc < 2:904265‑M2/101‑56 (MQ=255) cAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcagggattc < 1:768832‑M2/101‑56 (MQ=255) cAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcagggattc < 2:1311458‑M2/101‑56 (MQ=255) aGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattct > 2:1041653‑M2/1‑45 (MQ=255) gACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattcta < 1:1428684‑M2/101‑58 (MQ=255) gACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaaccgacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattcta > 1:616636‑M2/1‑44 (MQ=255) 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aaaaaaCCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgac < 2:1097222‑M2/101‑64 (MQ=255) aaCCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaa < 2:1180247‑M2/101‑68 (MQ=255) ccTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaact < 2:1631722‑M2/101‑70 (MQ=255) cGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactacc < 1:1467677‑M2/101‑73 (MQ=255) cGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactacc < 1:1614660‑M2/101‑73 (MQ=255) gAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactaccg > 1:880856‑M2/1‑28 (MQ=255) gAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcagggattctaaccgactgaactaccg < 2:991038‑M2/101‑74 (MQ=255) 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gAGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactaccgctccaccgaatt < 2:140796‑M2/101‑86 (MQ=255) aGGTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactaccgctccaccgaattc > 1:916261‑M2/1‑15 (MQ=255) ggTTTCTTAATAAGtggcggaacggacgggactcgaacccgcgaccccctgcgtgacaggcaggtattctaaccgactgaactaccgctccaccgaattct > 2:1518654‑M2/1‑14 (MQ=255) | GGAAAAAGAGCGTAAAATGCAGAGGATTTTTGCGATTCTGGCAATAATAGATATACAGACGAAAAAAAACCTCGAGCGTTAACTCGAGGTTTCTTAATAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCGGAACGGACGGGA > 158/9242‑9359 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |