| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 137 | = 12181 | 0 (0.000) | 30 (0.450) | 23/200 | 2.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 210 | 2886 = | NA (NA) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GTATCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 210/2786‑2923 | gtaTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAg > 2:143724/1‑101 (MQ=255)gtaTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAg > 2:599276/1‑101 (MQ=255)gtaTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAg > 1:1450341/1‑101 (MQ=255) taTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGt > 2:776536/1‑101 (MQ=255) taTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGt < 1:690209/101‑1 (MQ=255) aTCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGtt > 2:1613407/1‑101 (MQ=255) cgcgCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTa > 1:999870/1‑101 (MQ=255) gcgcAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAt > 1:1379367‑M2/1‑100 (MQ=255) gcgcAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAt > 2:232918‑M2/1‑100 (MQ=255) gcgcAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAt > 2:765288‑M2/1‑100 (MQ=255) gcAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgc < 1:800190‑M2/101‑4 (MQ=255) cAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgcc < 1:487493‑M2/101‑5 (MQ=255) cGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggat > 1:20073‑M2/1‑93 (MQ=255) cGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggat > 1:1157689‑M2/1‑93 (MQ=255) gATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatg < 1:165896‑M2/101‑10 (MQ=255) cAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggc > 2:342373‑M2/1‑88 (MQ=255) aCATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGGGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTGTAtggcggatgcggctc < 1:351116‑M2/101‑16 (MQ=255) cATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtg < 1:702779‑M2/101‑17 (MQ=255) aTTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtga < 1:537260‑M2/101‑18 (MQ=255) aTTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtga < 1:1420236‑M2/101‑18 (MQ=255) ttGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaac > 1:143724‑M2/1‑82 (MQ=255) cgccgcAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgcct < 2:1709307‑M2/101‑24 (MQ=255) gccgcAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGGGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGGGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccct < 1:1296835‑M2/101‑25 (MQ=255) cAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcc > 1:987059‑M2/1‑73 (MQ=255) cAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcc < 1:77952‑M2/101‑29 (MQ=255) ggAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg > 2:1554939‑M2/1‑71 (MQ=255) gTAAATAAAAAGAGGCACGATGGTGATGCCATCGGGCTGGAGTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAACCGGCCtat > 2:594549/1‑99 (MQ=37) aataaaAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaa < 2:991461‑M2/101‑39 (MQ=255) aataaaAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaa < 1:1207544‑M2/101‑39 (MQ=255) taaaAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaat > 2:848937‑M2/1‑61 (MQ=255) taaaAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcccgcctacaaaat < 1:1369469‑M2/101‑41 (MQ=255) taaaAAGAGGCCCGATGGCGATGCCATCGGGCTAGACTGGTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtcaacggcttatccgccctacaaaat < 2:935029‑M2/101‑41 (MQ=255) aaaaaGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatt > 1:175247‑M2/1‑60 (MQ=255) aaaaaGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatt > 1:66539‑M2/1‑60 (MQ=255) aaaGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgt < 1:1126871‑M2/101‑44 (MQ=255) agagGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgt < 1:898252‑M2/101‑46 (MQ=255) gagGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgta > 1:180076‑M2/1‑55 (MQ=255) agGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggctgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaa < 2:1365639‑M2/101‑48 (MQ=255) ggCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaa > 1:1613413‑M2/1‑53 (MQ=255) ggCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaa > 1:1208580‑M2/1‑53 (MQ=255) ccGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattc < 1:881733‑M2/101‑52 (MQ=255) gATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaa < 2:1706331‑M2/101‑54 (MQ=255) ggTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataa > 2:429802‑M2/1‑45 (MQ=255) tGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaatgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaat < 2:511253‑M2/101‑59 (MQ=255) tGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaat < 1:1543802‑M2/101‑59 (MQ=255) tGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaat > 1:993044‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattg < 2:147317‑M2/101‑61 (MQ=255) gCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattgat > 1:1477743‑M2/1‑39 (MQ=255) cATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattgatcg > 1:1198453‑M2/1‑37 (MQ=255) cATCGGCCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTATTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctccaaaattgtgtaaattcaataaattgatcg > 1:1612974‑M2/1‑37 (MQ=255) aTCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattgatcga < 1:706701‑M2/101‑66 (MQ=255) aTCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattgatcga > 1:1617195‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaattgtgtaaattcaataaattgatcgatc < 1:1122238‑M2/101‑68 (MQ=255) | GTATCGCGCAGGCGATGCAACATTTGTCGCCGCAGGAGAGTAAATAAAAAGAGGCCCGATGGTGATGCCATCGGGCTAGACTGTTGACAAAGTGCGCTTAGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 210/2786‑2923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |