New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 134 | 1 = | 0 (0.000) | 54 (0.810) | 47/200 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 51 | = 15566 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGTAGGTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCTTACCGATCACAATACAATCAGTTCTTTTTCACAAACTCAGATTTCAGTTTCATCGGACCAAAACCGTCGATTTTGCAATCGATGTTATGGTCGCCTTCAAC > 51/15466‑15664 | tgtAGGTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTAc > 2:1539247/1‑101 (MQ=255) gtaaagcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTAc > 1:224477‑M2/68‑101 (MQ=255) gtaaagcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTAc > 2:632082‑M2/68‑101 (MQ=255) taaagcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcatcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTacg < 2:787602‑M2/35‑2 (MQ=255) taaagcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTacg > 2:11031‑M2/67‑100 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgt < 2:363509‑M2/101‑3 (MQ=255) aagcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCctacgaa > 1:96728‑M2/65‑98 (MQ=255) aGGTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgtt > 2:353710‑M2/1‑98 (MQ=255) gcgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgccccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGgcctacgaatc < 1:283232‑M2/39‑6 (MQ=255) gTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgtttt > 2:1093430‑M2/1‑96 (MQ=255) cgtgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCggcctacgaatcg > 1:1213838‑M2/62‑95 (MQ=255) tgctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATccggcctacgaatcggc < 1:319740‑M2/42‑9 (MQ=255) ggATAAGATGCGCAAGCATCTCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaat > 1:59429‑M2/1‑93 (MQ=255) ggATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaat > 2:362484‑M2/1‑93 (MQ=255) gATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatg > 2:1465974‑M2/1‑92 (MQ=255) gATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatg > 2:1067426‑M2/1‑92 (MQ=255) ctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTatccggcctacgaatcggcat < 1:1144157‑M2/44‑11 (MQ=255) ctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTatccggcctacgaatcggcat < 1:617435‑M2/44‑11 (MQ=255) ctcccagtaggcatgataagacgcggtaagcgtcgcatcaggcttcagcgcaccaccGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTatccggcctacgaatcggcat < 1:348048‑M2/44‑11 (MQ=255) aTAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgc < 2:839361‑M2/101‑11 (MQ=255) aGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccag > 2:929622‑M2/1‑88 (MQ=255) aGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccag > 2:701295‑M2/1‑88 (MQ=255) gcAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaa > 1:181240‑M2/1‑82 (MQ=255) aaGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatg < 2:1367043‑M2/101‑22 (MQ=255) aGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatgg < 2:912890‑M2/101‑23 (MQ=255) gcatcgcatcCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggt < 1:734737‑M2/101‑24 (MQ=255) tcgcatcCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaa < 1:364445‑M2/101‑27 (MQ=255) cgcatcCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaat > 1:939807‑M2/1‑74 (MQ=255) atcCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattac < 2:1148283‑M2/101‑31 (MQ=255) tcCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacc > 1:315078‑M2/1‑70 (MQ=255) ccGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacct < 1:1172752‑M2/101‑33 (MQ=255) gACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctgg < 2:1365971‑M2/101‑35 (MQ=255) aCATTATTGCGGCACAGGTGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctgga > 1:953736‑M2/1‑66 (MQ=255) aCATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCGGGATGCGGGGCGAGCGCCTTATCCGGCTTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctgga > 1:1187234‑M2/1‑66 (MQ=255) attattGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggata < 2:1472331‑M2/101‑38 (MQ=255) attattGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggata < 1:396934‑M2/101‑38 (MQ=255) ttattGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataa > 2:942066‑M2/1‑63 (MQ=255) tattGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataat > 2:628742‑M2/1‑62 (MQ=255) ttGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatca > 2:935080‑M2/1‑60 (MQ=255) ttGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatca > 1:112606‑M2/1‑60 (MQ=255) tGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaa < 1:829724‑M2/101‑43 (MQ=255) gCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaac > 1:1367049‑M2/1‑58 (MQ=255) cGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaact < 2:1155330‑M2/101‑45 (MQ=255) ggCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactc > 1:870010‑M2/1‑56 (MQ=255) gCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactca > 1:261489‑M2/1‑55 (MQ=255) caGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgg > 1:1414812‑M2/1‑52 (MQ=255) aGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgg > 1:721424‑M2/1‑48 (MQ=255) gTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtggg < 2:853982‑M2/101‑55 (MQ=255) gTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtggg > 2:1231584‑M2/1‑47 (MQ=255) ttGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtt > 1:569410‑M2/1‑45 (MQ=255) tGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggttt > 2:549332‑M2/1‑44 (MQ=255) tGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggttt < 1:810819‑M2/101‑58 (MQ=255) ggCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggttta < 1:560897‑M2/101‑59 (MQ=255) gCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaa > 1:912895‑M2/1‑42 (MQ=255) cAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaat > 1:1577669‑M2/1‑41 (MQ=255) cAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaat > 1:1169863‑M2/1‑41 (MQ=255) aaCGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaata < 1:1243417‑M2/101‑62 (MQ=255) aaCGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaata > 1:325444‑M2/1‑40 (MQ=255) cGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaa > 2:974651‑M2/1‑38 (MQ=255) cGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgt > 1:930527‑M2/1‑32 (MQ=255) ggATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtc < 1:1459908‑M2/101‑71 (MQ=255) gATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtct > 1:363509‑M2/1‑30 (MQ=255) gcgcGAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtctccagat > 1:285396‑M2/1‑24 (MQ=255) cgAGCGCCTTATCCGGCCTACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtctccagatatt > 1:1276861‑M2/1‑21 (MQ=255) tACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtctccagatattcatcaggctgatgagctt > 2:364445‑M2/1‑3 (MQ=255) tACgttttaatgccagcaaaaatggtgaattacctggataatcaactcacgggtgggtttaataaaccgcgtctccagatattcatcaggctgatgagctt < 2:1612833‑M2/101‑99 (MQ=255) | TGTAGGTCGGATAAGATGCGCAAGCATCGCATCCGACATTATTGCGGCACAGGAGTTTGGCAACGGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCTTACCGATCACAATACAATCAGTTCTTTTTCACAAACTCAGATTTCAGTTTCATCGGACCAAAACCGTCGATTTTGCAATCGATGTTATGGTCGCCTTCAAC > 51/15466‑15664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |