| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 117 | 1 = | 0 (0.000) | 25 (0.380) | 23/196 | 1.8 | 49.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 76 | = 13488 | 51 (0.780) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CCCTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATCCGCCGTCGGGTCAGCTCCTCG > 76/13388‑13588 | cccTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGAc < 2:218981/101‑1 (MQ=255)cccTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGAc < 1:1569999/101‑1 (MQ=255) ccTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACg > 1:1075542‑M2/1‑100 (MQ=255) cTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACgg > 2:205721‑M2/1‑99 (MQ=255) ctctGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCg > 1:725924/1‑101 (MQ=255) cttccaGGGTGAGGGCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACGGATtgtg < 2:270648/96‑1 (MQ=14) ttccaGGGTGAGGGCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACGGATTGTGc < 1:24327/97‑1 (MQ=14) tccaGGGTGAGGGCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACGGATTGTGcg < 1:1247745/98‑2 (MQ=14) gTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCt > 2:800532/1‑101 (MQ=255) tAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACACCCTCCCCGAAGGGGCGCGGGGACgggtcgggcga < 1:82288‑M2/101‑12 (MQ=255) ggTGAGGGCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttg > 1:1439641‑M2/1‑86 (MQ=255) gagaGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGt > 1:1118488/1‑101 (MQ=255) gagaGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGt < 1:1293202/101‑1 (MQ=255) agagGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGtt > 2:389014/1‑101 (MQ=255) agagGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGtt > 1:991519/1‑101 (MQ=255) agGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCTCCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTa < 1:1678595/101‑1 (MQ=255) agGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACGGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTa < 2:145859/101‑1 (MQ=255) ggCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaat > 2:885052‑M2/1‑80 (MQ=255) ggCTGGGGTGAGGGTTAATGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaat > 1:1470037‑M2/1‑80 (MQ=255) gggtgggggtgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTtat > 1:1586731/1‑101 (MQ=255) gtgacggtgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTCCCCCTCACCCTATCCCTCTCCCCGAAGGGGCAAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTtatgc < 2:1185121/96‑3 (MQ=255) tgggggtgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATact < 1:191233/101‑1 (MQ=255) gggggtgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATactc < 2:1276043/101‑1 (MQ=255) gagggttaaTGTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcatta > 2:1602379‑M2/3‑71 (MQ=255) gttaatgttcgCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcc > 2:847282‑M2/6‑67 (MQ=255) tgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATActcactca < 2:1439759/101‑1 (MQ=255) tgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATActcactca < 1:1207942/101‑1 (MQ=255) tgATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATActcactca < 1:1521159/101‑1 (MQ=255) gATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAg < 2:1391465/101‑1 (MQ=255) aatgtTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgccctt > 1:594506‑M2/3‑64 (MQ=255) aTTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAgg > 1:709775/1‑101 (MQ=255) tGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCt < 1:986851/101‑1 (MQ=255) gTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCtt < 1:345280/101‑1 (MQ=255) gTTCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaac > 1:368446‑M2/1‑61 (MQ=255) ttCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaacc > 1:864562‑M2/1‑60 (MQ=255) ttCGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaacc > 2:372894‑M2/1‑60 (MQ=255) tCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTg < 2:1491128/101‑1 (MQ=255) cGCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaacctt > 2:509690‑M2/1‑58 (MQ=255) gCACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaacctta > 2:202408‑M2/1‑57 (MQ=255) cACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGc > 1:1685847/1‑101 (MQ=255) cACCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttat > 1:5253‑M2/1‑56 (MQ=255) aCCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCa < 2:1068526/101‑1 (MQ=255) aCCAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttatt > 2:538888‑M2/1‑55 (MQ=255) ccAGTGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttatta > 1:1591923‑M2/1‑54 (MQ=255) cagtgCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaa > 2:659712‑M2/3‑53 (MQ=255) ggTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACg < 2:1586725/101‑1 (MQ=255) agtGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaat > 1:1004371‑M2/2‑52 (MQ=255) gTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCCAAACCTCCCCCCCAAGGGGCGAGGGGAGGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATTCTCACTCAGGCTTTGGGCAACgt > 2:1561926/1‑101 (MQ=37) tGCTGG‑CTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataa > 1:600196‑M2/1‑50 (MQ=255) cTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACgttgt < 1:1253460/101‑1 (MQ=255) tGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGTGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACgttgtt < 1:1596577/101‑1 (MQ=255) tGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACgttgtt < 2:1535381/101‑1 (MQ=255) ggTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGttc < 1:484708/101‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGTGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGttccttc < 2:82288/101‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGttccttc < 1:670757/101‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGttccttc < 1:394506/101‑1 (MQ=255) tCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctg > 1:427077‑M2/1‑40 (MQ=255) ccTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGCCGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTg > 1:30121/1‑101 (MQ=255) ccTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTg > 1:310393/1‑101 (MQ=255) ccTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAGGGGCGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatt < 1:1481461‑M2/101‑65 (MQ=255) cTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTgg > 1:1047516/1‑101 (MQ=255) ctcccTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCCCTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCt < 2:1048939/99‑1 (MQ=255) aCCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTa > 1:246570/1‑101 (MQ=255) ccTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTAcc > 1:1255335/1‑101 (MQ=255) aaCCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTAccgcc < 2:991514/101‑1 (MQ=255) aaCCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTAccgcc > 2:470518/1‑101 (MQ=255) aCCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTAccgcca < 2:360784/101‑2 (MQ=255) ccTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCa > 1:1019293/1‑101 (MQ=255) ccTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCa > 1:1236073/1‑101 (MQ=255) ctcCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATc > 1:41066/1‑101 (MQ=255) tcCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATcc < 2:1047511/101‑1 (MQ=255) cccGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATccgc > 2:513601/1‑101 (MQ=255) cGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATccgccg < 1:231354/101‑1 (MQ=255) cGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATccgccg > 2:1573120/1‑101 (MQ=255) cGAGGGGACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaac > 1:1501288‑M2/1‑9 (MQ=255) gggACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATCCGCCGTCGGGTCAGctc > 1:646538/1‑101 (MQ=255) ggACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaacgccct > 2:1064440‑M2/1‑4 (MQ=255) ggACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaacgccct < 2:890191‑M2/101‑98 (MQ=255) gACggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaacgccctt > 1:348825‑M2/1‑3 (MQ=255) aCggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaacgcccttc < 2:817046‑M2/101‑100 (MQ=255) cggattgtgcgctttgtcgaatttgtcattacgcccttaaccttattaataacaggaagctgatttgtgagactcgccccgctctaccgcaacgcccttct > 1:1514770‑M2/1‑1 (MQ=255) | CCCTCGCTCTGTAGGGAGAGGGCCGGGGTGGGGGTGATTGTTCGCACCGGTGCTGGTCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCGAAGGGGCGAGGGGACGGTTCGTGCTAACGTTTAGTTTTATACTCACTCAGGCTTTGGGCAACGTTGTTCCTTCCAGCTGGCTACCGCCGCAATCCGCCGTCGGGTCAGCTCCTCG > 76/13388‑13588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |