| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 115 | = 9626 | 77 (1.160) | 26 (0.460) | 19/168 | 2.1 | 44.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 60 | 17 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG > 60/1‑114 | ctgataagacgcgggagcggcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTActtctt < 1:1327989‑M2/24‑1 (MQ=255) gataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCg < 1:1004912‑M2/26‑1 (MQ=255) gataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCg < 2:1507265‑M2/26‑1 (MQ=255) gataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCg > 1:1084685‑M2/76‑101 (MQ=255) ataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCgg > 1:583025‑M2/75‑101 (MQ=255) taagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGt > 2:1292062‑M2/74‑101 (MQ=255) gccgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGa < 2:126997‑M2/31‑1 (MQ=255) tgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCttt < 1:90345‑M2/37‑1 (MQ=255) gagcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCtttt < 2:984122‑M2/38‑1 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCttttt < 2:457932‑M2/39‑1 (MQ=255) cgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCg < 1:351987‑M2/41‑1 (MQ=255) cgtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCg < 2:1054540‑M2/41‑1 (MQ=255) gtcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCgg > 2:1248033‑M2/60‑101 (MQ=255) tcgcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGc < 2:981286‑M2/43‑1 (MQ=255) gcatcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCa < 2:489248‑M2/45‑1 (MQ=255) atcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAgt > 2:1583494‑M2/55‑101 (MQ=255) atcagacatcgttcaccattgccggatgcggccttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAgt < 2:64503‑M2/47‑1 (MQ=255) tcaggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAgtc < 2:489440‑M2/48‑1 (MQ=255) caggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAgtcg < 1:1445444‑M2/49‑1 (MQ=255) caggcatcgttcaccattgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAgtcg < 1:1268758‑M2/49‑1 (MQ=255) cggcgttaacgCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGaa > 1:27742/11‑101 (MQ=255) gttaacgCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGCCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCa > 1:1637852/7‑101 (MQ=255) ttaacgCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCAc < 1:1619663/96‑1 (MQ=255) taacgCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACg > 2:486507/5‑101 (MQ=255) aacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCAcgg > 2:1498705‑M2/20‑100 (MQ=255) aacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGa > 2:1481039‑M2/20‑101 (MQ=255) aacgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGa > 2:949566‑M2/20‑101 (MQ=255) acgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGAt < 2:253189‑M2/83‑1 (MQ=255) cgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATg < 2:1388732‑M2/84‑1 (MQ=255) cgccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATg < 1:823594‑M2/84‑1 (MQ=255) cttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCgg > 2:1125826‑M2/15‑101 (MQ=255) ggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGc > 2:711252‑M2/8‑101 (MQ=255) gcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCt < 1:1481219‑M2/95‑1 (MQ=255) cctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTc > 1:458641‑M2/6‑101 (MQ=255) ctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGGCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTcc > 2:1063210‑M2/5‑101 (MQ=255) ctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTcc < 1:1218530‑M2/97‑1 (MQ=255) tacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCg < 1:1035744‑M2/98‑1 (MQ=255) tacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCg < 1:1292068‑M2/98‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG > 60/1‑114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |