New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 113 | = 14496 | 24 (0.360) | 41 (0.640) | 26/192 | 1.5 | 78.1% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 147 | = 9950 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AATGCTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 147/9850‑9954 | aaTGCTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATc < 2:1022432/101‑1 (MQ=255) aaTGCTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATc < 1:461108/101‑1 (MQ=255) aaTGCTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATc > 2:539682/1‑101 (MQ=255) cTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaacc > 2:1374898‑M2/1‑97 (MQ=255) cTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaacc > 2:600908‑M2/1‑97 (MQ=255) tGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccg > 2:3067‑M2/1‑96 (MQ=255) ttAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtag > 2:781837‑M2/1‑93 (MQ=255) aaGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggc < 1:1694927‑M2/101‑11 (MQ=255) gTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAGGCTTAATTAATGGCCCGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATGAAccgtaggacggg > 2:1363587/1‑91 (MQ=255) gTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccgga < 1:46499‑M2/101‑15 (MQ=255) gTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccgga < 2:1509183‑M2/101‑15 (MQ=255) gTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccgga < 1:421436‑M2/101‑15 (MQ=255) gTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGACGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccgga < 1:198985‑M2/101‑15 (MQ=255) aTTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggata > 1:933173‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTAGCCAACGTAAGAAAAATATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCTTATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggata > 2:1668623‑M2/1‑85 (MQ=255) ttAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataa < 1:1257552‑M2/101‑18 (MQ=255) ttAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataa < 2:1217222‑M2/101‑18 (MQ=255) tAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataag > 2:375286‑M2/1‑83 (MQ=255) aGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataagg < 2:1674310‑M2/101‑20 (MQ=255) cAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgt < 1:1491463‑M2/101‑23 (MQ=255) cAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgt < 2:168982‑M2/101‑23 (MQ=255) cAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgt < 1:164829‑M2/101‑23 (MQ=255) gacGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtt > 1:750103‑M2/2‑78 (MQ=255) aaCGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtt > 2:684678‑M2/1‑78 (MQ=255) aaCGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtt > 1:1480058‑M2/1‑78 (MQ=255) gTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttac > 2:644517‑M2/1‑75 (MQ=255) gTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttac < 2:779534‑M2/101‑27 (MQ=255) gTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttac > 1:824831‑M2/1‑75 (MQ=255) tAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacg < 1:1060069‑M2/101‑28 (MQ=255) tAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacg < 2:41612‑M2/101‑28 (MQ=255) aagaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgc < 1:1456564‑M2/101‑29 (MQ=255) aagaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgc > 1:739542‑M2/1‑73 (MQ=255) agaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgcc < 2:1127644‑M2/101‑30 (MQ=255) gaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccg > 2:1459930‑M2/1‑71 (MQ=255) gaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccg < 2:869812‑M2/101‑31 (MQ=255) gaaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGACCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccg > 1:981007‑M2/1‑71 (MQ=255) aaagaGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgc < 1:233355‑M2/101‑32 (MQ=255) agagATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGTCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggagcttatgccgcat < 1:1068494‑M2/101‑34 (MQ=255) agagATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcat < 2:757011‑M2/101‑34 (MQ=255) gagaTGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatc < 1:608765‑M2/101‑35 (MQ=255) agaTGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatcc > 1:1589731‑M2/1‑66 (MQ=255) agaTGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatcc < 2:647989‑M2/101‑36 (MQ=255) cTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcag > 1:1713743‑M2/1‑61 (MQ=255) tGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagt < 2:896626‑M2/101‑42 (MQ=255) cggcTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtttc < 1:1129579‑M2/101‑45 (MQ=255) tGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtttcacat > 1:970390‑M2/1‑53 (MQ=255) tGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCaaccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtttcacat > 2:1406306‑M2/1‑53 (MQ=255) | AATGCTGGTTAAGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 147/9850‑9954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |