New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 10 | 1 = | 0 (0.000) | 64 (1.030) +TAAACAA |
42/186 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 63 | = 24466 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TTCCCGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 63/24366‑24466 | ttCCCGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCt < 1:1174109/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCt > 2:1540576/1‑101 (MQ=255) cccGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTtt > 2:961101‑M2/1‑99 (MQ=255) cGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgt < 2:1310893‑M2/101‑5 (MQ=255) ccTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgttta > 2:901267‑M2/1‑94 (MQ=255) cTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttat < 2:1327562‑M2/101‑9 (MQ=255) ttATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatg > 2:961072‑M2/1‑92 (MQ=255) aTCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgcc > 2:1253540‑M2/1‑90 (MQ=255) cGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccgg < 2:417729‑M2/101‑14 (MQ=255) ggACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccgga < 1:1151769‑M2/101‑15 (MQ=255) gggAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcgg > 1:1391151‑M2/1‑82 (MQ=255) ggAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggc > 2:142004‑M2/1‑81 (MQ=255) aaTGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgt < 1:275177‑M2/101‑23 (MQ=255) aaTGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgt < 2:149150‑M2/101‑23 (MQ=255) tGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtta < 1:1519902‑M2/101‑25 (MQ=255) gAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaa > 1:1588096‑M2/1‑76 (MQ=255) aaGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaac > 1:1038301‑M2/1‑75 (MQ=255) aaGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaac < 1:556629‑M2/101‑27 (MQ=255) aGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacg < 2:554119‑M2/101‑28 (MQ=255) gTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgc > 1:242605‑M2/1‑73 (MQ=255) gTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgc < 1:1517424‑M2/101‑29 (MQ=255) gTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgc < 1:694062‑M2/101‑29 (MQ=255) gTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGAGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgc < 2:1592236‑M2/101‑29 (MQ=255) aTTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgcct > 1:508319‑M2/1‑71 (MQ=255) aTTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgcct < 2:301902‑M2/101‑31 (MQ=255) gctgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttat > 2:341261‑M2/1‑68 (MQ=255) gctgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttat > 2:918388‑M2/1‑68 (MQ=255) gctgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttat > 1:1624927‑M2/1‑68 (MQ=255) tgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatcc > 1:748297‑M2/1‑66 (MQ=255) tgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatcc < 2:483619‑M2/101‑36 (MQ=255) tgcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatcc > 2:421842‑M2/1‑66 (MQ=255) gcCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccg > 2:521449‑M2/1‑65 (MQ=255) ggATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcc < 1:1051212‑M2/101‑40 (MQ=255) tGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctac > 2:1401749‑M2/1‑59 (MQ=255) gcTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaa > 1:328771‑M2/1‑55 (MQ=255) gcTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaa < 2:1517734‑M2/101‑47 (MQ=255) aCGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtg > 2:1151764‑M2/1‑50 (MQ=255) gCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgca > 1:1158825‑M2/1‑48 (MQ=255) agagGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaa < 2:181251‑M2/101‑56 (MQ=255) caGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaata > 2:1422212‑M2/1‑39 (MQ=255) aGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatac < 1:245899‑M2/101‑64 (MQ=255) aGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatac > 1:1592242‑M2/1‑38 (MQ=255) gcgcCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaataca > 1:899130‑M2/1‑37 (MQ=255) gcCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacatt > 1:217438‑M2/1‑35 (MQ=255) aCCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgca > 2:566639‑M2/1‑32 (MQ=255) aCCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgca < 2:1588861‑M2/101‑70 (MQ=255) aCCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgaggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgca < 1:1539910‑M2/101‑70 (MQ=255) ccGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcag > 1:189326‑M2/1‑31 (MQ=255) cGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcaga < 2:1541132‑M2/101‑72 (MQ=255) cGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcaga > 2:1707318‑M2/1‑30 (MQ=255) cGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcaga > 1:76247‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcagaatt < 1:520872‑M2/101‑75 (MQ=255) tataCAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcagaattt < 2:954527‑M2/101‑76 (MQ=255) tataCAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcagaattt < 1:1244440‑M2/101‑76 (MQ=255) ataCAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcagaatttt < 1:646748‑M2/101‑77 (MQ=255) ttcagATTATTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgctgcgtgaacgccttatcccgcctacaaaatcgttcaaattcaatttattgcaatcatctt < 2:1661391‑M2/99‑78 (MQ=255) aCAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcgacgttaacgccttatccggcctacaaagtcgtgcaaattcaatacattgcagaattttcg > 2:178542‑M2/1‑23 (MQ=255) cAGATTGTTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgttaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatacattgcagaattttcgt < 2:1401375‑M2/101‑80 (MQ=255) cAGATTATTGACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgttcaaattcaatatattgcaatcatcttgt < 2:37674‑M2/101‑80 (MQ=255) ttattgACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggc < 1:270798‑M2/101‑84 (MQ=255) ttattgACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggc < 1:241061‑M2/101‑84 (MQ=255) tattgacAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtagacc > 1:279692‑M2/3‑17 (MQ=255) gACAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgat > 1:927416‑M2/1‑13 (MQ=255) cAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataa > 1:1614764‑M2/1‑11 (MQ=255) cAAAGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataa > 1:526969‑M2/1‑11 (MQ=255) aaaGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataag < 1:973276‑M2/101‑92 (MQ=255) aaaGTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataag > 1:678712‑M2/1‑10 (MQ=255) gTGCGCTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataagtgt > 1:1027222‑M2/1‑7 (MQ=255) gcTttgtttatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaatcgtgcaaattcaatatattgcaatcatcttgtaggcctgataagcgtagcg < 1:1004254‑M2/101‑99 (MQ=255) | TTCCCGCCCTTATCGGACAGGGAATGAAGTATTGCTGCCGGATGGCGCTGCACGCAGAGGCACAGCGCCACCGGGTATACAGATTGTTGACAAAGTGCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 63/24366‑24466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |