| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 10 | 1 = | 0 (0.000) | 48 (0.720) | 35/200 | 1.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 220 | = 1766 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ACACTTTTATTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 220/1666‑1766 | acacTTTTATTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCa < 2:1664373/101‑1 (MQ=255) cacTTTTATTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAt > 2:16457‑M2/1‑100 (MQ=255) cTTTTATTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgc > 1:121267‑M2/1‑98 (MQ=255) aTTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTTGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggat < 2:806949‑M2/101‑9 (MQ=255) aTTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggat < 2:1087546‑M2/101‑9 (MQ=255) aTTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggat > 2:430803‑M2/1‑93 (MQ=255) cAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGTATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcg > 2:178787‑M2/1‑90 (MQ=255) cAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcg < 2:106724‑M2/101‑12 (MQ=255) aGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcgg < 2:1043869‑M2/101‑13 (MQ=255) tgtgtTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcg > 1:375004‑M2/1‑87 (MQ=255) gtTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtga < 2:148990‑M2/101‑18 (MQ=255) gtTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtga < 2:817190‑M2/101‑18 (MQ=255) ttGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTTTTCAtgccggatgcggcgtgaa > 2:1119814‑M2/1‑83 (MQ=255) tGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaac > 2:1117422‑M2/1‑82 (MQ=255) tGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaac > 2:587211‑M2/1‑82 (MQ=255) gagagTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgcct > 2:1391615‑M2/1‑78 (MQ=255) agagTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgcctt < 1:247379‑M2/101‑25 (MQ=255) agagTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgcctt < 1:213603‑M2/101‑25 (MQ=255) gagTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgcctta > 1:1132210‑M2/1‑76 (MQ=255) ttttGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcc > 1:1537683‑M2/1‑73 (MQ=255) ttttGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaaccccttatcc < 1:728046‑M2/101‑29 (MQ=255) ggCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggccta < 1:424866‑M2/101‑35 (MQ=255) tGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaa < 1:1617311‑M2/101‑38 (MQ=255) tAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatc < 1:530431‑M2/101‑42 (MQ=255) aaaaaTAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcg > 1:265075‑M2/1‑59 (MQ=255) aaaaaTAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaaagccttatccggcctacaaggtcg < 1:526045‑M2/101‑43 (MQ=255) aaaaTAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgt < 1:1554039‑M2/101‑44 (MQ=255) aataatGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcccacaagagcgtgc < 1:1233319‑M2/101‑46 (MQ=255) gTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattc < 2:990208‑M2/101‑52 (MQ=255) gTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattc > 1:1372186‑M2/1‑50 (MQ=255) ggATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaata > 2:1153002‑M2/1‑46 (MQ=255) ggATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaata > 2:1702225‑M2/1‑46 (MQ=255) ggATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaata < 1:1193289‑M2/101‑56 (MQ=255) ggATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaata > 2:408326‑M2/1‑46 (MQ=255) gATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatat > 1:147584‑M2/1‑45 (MQ=255) gATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatat > 1:816823‑M2/1‑45 (MQ=255) aTTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatata < 1:1536912‑M2/101‑58 (MQ=255) aTTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatata > 2:861822‑M2/1‑44 (MQ=255) ttAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatat < 2:353356‑M2/101‑59 (MQ=255) tAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatatt > 2:247379‑M2/1‑42 (MQ=255) aaaCCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattg > 2:1102526‑M2/1‑41 (MQ=255) aaaCCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaaccccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattg < 2:1605300‑M2/101‑61 (MQ=255) ccGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatg < 2:1582169‑M2/101‑65 (MQ=255) gcaatttACCTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggactaaaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgag > 2:1166747‑M2/4‑35 (MQ=255) aTTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgagcca < 2:763869‑M2/101‑70 (MQ=255) aTTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgagcca < 1:731365‑M2/101‑70 (MQ=255) tttAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgagccac < 1:131525‑M2/101‑71 (MQ=255) tttAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgagccac > 1:494077‑M2/1‑31 (MQ=255) tAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCAtgccggctgcggcgtgaacgccttatccggtctacaagatcgtgcaaattcaatatattgcatgagccacgt < 2:1036462‑M2/101‑73 (MQ=255) | ACACTTTTATTCAGTGTGTTGAAGAGAGTTTTGTGGCTGGATAAAAATAATGTCGGGATTAAACCCGGCATTTAACTTGTCGACAAAGTGCGCTTTATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 220/1666‑1766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |