| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 10 | 1 = | 0 (0.000) | 41 (0.620) | 28/200 | 1.8 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 151 | = 9732 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
TGACTGGTTTTAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 151/9632‑9732 | tgactgGTTTTAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCaa > 2:604330/1‑101 (MQ=255) aCTGGTTTTAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtg < 1:1470800‑M2/101‑3 (MQ=255) ttttAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccgga < 1:398550‑M2/101‑8 (MQ=255) tttAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggat > 2:1240255‑M2/1‑93 (MQ=255) ttAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatg < 2:990420‑M2/101‑10 (MQ=255) tAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgc < 2:876144‑M2/101‑11 (MQ=255) tAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgc < 2:1592245‑M2/101‑11 (MQ=255) tAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgc > 1:783592‑M2/1‑91 (MQ=255) tAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCAAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgc < 2:628886‑M2/101‑11 (MQ=255) aGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcg < 2:1001989‑M2/101‑15 (MQ=255) gAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtga < 1:595997‑M2/101‑18 (MQ=255) aGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaac > 1:1245599‑M2/1‑82 (MQ=255) aGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaac > 2:652421‑M2/1‑82 (MQ=255) aGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaac > 2:1128458‑M2/1‑82 (MQ=255) ggTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacg < 2:822710‑M2/101‑21 (MQ=255) tACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgcct < 2:783882‑M2/101‑24 (MQ=255) cttcttTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgcctta > 2:1179631‑M2/1‑76 (MQ=255) cttcttTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgcctta < 1:1139935‑M2/101‑26 (MQ=255) cttTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACTCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcc < 2:781165‑M2/101‑29 (MQ=255) cttTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatcc > 2:1363374‑M2/1‑73 (MQ=255) tttGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccg < 2:1140621‑M2/101‑30 (MQ=255) ttGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg > 1:672241‑M2/1‑71 (MQ=255) tgatgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggc > 1:1306315‑M2/1‑70 (MQ=255) gatgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcc > 2:1710360‑M2/1‑69 (MQ=255) gatgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcc < 2:1568653‑M2/101‑33 (MQ=255) gatgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcc > 1:600026‑M2/1‑69 (MQ=255) atgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcct > 2:39910‑M2/1‑68 (MQ=255) tgaAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggccta > 2:1462934‑M2/1‑67 (MQ=255) cgaaGCTGCCTCCAGCACTGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGACCAGCGTTAAGTGTGCAGTTAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccgggcta > 2:157499‑M2/2‑67 (MQ=255) aGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaa > 2:59987‑M2/1‑64 (MQ=255) ttCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaag > 2:95262‑M2/1‑61 (MQ=255) ctccAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcat > 2:1443754‑M2/1‑58 (MQ=255) tccAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatg > 2:602568‑M2/1‑57 (MQ=255) tccAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatg > 1:730141‑M2/1‑57 (MQ=255) tccAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatg > 1:1212889‑M2/1‑57 (MQ=255) ccAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgc > 1:1230805‑M2/1‑56 (MQ=255) cAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgca > 2:6835‑M2/1‑55 (MQ=255) aGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgcag < 1:1002233‑M2/101‑48 (MQ=255) cAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgcagat > 1:1162506‑M2/1‑52 (MQ=255) aaTGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgcagatt < 2:450209‑M2/101‑51 (MQ=255) gCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgcagattcaat > 1:363983‑M2/1‑47 (MQ=255) tGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAAtgacggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacaaaagcatgcagattcaatatattg < 2:984520‑M2/101‑61 (MQ=255) | TGACTGGTTTTAATAGCGAAGGTTACTTCTTTGATGAAGCTTCCTCCAGCAATGGCGAACTGGTGTTTAAACGCTACGAGCAGCGTTAAGTTTGCAGTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 151/9632‑9732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |