| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 218 | = 1999 | 0 (0.000) | 55 (0.980) +GGTGATGCTGCCAACT |
46/168 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 218/1900‑1999 | aTGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTg < 2:304270‑M1/101‑2 (MQ=255)aTGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTg < 2:59690‑M1/101‑2 (MQ=255) cGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtga > 1:10509‑M1/1‑96 (MQ=255) aTTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatg > 2:1102349‑M1/1‑94 (MQ=255) aTTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatg < 2:824009‑M1/101‑8 (MQ=255) ttCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgct < 1:248300‑M1/101‑10 (MQ=255) aTCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgcc > 1:245737‑M1/1‑89 (MQ=255) aTCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgcc > 1:1088544‑M1/1‑89 (MQ=255) tCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgcca < 1:445327‑M1/101‑14 (MQ=255) cTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaan < 1:1378940‑M1/101‑16 (MQ=255) tgatgaCTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaact > 1:1436566‑M1/1‑85 (MQ=255) tGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgat > 1:870881‑M1/1‑78 (MQ=255) ggTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatt < 2:203953‑M1/101‑25 (MQ=255) gAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:1462845‑M1/1‑74 (MQ=255) tGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:1455563‑M1/101‑32 (MQ=255) ggCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:811805‑M1/101‑33 (MQ=255) ggCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:19926‑M1/101‑33 (MQ=255) cAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:1624258‑M1/101‑35 (MQ=255) aGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:78306‑M1/1‑66 (MQ=255) gCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:1244711‑M1/101‑37 (MQ=255) gTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 2:634668‑M1/1‑63 (MQ=255) ttAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 2:1351060‑M1/101‑40 (MQ=255) tAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:1423603‑M1/1‑61 (MQ=255) tAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:479968‑M1/101‑41 (MQ=255) tAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 2:1646112‑M1/1‑61 (MQ=255) aaTTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 1:394791‑M1/101‑42 (MQ=255) tCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgtcaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:1059922‑M1/101‑45 (MQ=255) aaaaCCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:184258‑M1/1‑55 (MQ=255) aaaaCCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:1062143‑M1/1‑55 (MQ=255) aaCCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:938132‑M1/101‑49 (MQ=255) aCCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 2:761068‑M1/101‑50 (MQ=255) ccTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:119969‑M1/1‑51 (MQ=255) gATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 1:1467267‑M1/1‑48 (MQ=255) aTTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc > 2:1676897‑M1/1‑47 (MQ=255) ttGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:973136‑M1/101‑56 (MQ=255) ttGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:245737‑M1/101‑56 (MQ=255) ttGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 1:35446‑M1/101‑56 (MQ=255) tGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 1:625195‑M1/1‑45 (MQ=255) gAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 2:585092‑M1/101‑58 (MQ=255) aaGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGCTTTTCCTggcgatgctgccaacttactgatttagtgcctgatggggattttgaggtgctccagtg > 1:1157613‑M1/1‑43 (MQ=255) aGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:1461312‑M1/101‑60 (MQ=255) aGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:90964‑M1/101‑60 (MQ=255) aGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 2:10509‑M1/101‑60 (MQ=255) ggATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 2:1695430‑M1/1‑41 (MQ=255) ggATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 2:455370‑M1/101‑61 (MQ=255) gATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 1:1505524‑M1/1‑40 (MQ=255) ttAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc > 2:1102245‑M1/1‑38 (MQ=255) tAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct < 1:1222926‑M1/101‑65 (MQ=255) ggTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 2:870876‑M1/101‑67 (MQ=255) gTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt < 2:888769‑M1/101‑68 (MQ=255) tGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt < 2:761512‑M1/101‑69 (MQ=255) caACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg < 2:1462839‑M1/101‑79 (MQ=255) caACGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg > 2:1457751‑M1/1‑23 (MQ=255) aaCGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 1:922380‑M1/1‑22 (MQ=255) aCGTTAATTGCTGATTTTGCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc < 1:908129‑M1/101‑81 (MQ=255) cGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc > 1:422559‑M1/1‑20 (MQ=255) cGTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc > 1:539113‑M1/1‑20 (MQ=255) gTTAATTGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc > 1:62553‑M1/1‑19 (MQ=255) ttGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg > 1:933942‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGCTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:1326154‑M1/101‑88 (MQ=255) cTGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 1:441211‑M1/1‑11 (MQ=255) tGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca > 2:1087854‑M1/1‑10 (MQ=255) tGATTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca > 1:951249‑M1/1‑10 (MQ=255) aTTTTCCTggtgatgctgccaacttactgatatcgggtatgatggtgcttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtgcctccttttcagc > 2:237701‑M1/1‑8 (MQ=255) ttttCCTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct < 2:1390434‑M1/101‑95 (MQ=255) ccTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 1:1676903‑M1/101‑99 (MQ=255) | ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 218/1900‑1999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |