| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 177 | = 7332 | 0 (0.000) | 35 (0.850) +TATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC |
26/124 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ATATGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 177/7233‑7332 | atatGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTt > 2:921443‑M1/1‑100 (MQ=255) tatGTCAGCGTTTGTTGATTATAATATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTATCGCGGGGTAATGACTCCAACTta < 2:551322‑M1/101‑3 (MQ=255) tatGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTta < 1:1193374‑M1/101‑3 (MQ=255) atGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtat > 1:1569485‑M1/1‑98 (MQ=255) atGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtat < 2:200381‑M1/101‑4 (MQ=255) tGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtatt > 2:644626‑M1/1‑97 (MQ=255) tGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtatt < 1:153423‑M1/101‑5 (MQ=255) tGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtatt < 1:151406‑M1/101‑5 (MQ=255) tCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattga < 2:454437‑M1/101‑7 (MQ=255) cAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgat > 1:247306‑M1/1‑94 (MQ=255) cAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgat < 1:220491‑M1/101‑8 (MQ=255) gTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtg < 1:1347709‑M1/101‑12 (MQ=255) gTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtg > 1:818659‑M1/1‑90 (MQ=255) gTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGACGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtg > 1:550723‑M1/1‑90 (MQ=255) tgttgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttt > 2:1107902‑M1/1‑87 (MQ=255) tgttgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttt < 2:1303345‑M1/101‑15 (MQ=255) tgttgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttt > 2:1197564‑M1/1‑87 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat < 2:1443497‑M1/101‑18 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat < 2:1705424‑M1/101‑18 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat < 2:1107394‑M1/101‑18 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat > 1:793229‑M1/1‑84 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat > 2:1064520‑M1/1‑84 (MQ=255) tgATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGGCGCGGTGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat < 2:667929‑M1/101‑18 (MQ=255) gATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatg < 1:769852‑M1/101‑19 (MQ=255) taAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcag < 1:14182‑M1/101‑24 (MQ=255) aaaaTCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcaga > 1:779923‑M1/1‑77 (MQ=255) aaaTCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagat < 2:847976‑M1/101‑26 (MQ=255) aaTCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagata < 2:242598‑M1/101‑27 (MQ=255) tCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataat < 2:1572942‑M1/101‑29 (MQ=255) tCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataat < 1:1690433‑M1/101‑29 (MQ=255) tCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataat < 1:731958‑M1/101‑29 (MQ=255) aaccaacTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgc > 1:549692‑M1/1‑71 (MQ=255) ccaacTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:975208‑M1/101‑33 (MQ=255) ccaacTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:66503‑M1/101‑33 (MQ=255) aacTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:1334963‑M1/1‑67 (MQ=255) cTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg < 1:1652111‑M1/101‑37 (MQ=255) gATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact < 1:1058933‑M1/101‑40 (MQ=255) cGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 1:203774‑M1/1‑57 (MQ=255) cGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 2:296052‑M1/101‑45 (MQ=255) cGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 2:603251‑M1/101‑45 (MQ=255) gATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:1355517‑M1/1‑56 (MQ=255) gATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca < 1:1222490‑M1/101‑46 (MQ=255) gATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca < 2:39726‑M1/101‑46 (MQ=255) aTAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttgagataatgcccgatgactttgtcat > 1:22652‑M1/1‑55 (MQ=255) aTAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat > 1:1291619‑M1/1‑55 (MQ=255) aTAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 2:640200‑M1/101‑47 (MQ=255) aTAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACACCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat > 2:1312332‑M1/1‑55 (MQ=255) tAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 2:977538‑M1/1‑54 (MQ=255) aaCAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc < 2:528950‑M1/101‑49 (MQ=255) aCAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 2:1180747‑M1/101‑50 (MQ=255) aaaTTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 1:1593213‑M1/1‑50 (MQ=255) ttGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 2:793224‑M1/101‑55 (MQ=255) ttGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 2:164108‑M1/101‑55 (MQ=255) gAATGTTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:484622‑M1/101‑57 (MQ=255) tatTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccga > 1:387754‑M1/1‑42 (MQ=255) taataaTGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt < 1:921448‑M1/101‑63 (MQ=255) aataatGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 2:818654‑M1/101‑64 (MQ=255) aatGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 2:1152266‑M1/1‑35 (MQ=255) aatGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 1:1466718‑M1/1‑35 (MQ=255) aatGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 2:1187730‑M1/1‑35 (MQ=255) atgatgATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 2:865906‑M1/1‑34 (MQ=255) atgatgATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 2:1667021‑M1/1‑34 (MQ=255) tgatgaTATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:1268432‑M1/1‑33 (MQ=255) gatgatATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 1:1598097‑M1/1‑32 (MQ=255) gatgatATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac < 1:1692646‑M1/101‑70 (MQ=255) atgatATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacg > 2:1496968‑M1/1‑31 (MQ=255) atatTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 1:1578647‑M1/1‑28 (MQ=255) tCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact < 1:217347‑M1/101‑80 (MQ=255) tCGCGGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact < 1:676559‑M1/101‑80 (MQ=255) cgGGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 1:103498‑M1/1‑19 (MQ=255) ggggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccg > 1:1566313‑M1/1‑18 (MQ=255) | ATATGTCAGCGTTTGTTGATTATAAAATCAACCAACTGGATAGCGATAACAAATTGAATATTAATAATGATGATATTGTCGCGGGGTAATGACTCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 177/7233‑7332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |