| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 166 | 1 = | 0 (0.000) | 76 (1.180) | 60/194 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 34 | 4 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACAAAAC > 166/1‑99 | gtgacgcgcgatagataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacc > 2:307699‑M1/101‑101 (MQ=255) cgcgatagataccctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatac‑AGCCACt > 1:1027502‑M1/95‑101 (MQ=255) gcgatagataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACt < 1:1369165‑M1/8‑1 (MQ=255) cgatagataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTg > 1:1190160‑M1/93‑101 (MQ=255) gatagataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTgg < 1:1674554‑M1/10‑1 (MQ=255) atagataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGc < 2:1096883‑M1/11‑1 (MQ=255) agataacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTg < 2:31808‑M1/13‑1 (MQ=255) aacctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCgg < 2:1524549‑M1/17‑1 (MQ=255) acctcgacctctccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCggg > 2:553193‑M1/84‑101 (MQ=255) acctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcacatacCAGCCACTGGCTGTCggg < 2:1094207‑M1/18‑1 (MQ=255) cctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGc < 2:1499419‑M1/19‑1 (MQ=255) ctcgacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCg < 1:1197374‑M1/20‑1 (MQ=255) gacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTcc < 2:1425556‑M1/23‑1 (MQ=255) gacctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTcc < 1:704661‑M1/23‑1 (MQ=255) acctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCa < 2:940523‑M1/24‑1 (MQ=255) cctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAg > 2:909749‑M1/77‑101 (MQ=255) ctcgccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAgg < 2:500096‑M1/26‑1 (MQ=255) gccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatccCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtat > 1:1130652‑M1/73‑101 (MQ=255) ccggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtatt > 1:150218‑M1/72‑101 (MQ=255) ggtatggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattgg < 1:440028‑M1/32‑1 (MQ=255) atggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattggtat < 1:1070638‑M1/35‑1 (MQ=255) atggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattggtat < 1:106341‑M1/35‑1 (MQ=255) atggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattggtat < 1:901471‑M1/35‑1 (MQ=255) ggatattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGgtattggtattg < 1:56997‑M1/37‑1 (MQ=255) tattcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTg < 1:1306318‑M1/40‑1 (MQ=255) ttcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAg > 1:1221448‑M1/60‑101 (MQ=255) ttcacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAg > 2:220691‑M1/60‑101 (MQ=255) cacacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCa > 1:937509‑M1/58‑101 (MQ=255) acacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAg < 1:266559‑M1/45‑1 (MQ=255) acacgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAg < 2:133634‑M1/45‑1 (MQ=255) acgctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTGCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGt < 1:1083785‑M1/47‑1 (MQ=255) ctcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGAt < 2:616108‑M1/50‑1 (MQ=255) tcaatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGAtt > 1:940528‑M1/51‑101 (MQ=255) caatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTa > 1:1210596‑M1/50‑101 (MQ=255) aatggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTAc > 2:901466‑M1/49‑101 (MQ=255) atggtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGAATTGGTGAGCAGGTGATTACg < 2:155957‑M1/54‑1 (MQ=255) gtctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACgggg > 1:1307529‑M1/45‑101 (MQ=255) ctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAg > 1:1204277‑M1/43‑101 (MQ=255) ctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAg > 1:572255‑M1/43‑101 (MQ=255) ctcgccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAg > 2:835223‑M1/43‑101 (MQ=255) gccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCaa < 2:450302‑M1/62‑1 (MQ=255) ccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCaaa < 2:324907‑M1/63‑1 (MQ=255) ccggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCaaa < 2:1451792‑M1/63‑1 (MQ=255) cggtaaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAg > 1:1271409‑M1/38‑101 (MQ=255) taaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGtt < 1:640811‑M1/67‑1 (MQ=255) aaacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTa < 1:824237‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTAt < 1:917260‑M1/69‑1 (MQ=255) acgacgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATc > 2:908393‑M1/32‑101 (MQ=255) cgccgccccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCt > 2:596576‑M1/31‑101 (MQ=255) cgccccagaaggacgcacgtaaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGtt > 1:879023‑M1/28‑101 (MQ=255) cccagaaggacgcacgtcaaattcCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCa > 2:1348315‑M1/25‑101 (MQ=255) cccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCa < 2:675053‑M1/77‑1 (MQ=255) ccagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCAt > 1:675058‑M1/24‑101 (MQ=255) cagaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATa > 1:1340986‑M1/23‑101 (MQ=255) agaaggacgcacgtcaaatccCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAg > 2:1206644‑M1/22‑101 (MQ=255) agaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAg < 2:1361414‑M1/80‑1 (MQ=255) agaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAg < 2:863395‑M1/80‑1 (MQ=255) gaaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAgc > 2:914665‑M1/21‑101 (MQ=255) gaaggacgcacgtaaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAgc > 2:1578243‑M1/21‑101 (MQ=255) aaggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAgcg < 2:1357714‑M1/82‑1 (MQ=255) aggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAgcgc < 1:1592240‑M1/83‑1 (MQ=255) ggacgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGcgcg < 2:959996‑M1/84‑1 (MQ=255) cgcacgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTc < 2:797111‑M1/87‑1 (MQ=255) acgtcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTg < 2:1103569‑M1/90‑1 (MQ=255) tcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATa > 1:500101‑M1/9‑101 (MQ=255) tcaaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATa < 2:294587‑M1/93‑1 (MQ=255) caaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGAtaa < 1:1138726‑M1/94‑2 (MQ=255) caaatacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGGATTGGTATTGGTGAGCAGGGGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATAc < 2:1190512‑M1/94‑1 (MQ=255) aatccCAGCCAATGGCTGTCGGGCGTCAAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAACAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaa > 2:253929‑M1/6‑101 (MQ=255) aaagcCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTTGTATTGGAGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaa > 2:822038‑M1/6‑101 (MQ=255) atccCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaaa > 1:62693‑M1/5‑101 (MQ=255) atacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaaa > 1:616113‑M1/5‑101 (MQ=255) atacCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaaa > 1:1499425‑M1/5‑101 (MQ=255) tccCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACaaaa > 1:1451798‑M1/4‑101 (MQ=255) acCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGTTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACAAAAc > 2:1334890‑M1/3‑101 (MQ=255) acCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACAAAAc > 1:1035560‑M1/3‑101 (MQ=255) acCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACAAAAc > 1:874253‑M1/3‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATAGCGCGGTCCTGATACAAAAC > 166/1‑99 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |