| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 162 | = 8767 | 0 (0.000) | 48 (0.720) | 32/200 | 1.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 162/8669‑8767 | cTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTta > 2:132735‑M1/1‑99 (MQ=255) tCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtact < 2:1510982‑M1/101‑5 (MQ=255) cTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactg < 1:380364‑M1/101‑6 (MQ=255) cTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactg < 1:1305369‑M1/101‑6 (MQ=255) gCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatt < 1:1362671‑M1/101‑9 (MQ=255) gCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatt < 1:1617609‑M1/101‑9 (MQ=255) cATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgattt < 2:864343‑M1/101‑10 (MQ=255) aTGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgattta < 2:429522‑M1/101‑11 (MQ=255) cGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtat < 1:601820‑M1/101‑17 (MQ=255) cGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtat < 1:199825‑M1/101‑17 (MQ=255) gTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatga > 1:873213‑M1/1‑83 (MQ=255) gTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatga < 2:1230116‑M1/101‑19 (MQ=255) cAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatg > 2:604859‑M1/1‑81 (MQ=255) cAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatg < 1:1516510‑M1/101‑21 (MQ=255) aGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatgg > 1:1649606‑M1/1‑80 (MQ=255) aGAATGACTCATGATGTGGCCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatgg > 1:746828‑M1/1‑80 (MQ=255) aTGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtga < 2:617058‑M1/101‑25 (MQ=255) tGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgat < 2:1332204‑M1/101‑26 (MQ=255) gACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgatt > 2:1005364‑M1/1‑75 (MQ=255) cATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaa > 1:157906‑M1/1‑71 (MQ=255) tgatgTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaagg < 2:1103446‑M1/101‑33 (MQ=255) tgatgTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaagg < 2:1494181‑M1/101‑33 (MQ=255) gatgTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggt < 2:1579708‑M1/101‑34 (MQ=255) atgTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtg < 2:120094‑M1/101‑35 (MQ=255) atgTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtg > 2:1536112‑M1/1‑67 (MQ=255) tgGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgctt < 1:271199‑M1/101‑38 (MQ=255) tgGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgctt < 1:70519‑M1/101‑38 (MQ=255) ggTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttg > 1:697427‑M1/1‑63 (MQ=255) gcctgCTATTATTGACATGCTCACTGACCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggcggttttaaggtgcttgc > 2:1015986‑M1/3‑62 (MQ=255) gTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgc < 2:1631264‑M1/101‑40 (MQ=255) tattatTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggct > 1:1532805‑M1/1‑56 (MQ=255) tattatTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggct < 1:567264‑M1/101‑46 (MQ=255) attattGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggctt > 1:816017‑M1/1‑55 (MQ=255) attattGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggctt < 2:420155‑M1/101‑47 (MQ=255) attattGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggctt > 2:227391‑M1/1‑55 (MQ=255) tattGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttcc < 1:1317771‑M1/101‑49 (MQ=255) tGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatt > 1:1670278‑M1/1‑50 (MQ=255) gACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccattt > 1:1196564‑M1/1‑49 (MQ=255) aCATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttc > 1:893325‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttcca > 2:192291‑M1/1‑46 (MQ=255) aTCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttcca > 2:1420472‑M1/1‑46 (MQ=255) tCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccat > 1:1332984‑M1/1‑45 (MQ=255) ccTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatc < 1:1050463‑M1/101‑58 (MQ=255) ccTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatc < 1:694632‑M1/101‑58 (MQ=255) cTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatg > 1:1077985‑M1/1‑39 (MQ=255) cTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatg > 2:868273‑M1/1‑39 (MQ=255) cccTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtcc > 2:1166123‑M1/1‑36 (MQ=255) cccTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtcc < 2:247130‑M1/101‑66 (MQ=255) | CTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 162/8669‑8767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |