| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 161 | 1 = | 0 (0.000) | 77 (1.300) | 59/178 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 213 | 13 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGCCGTCCCG > 161/1‑97 | agcggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGc < 2:1546852‑M1/2‑1 (MQ=255) gcggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGcc > 1:649631‑M1/99‑101 (MQ=255) ggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtg < 2:246199‑M1/5‑1 (MQ=255) ggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtg < 1:1437504‑M1/5‑1 (MQ=255) ggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtg < 1:747250‑M1/5‑1 (MQ=255) ggtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtg < 1:120274‑M1/5‑1 (MQ=255) gtttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtgt > 1:864124‑M1/96‑101 (MQ=255) gtttcagcaacggctatggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtgt < 1:1691721‑M1/6‑1 (MQ=255) tttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCtgtg > 1:770655‑M1/95‑101 (MQ=255) ttcagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggtctccagcgccatccccgctccctgccgtcctggcaccGCCCGTGGc < 1:1102794‑M1/9‑1 (MQ=255) cagcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCt > 1:684968‑M1/92‑101 (MQ=255) gcaacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGt > 1:1521611‑M1/90‑101 (MQ=255) aacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTc > 2:1451520‑M1/88‑101 (MQ=255) aacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTc > 1:1165324‑M1/88‑101 (MQ=255) aacggctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTc < 2:472652‑M1/14‑1 (MQ=255) gctgtggtcgctatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCg > 2:1425526‑M1/84‑101 (MQ=255) ctgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGt < 2:1155532‑M1/19‑1 (MQ=255) tgtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTg < 1:307157‑M1/20‑1 (MQ=255) gtggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGc < 1:1521312‑M1/21‑1 (MQ=255) ggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAg > 2:1566831‑M1/79‑101 (MQ=255) ggtcgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAg > 1:116830‑M1/79‑101 (MQ=255) cgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTc > 1:1072320‑M1/76‑101 (MQ=255) cgccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGCTCGCCGTGCAGTTc < 1:1535768‑M1/26‑1 (MQ=255) ccatgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCAc < 1:1492176‑M1/28‑1 (MQ=255) catgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACt < 2:1182834‑M1/29‑1 (MQ=255) catgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACt < 2:1204917‑M1/29‑1 (MQ=255) catgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACt < 1:353233‑M1/29‑1 (MQ=255) catgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACt < 2:1211246‑M1/29‑1 (MQ=255) atgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACtt < 2:111484‑M1/30‑1 (MQ=255) atgttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACtt < 2:1512395‑M1/30‑1 (MQ=255) ttctgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGcc < 2:459510‑M1/33‑1 (MQ=255) tgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGccacc > 1:1115802‑M1/66‑101 (MQ=255) tgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGccacc < 2:1246980‑M1/36‑1 (MQ=255) tgtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGccacc < 1:1578496‑M1/36‑1 (MQ=255) gtctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGccacca < 1:1407570‑M1/37‑1 (MQ=255) tctgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCcaccac > 1:245038‑M1/64‑101 (MQ=255) tgccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCt > 2:747245‑M1/62‑101 (MQ=255) ccgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGc < 2:290383‑M1/42‑1 (MQ=255) cgggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGcc < 2:940492‑M1/43‑1 (MQ=255) cgggatcaccgaaaaatggttctccagcgccgtcccccctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGcc > 2:120274‑M1/59‑101 (MQ=255) gggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCa < 2:512760‑M1/44‑1 (MQ=255) ggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCAt < 1:631275‑M1/45‑1 (MQ=255) ggatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCAt < 2:290961‑M1/45‑1 (MQ=255) gatcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCAtt < 1:70873‑M1/46‑1 (MQ=255) atcaccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTc < 1:595174‑M1/47‑1 (MQ=255) caccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTccc < 2:400038‑M1/49‑1 (MQ=255) caccgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTccc > 2:1313812‑M1/53‑101 (MQ=255) accgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCg > 1:472657‑M1/52‑101 (MQ=255) accgcaaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCg > 1:1546858‑M1/52‑101 (MQ=255) caaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggtaccGCCTGGGGCTGTTCGGCGTGCTGTTCTCTTGCCCCCACCTGCCATTTCCGGTTc > 2:147240‑M1/48‑101 (MQ=255) aaaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCa < 2:1256738‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAg > 2:173911‑M1/46‑101 (MQ=255) aaatggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAg < 1:1525138‑M1/56‑1 (MQ=255) tggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGtt < 2:628065‑M1/59‑1 (MQ=255) tggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGtt < 2:85916‑M1/59‑1 (MQ=255) tggttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCCGCCATTCCCGGTTCAGGtt < 1:464497‑M1/59‑1 (MQ=255) gttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCg > 2:1437498‑M1/41‑101 (MQ=255) ttctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGCGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGCTTCGc < 1:1563473‑M1/62‑1 (MQ=255) ctccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCt < 1:632768‑M1/64‑1 (MQ=255) tccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTg > 1:606924‑M1/37‑101 (MQ=255) ccagcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGc > 2:195537‑M1/36‑101 (MQ=255) agcgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCgg < 2:1369583‑M1/68‑1 (MQ=255) cgcggtccccgctccctgccgtccgggccccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGAt > 2:137601‑M1/32‑101 (MQ=255) cgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGAt > 1:1358119‑M1/32‑101 (MQ=255) cgccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGAt > 1:1369589‑M1/32‑101 (MQ=255) gccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATg < 1:1377609‑M1/71‑1 (MQ=255) gccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATg > 2:1171640‑M1/31‑101 (MQ=255) gccgtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATg < 1:1178047‑M1/71‑1 (MQ=255) gtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGccc > 2:741157‑M1/28‑101 (MQ=255) gtccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGccc < 1:1489494‑M1/74‑1 (MQ=255) tccccgctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGcccc < 1:1423820‑M1/75‑1 (MQ=255) ccccgccccctgccgtcctgtcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCg > 2:1142913‑M1/26‑101 (MQ=255) gctccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAg > 2:26893‑M1/22‑101 (MQ=255) tccctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGca < 2:240743‑M1/82‑1 (MQ=255) cctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGcaca < 1:1250220‑M1/84‑1 (MQ=255) ctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACaa < 2:1668719‑M1/85‑1 (MQ=255) ctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACaa < 1:130919‑M1/85‑1 (MQ=255) ctgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACaa < 1:475678‑M1/85‑1 (MQ=255) tgccgtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAAt > 1:1246985‑M1/16‑101 (MQ=255) ccctcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTc > 1:993067‑M1/14‑101 (MQ=255) gtcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTcgt < 2:968411‑M1/90‑2 (MQ=255) tcctggccccGCCTGTGGCTGTTCGCGGTGCAGTCCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGcc > 1:662113‑M1/11‑101 (MQ=255) tcctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGcc > 1:1182839‑M1/11‑101 (MQ=255) cctggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGCCg > 1:1469575‑M1/10‑101 (MQ=255) tggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCgtcgtc > 1:635897‑M1/8‑101 (MQ=255) ggcaccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGTCGTcc > 1:290961‑M1/7‑101 (MQ=255) caccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGTCGTCCCg > 1:950072‑M1/5‑101 (MQ=255) caccGCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGCCGTCCCg > 1:173453‑M1/5‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGTGGCTGTTCGCCGTGCAGTTCACTTGCCACCACCTGCCATTCCCGGTTCAGGTTCGCCTGCGGATGCCCCGTCAGCACAATTCGCCGTCCCG > 161/1‑97 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |