New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | 16 | = 47452 | 53 (0.800) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGC > 16/47271‑47470 | tAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCag > 2:1320087/1‑101 (MQ=255) tAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCag < 2:1319970/101‑1 (MQ=255) tAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCag > 2:224174/1‑101 (MQ=255) agtagcaaagccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatg > 1:258075‑M1/101‑101 (MQ=255) agtagcaaagccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatg > 1:990602‑M1/101‑101 (MQ=255) gtagcaaagccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatga < 1:930006‑M1/2‑1 (MQ=255) gcaaagccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGAt > 2:136168‑M1/97‑101 (MQ=255) ccccTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCTTGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCCCCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGAt < 2:381064/100‑1 (MQ=255) acCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGAt > 2:873842/1‑101 (MQ=255) acCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGAt > 2:499999/1‑101 (MQ=255) cccTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATg < 2:140717/101‑1 (MQ=255) ccTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATgg < 1:67891/101‑1 (MQ=255) aaagccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATgg > 2:203285‑M1/95‑101 (MQ=255) cTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGc < 2:33878/101‑1 (MQ=255) cTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGc > 1:172682/1‑101 (MQ=255) cATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCg > 2:1131837/1‑101 (MQ=255) ccgctgcagagatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGa < 2:1009226‑M1/11‑1 (MQ=255) ccATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAAt < 2:145909/101‑1 (MQ=255) ccATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAAt < 2:1398385/101‑1 (MQ=255) ctcACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGtt < 1:81991/101‑1 (MQ=255) agatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTAc > 2:1439579‑M1/82‑101 (MQ=255) agatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTAc < 1:70178‑M1/20‑1 (MQ=255) gatggccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACt > 1:1503010‑M1/81‑101 (MQ=255) tgtccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTaa > 1:229646‑M1/79‑101 (MQ=255) ggCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTaa < 2:967689/101‑1 (MQ=255) gCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAAc > 2:1102039/1‑101 (MQ=255) ccgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGGTactaaaca < 2:1322413‑M1/26‑4 (MQ=255) aTTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAAccc < 2:275776/101‑1 (MQ=255) aTTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAAccc > 2:66275/1‑101 (MQ=255) cgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCg > 1:1170888‑M1/75‑101 (MQ=255) cgaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCg < 2:873176‑M1/27‑1 (MQ=255) gaatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGc < 1:1189072‑M1/28‑1 (MQ=255) aatcggttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCa < 1:1413901‑M1/29‑1 (MQ=255) aaCCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCa < 2:383390/101‑1 (MQ=255) aCCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAg < 2:1114389/101‑1 (MQ=255) aCCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAg < 2:492400/101‑1 (MQ=255) aCCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAg > 1:1451819/1‑101 (MQ=255) cgtcgtGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCg < 1:552715/101‑1 (MQ=255) tcgtGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTc > 2:593251/1‑101 (MQ=255) gttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTc < 2:431012‑M1/34‑1 (MQ=255) ttactaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTcc < 1:1174336‑M1/35‑1 (MQ=255) ctaacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGGGTCCgcg < 2:829133‑M1/38‑2 (MQ=255) taacccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCa < 2:524890‑M1/39‑1 (MQ=255) tCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGtt > 2:9259/1‑101 (MQ=255) ccgcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGACGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTa < 1:1463923‑M1/43‑1 (MQ=255) cATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTa > 2:258075/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTAt < 2:241996/101‑1 (MQ=255) tGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATc > 1:564890/1‑101 (MQ=255) gcagcgtccgccagttatctggattggcgcgcaggagtgcaccggttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATc < 1:1714366‑M1/45‑1 (MQ=255) 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aaaGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATgagatgg > 2:203285‑M2/1‑94 (MQ=255) ttgtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGCGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCtt < 1:265107‑M1/90‑1 (MQ=255) gtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCg < 1:1260172‑M1/92‑1 (MQ=255) gtacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCg > 2:1714360‑M1/10‑101 (MQ=255) tacggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGt > 2:1677056‑M1/9‑101 (MQ=255) acggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTg > 1:595000‑M1/8‑101 (MQ=255) ggaatGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCa < 2:180979‑M1/96‑1 (MQ=255) tGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGc < 1:457689‑M1/100‑1 (MQ=255) tGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGc < 1:1085242‑M1/100‑1 (MQ=255) | TAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTAGCAAAGCCGCTGCAGAGATGGCCGAATCGGTTACTAACCCGCAGCGTCCGCCAGTTATCTGGATTGGCGCGCAGGAGTGCACCGGTTGTACGGAATCTCTGCTTCGTGCAACGC > 16/47271‑47470 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |