| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 139 | = 11822 | 0 (0.000) | 432 (10.450) +TATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC |
68/124 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 458 total aligned reads displayed.
ACTGAACATAGTTAATGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 139/11725‑11822 | aCTGAACATAGTTAATGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtat < 1:753975‑M1/101‑4 (MQ=255) gAACATAGTTAATGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattga > 2:300421‑M1/1‑95 (MQ=255) gTTAATGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgtt < 1:311215‑M1/101‑14 (MQ=255) aTGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttat < 2:1170803‑M1/101‑18 (MQ=255) tGGTGCAAGAGAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatg < 1:971996‑M1/101‑19 (MQ=255) agagAATTGCGCCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagat > 2:764640‑M1/1‑76 (MQ=255) gcCTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat < 2:18326‑M1/101‑36 (MQ=255) ccTCCCAGTCGATAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg < 1:819841‑M1/101‑37 (MQ=255) tAAACAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc < 1:621883‑M1/101‑49 (MQ=255) aaCAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 2:399021‑M1/101‑51 (MQ=255) cAAAACGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgccagatgactttgtcatgcagct > 2:608733‑M1/1‑49 (MQ=255) aaaCGCAGATTTTTTTGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 2:1050530‑M1/101‑55 (MQ=255) ttGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:888109‑M1/1‑33 (MQ=255) tGCCCATTTGTCGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac < 1:996008‑M1/101‑70 (MQ=255) accgaaaccggtaatgaCTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:1455877‑M1/93‑77 (MQ=255) aaaactttggtaatgactCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcga > 1:1421033‑M1/9‑24 (MQ=255) gggcgctggtaatgacTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 2:1143637‑M1/94‑79 (MQ=255) cactcccggtaatGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 2:211984‑M1/95‑79 (MQ=255) aagccgtggtaatgacTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 1:591297‑M1/94‑79 (MQ=255) aaactttggtaatgacTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 2:1084287‑M1/94‑79 (MQ=255) ctcgttggtgatgaCTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact > 2:936227‑M1/7‑22 (MQ=255) ctcgttggtaatgaCTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact > 2:1114065‑M1/7‑22 (MQ=255) gaaacggtaATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:403952‑M1/5‑21 (MQ=255) cGGGCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:941711‑M1/1‑21 (MQ=255) ctttggtaatGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 2:1564664‑M1/97‑82 (MQ=255) ccttggtaatGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:1022446‑M1/97‑82 (MQ=255) aaacggtAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:793172‑M1/98‑82 (MQ=255) ggCGGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc < 2:1658963‑M1/101‑83 (MQ=255) cccggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc < 2:850116‑M1/99‑83 (MQ=255) aacggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 1:291776‑M1/3‑19 (MQ=255) gtggtaATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgaattaag > 1:500634‑M1/3‑18 (MQ=255) ccgGTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccg > 1:443842‑M1/2‑18 (MQ=255) ggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc > 1:1163285‑M1/1‑16 (MQ=255) ggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc > 2:685894‑M1/1‑16 (MQ=255) ggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc > 2:1355206‑M1/1‑16 (MQ=255) ggTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc > 1:177163‑M1/1‑16 (MQ=255) gTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 2:171633‑M1/101‑87 (MQ=255) gTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc > 2:481077‑M1/1‑15 (MQ=255) gTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc > 2:1522912‑M1/1‑15 (MQ=255) gTAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc > 2:63345‑M1/1‑15 (MQ=255) tAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgccttccgtccc > 2:556854‑M1/1‑14 (MQ=255) tAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc < 2:810086‑M1/101‑88 (MQ=255) tAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc < 2:1368240‑M1/101‑88 (MQ=255) tAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 1:150671‑M1/1‑14 (MQ=255) tAATGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccc > 1:1149572‑M1/1‑14 (MQ=255) aaTGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca < 2:868‑M1/101‑89 (MQ=255) aaTGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca < 1:1629419‑M1/101‑89 (MQ=255) aaTGACTCCAACTtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca < 2:147708‑M1/101‑89 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |