| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 134 | 1 = | 0 (0.000) | 54 (0.810) | 47/200 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 51 | = 15566 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTTAATAAACCGCGTCTCCAGATATTCATCAGGCTGATGAGCTT > 134/1‑98 | taggtcggataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGt < 2:363509‑M1/2‑1 (MQ=255) aggtcggataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGtt > 2:353710‑M1/99‑101 (MQ=255) gtcggataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGtttt > 2:1093430‑M1/97‑101 (MQ=255) ggataagatgcgcaagcatctcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAAt > 1:59429‑M1/94‑101 (MQ=255) ggataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAAt > 2:362484‑M1/94‑101 (MQ=255) gataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATg > 2:1067426‑M1/93‑101 (MQ=255) gataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATg > 2:1465974‑M1/93‑101 (MQ=255) ataagatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGc < 2:839361‑M1/10‑1 (MQ=255) agatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAg > 2:701295‑M1/89‑101 (MQ=255) agatgcgcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAg > 2:929622‑M1/89‑101 (MQ=255) gcaagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCaaaaa > 1:181240‑M1/83‑101 (MQ=255) aagcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATg < 2:1367043‑M1/21‑1 (MQ=255) agcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATgg < 2:912890‑M1/22‑1 (MQ=255) gcatcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGt < 1:734737‑M1/23‑1 (MQ=255) tcgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGaa < 1:364445‑M1/26‑1 (MQ=255) cgcatccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAAt > 1:939807‑M1/75‑101 (MQ=255) atccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTAc < 2:1148283‑M1/30‑1 (MQ=255) tccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTAcc > 1:315078‑M1/71‑101 (MQ=255) ccgacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCt < 1:1172752‑M1/32‑1 (MQ=255) gacattattgcggcacaggagtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTgg < 2:1365971‑M1/34‑1 (MQ=255) 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agtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACgggtgg > 1:721424‑M1/49‑101 (MQ=255) gtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACgggtggg < 2:853982‑M1/54‑1 (MQ=255) gtttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACgggtggg > 2:1231584‑M1/48‑101 (MQ=255) ttggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGtt > 1:569410‑M1/46‑101 (MQ=255) tggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGttt > 2:549332‑M1/45‑101 (MQ=255) tggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGttt < 1:810819‑M1/57‑1 (MQ=255) ggcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTta < 1:560897‑M1/58‑1 (MQ=255) gcaacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTtaa > 1:912895‑M1/43‑101 (MQ=255) caacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTtaat > 1:1169863‑M1/42‑101 (MQ=255) caacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTtaat > 1:1577669‑M1/42‑101 (MQ=255) aacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTtaata < 1:1243417‑M1/61‑1 (MQ=255) aacggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTtaata > 1:325444‑M1/41‑101 (MQ=255) cggtgccggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTTAATaaa > 2:974651‑M1/39‑101 (MQ=255) cggatgcggcgcgagcgccttatccggcctacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTTAATAAACCGCGt > 1:930527‑M1/33‑101 (MQ=255) 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tacGTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTTAATAAACCGCGTCTCCAGATATTCATCAGGCTGATGAGCtt < 2:1612833‑M1/98‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTAATGCCAGCAAAAATGGTGAATTACCTGGATAATCAACTCACGGGTGGGTTTAATAAACCGCGTCTCCAGATATTCATCAGGCTGATGAGCTT > 134/1‑98 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |