New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 121 | = 14106 | 0 (0.000) | 51 (0.910) +GGTGATGCTGCCAACT |
39/168 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GCAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 121/14006‑14106 | gCAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGaa > 2:347426/1‑101 (MQ=255) aaaatGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAg < 1:1014765‑M1/100‑2 (MQ=255) aaTGTCGCACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggt < 1:61551‑M1/101‑4 (MQ=255) aaTGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggt < 1:538741‑M1/101‑4 (MQ=255) tGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtga > 1:610854‑M1/1‑96 (MQ=255) gTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgat < 2:313235‑M1/101‑7 (MQ=255) tatctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaactt > 1:1422997‑M1/1‑84 (MQ=255) tatctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaactt > 2:653464‑M1/1‑84 (MQ=255) tatctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaactt > 1:798610‑M1/1‑84 (MQ=255) tatctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaactt > 2:563625‑M1/1‑84 (MQ=255) tctatTACATGAGTAAGGAAAATCCGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACCCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttac < 2:1540532‑M1/101‑20 (MQ=255) ctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttact > 2:374065‑M1/1‑81 (MQ=255) ctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttact < 1:1694328‑M1/101‑21 (MQ=255) ctatTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttact < 1:1627662‑M1/101‑21 (MQ=255) aCATGAGTAAGTAAAATACGCTAAAACAGGCCGGGGGGGTGCCGGCGCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggagatgctgccaaattactgattt > 2:157026‑M1/1‑76 (MQ=255) aCATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgattt > 1:1072742‑M1/1‑76 (MQ=255) cATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgattta < 1:984891‑M1/101‑27 (MQ=255) gTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgta > 2:1385064‑M1/1‑70 (MQ=255) gTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGGTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggcgatgctgccaacttactgatttagtgta > 1:1210090‑M1/1‑70 (MQ=255) aaGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 1:737771‑M1/101‑34 (MQ=255) aaGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:1039699‑M1/101‑34 (MQ=255) aGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:1520693‑M1/1‑67 (MQ=255) gAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:965356‑M1/101‑37 (MQ=255) aaaTACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:952394‑M1/1‑63 (MQ=255) aaTACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg > 1:349054‑M1/1‑62 (MQ=255) aTACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:346957‑M1/1‑61 (MQ=255) aCGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 2:1131733‑M1/101‑43 (MQ=255) cGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:1605126‑M1/101‑44 (MQ=255) cTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 1:886867‑M1/1‑56 (MQ=255) acaGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 2:1636605‑M1/101‑51 (MQ=255) caGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:802138‑M1/1‑50 (MQ=255) aGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct > 2:1428147‑M1/1‑49 (MQ=255) aGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct < 2:471347‑M1/101‑53 (MQ=255) ccGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca > 1:312922‑M1/1‑46 (MQ=255) ccGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca > 1:692750‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 1:349394‑M1/1‑45 (MQ=255) cGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 1:562674‑M1/1‑45 (MQ=255) gTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 2:610849‑M1/101‑58 (MQ=255) ggTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct < 2:1380111‑M1/101‑62 (MQ=255) ttGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc < 1:563630‑M1/101‑64 (MQ=255) cccGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 1:571955‑M1/1‑35 (MQ=255) cccGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 1:1684638‑M1/101‑67 (MQ=255) cccGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 2:1629388‑M1/101‑67 (MQ=255) gATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc > 2:702027‑M1/1‑32 (MQ=255) gAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 1:1385070‑M1/101‑75 (MQ=255) gAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 2:571950‑M1/101‑75 (MQ=255) gAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 2:509437‑M1/1‑27 (MQ=255) aaaCGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagc > 1:1102377‑M1/1‑25 (MQ=255) aaCGCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct < 2:1593394‑M1/101‑78 (MQ=255) gCTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc < 1:1464856‑M1/101‑81 (MQ=255) cTTAATATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc > 1:64945‑M1/1‑20 (MQ=255) aaTATCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 1:536653‑M1/1‑17 (MQ=255) atatCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 2:1085238‑M1/1‑16 (MQ=255) tatCATTATGGGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct > 2:1608759‑M1/1‑15 (MQ=255) ggggAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta > 1:789124‑M1/1‑6 (MQ=255) ggggAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta > 1:1137870‑M1/1‑6 (MQ=255) ggAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctact < 2:704509‑M1/101‑98 (MQ=255) | GCAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 121/14006‑14106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |