New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | 113 | 14458 = | 41 (0.620) | 32 (0.480) | 21/200 | 2.3 | 61.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 6 | = 60364 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGAGTAACGCCAACCGGTTGCTGCGGTTTAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14358‑14540 | gccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggat < 1:1512466‑M1/1‑1 (MQ=255) gccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggat < 1:385502‑M1/1‑1 (MQ=255) gccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggat > 2:105397‑M1/101‑101 (MQ=255) cggtaagcctggcgatgatgatgtgattgaaatgatgtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTg > 1:1125218‑M1/100‑101 (MQ=255) atgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggatgccgg < 2:1606009‑M1/6‑1 (MQ=255) atgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggatgccgg < 2:503095‑M1/6‑1 (MQ=255) atgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggatgccgg < 1:1245245‑M1/6‑1 (MQ=255) cggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggatgccggatg < 1:262059‑M1/9‑1 (MQ=255) ggcgtaatcgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggatgccggatgc > 1:306706‑M1/92‑101 (MQ=255) ccAACCGGTTGCTGCGGTTTAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATgc > 2:1122363/1‑101 (MQ=255) cgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATgcgg < 1:293620‑M1/12‑1 (MQ=255) cgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATgcgg > 1:1455479‑M1/90‑101 (MQ=255) gtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATgcggc < 1:105397‑M1/13‑1 (MQ=255) gtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATgcggc < 2:107909‑M1/13‑1 (MQ=255) gtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATgcggc < 2:1563777‑M1/13‑1 (MQ=255) aaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGt < 2:1151158‑M1/15‑1 (MQ=255) aaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGt < 2:599654‑M1/15‑1 (MQ=255) aaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGt < 2:62842‑M1/15‑1 (MQ=255) atgatgatgtgattgaaatgatgtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCgtt < 1:624562‑M1/16‑2 (MQ=255) aacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCgtg < 1:149229‑M1/16‑2 (MQ=255) acgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTaa < 2:1506210‑M1/17‑1 (MQ=255) gccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAAc > 1:929767‑M1/83‑101 (MQ=255) gccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAAc > 2:537370‑M1/83‑101 (MQ=255) cttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcctcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGc < 2:931334‑M1/21‑1 (MQ=255) ctgcGGTTTAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGc > 1:606938/1‑101 (MQ=255) tatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCt > 1:953772‑M1/79‑101 (MQ=255) cGGTTTAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 2:387767/101‑1 (MQ=255) atccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 1:537375‑M1/24‑1 (MQ=255) atccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 2:1614984‑M1/78‑101 (MQ=255) atccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 2:352491‑M1/78‑101 (MQ=255) atccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt < 1:1031414‑M1/24‑1 (MQ=255) tccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTa > 2:237335‑M1/77‑101 (MQ=255) ccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 2:1245127‑M1/76‑101 (MQ=255) tttAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:702261/101‑1 (MQ=255) ttgaaatgatgtaaaagacagattgcctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATcc > 2:833416‑M1/74‑101 (MQ=255) ttAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 1:1374588/1‑101 (MQ=255) ttAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc < 2:192152/101‑1 (MQ=255) ggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 1:723998‑M1/74‑101 (MQ=255) tAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:1140325/1‑101 (MQ=255) gaaatgatgtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCgg < 2:311901‑M1/30‑1 (MQ=255) aaaCCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg > 1:1613661/1‑101 (MQ=255) ccGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCt > 2:1582402/1‑101 (MQ=255) gttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtnnnntcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACg > 1:1626606‑M1/66‑101 (MQ=255) gttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACg > 1:766060‑M1/66‑101 (MQ=255) atgtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACg < 1:981291‑M1/36‑1 (MQ=255) ttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACgg < 2:800810‑M1/37‑1 (MQ=255) ttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAcga < 1:846876‑M1/37‑2 (MQ=255) gtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGt > 2:1451746‑M1/64‑101 (MQ=255) gtaaaagacagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGt < 2:1004907‑M1/38‑1 (MQ=255) ggAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGT > 2:761891‑M1/1‑101 (MQ=255) aggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagcgtcacatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCctacgagat < 1:161519‑M1/40‑5 (MQ=255) aaTAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTc > 2:298941/1‑101 (MQ=255) aagacagattacctggccggataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttccccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTAcggttgag > 1:616983‑M1/60‑98 (MQ=255) acaggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTTAGGc < 1:503877‑M1/44‑1 (MQ=255) cagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGcctacggttgagcact > 1:159980‑M1/56‑94 (MQ=255) cagattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGcctacggttgagcact > 2:1274893‑M1/56‑94 (MQ=255) aggtttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGcac < 1:1579842‑M1/46‑1 (MQ=255) agattacctggcctgataagacgcgtgagcgtcgcatcaggcatcgttcaccatTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGgcctacggttgagcactc < 2:1354713‑M1/47‑9 (MQ=255) atcatTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAgg > 2:421921/1‑101 (MQ=255) ttgtaggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCCCAGGt > 2:1432450‑M1/52‑101 (MQ=255) tGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGt < 2:214436/101‑1 (MQ=255) aggcctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGt < 2:735051‑M1/54‑1 (MQ=255) gCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTa < 1:1418130/101‑1 (MQ=255) gCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTa < 1:329292/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAg < 2:92751/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGAGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAg < 2:279172/101‑1 (MQ=255) ctgataagacgcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGc > 1:1199588‑M1/44‑101 (MQ=255) ctgctTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATa < 1:896495/101‑1 (MQ=255) ctTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGa > 2:1199583/1‑101 (MQ=255) ctTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGa > 1:1228958/1‑101 (MQ=255) gcgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGAc > 1:209718‑M1/34‑101 (MQ=255) cgtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGAcg > 2:1118260‑M1/33‑101 (MQ=255) gtaagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGacgg < 1:521053‑M1/70‑2 (MQ=255) taagcgtcgcatcaggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAgacggg < 1:459763‑M1/71‑3 (MQ=255) aGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGAcgcg < 2:679153/101‑1 (MQ=255) tGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAG < 1:1327784‑M1/101‑1 (MQ=255) 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gctcggatgccggatGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggt < 1:570235‑M2/94‑12 (MQ=255) gctcggatgccggatGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggt > 2:970900‑M2/8‑90 (MQ=255) gCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggt < 2:1642240‑M2/101‑12 (MQ=255) gCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggt > 1:1595432‑M2/1‑90 (MQ=255) gCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggt < 1:1446184‑M2/101‑12 (MQ=255) cggatgccgGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgct > 2:1315823‑M2/5‑87 (MQ=255) gttgcCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGggagcatttgtaggcctgataagacgcggcaagcgtcgcatcaggcattggcgcggccaaac < 1:655931‑M1/99‑63 (MQ=255) aCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTgatacggttttcgttggccggattaagcacatccggccattaattaagcttcagccgcca < 2:896626‑M1/101‑61 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTgatacggttttcgttggccggattaagcacatccggccattaattaagcttcagccgccag > 1:1713743‑M1/1‑40 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGggagcatttgtaggcctgataagacgcggcaagcgtcgcatcaggcattggcgcggccaaacat > 2:445550‑M1/1‑37 (MQ=255) | TGAGTAACGCCAACCGGTTGCTGCGGTTTAAACCGAAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTAAGCGTCGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14358‑14540 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |