| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 11 | = 24880 | 8 (0.120) | 68 (1.050) | 51/194 | 0.2 | 94.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 5 | 4 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCT > 11/24780‑24980 | cTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC < 2:1306692‑M1/101‑1 (MQ=255)cTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC > 2:34202‑M1/1‑101 (MQ=255)agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACTccc > 1:1531378‑M1/90‑101 (MQ=255)agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACTccc < 1:1680231‑M1/12‑1 (MQ=255)agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTccc < 2:549020‑M1/12‑1 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACTCCCCg < 2:862541‑M1/14‑1 (MQ=255) attgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACTCCCcgc < 2:258733‑M1/15‑2 (MQ=255) attgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCgg < 1:1034711‑M1/15‑1 (MQ=255) attgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCgg < 1:234206‑M1/15‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCata > 2:1415242‑M1/1‑98 (MQ=255) gCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataag < 1:1592017‑M1/101‑6 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGttt > 1:1039120‑M1/84‑101 (MQ=255) ctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACtccccgcacaa < 1:887447‑M1/19‑6 (MQ=255) ctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTACtccccgcacaa < 2:167318‑M1/19‑6 (MQ=255) gaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATTactccccgcacaacg < 2:209210‑M1/21‑8 (MQ=255) gTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgct < 1:290052‑M1/101‑10 (MQ=255) accagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGttttttt > 2:646267‑M1/80‑101 (MQ=255) tACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaac < 1:739947‑M1/101‑13 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTAc > 1:196987‑M1/78‑101 (MQ=255) agttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACg < 1:247372‑M1/25‑1 (MQ=255) agttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACg > 1:1488786‑M1/77‑101 (MQ=255) gttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc > 2:467424‑M1/76‑101 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGcc < 1:515993‑M1/27‑1 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa < 2:35758‑M1/32‑1 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa < 1:1600064‑M1/32‑1 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa < 1:311448‑M1/32‑1 (MQ=255) gagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 2:1403842‑M1/34‑1 (MQ=255) agagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc > 2:616511‑M1/67‑101 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:293096‑M1/36‑1 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa > 1:1351327‑M1/66‑101 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg > 1:1364512‑M1/65‑101 (MQ=255) taattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCt > 2:552747‑M1/63‑101 (MQ=255) tGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccat < 2:822585‑M1/101‑29 (MQ=255) attcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:1094560‑M1/41‑1 (MQ=255) attcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:259208‑M1/41‑1 (MQ=255) gtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa > 1:296073‑M1/1‑68 (MQ=255) gtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa > 1:158078‑M1/1‑68 (MQ=255) tcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCt > 1:210618‑M1/56‑101 (MQ=255) ggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc > 1:783584‑M1/54‑101 (MQ=255) cTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa < 2:158078‑M1/101‑37 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat < 2:1680333‑M1/101‑38 (MQ=255) gTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 2:1199820‑M1/1‑63 (MQ=255) cagtttaaatcatatcagccgtaatcccccaccccttaagtaagcgtttttGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg > 1:338210‑M1/52‑101 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCggg < 2:500668‑M1/51‑1 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCggg < 2:324754‑M1/51‑1 (MQ=255) cgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGc < 2:1197884‑M1/52‑1 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcga > 2:658037‑M1/1‑60 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgac < 1:728581‑M1/101‑43 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAc < 1:1421544‑M1/55‑1 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 1:826890‑M1/101‑44 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 1:1184578‑M1/101‑44 (MQ=255) gTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc > 1:749053‑M1/1‑57 (MQ=255) tCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcc > 1:1167085‑M1/1‑56 (MQ=255) cAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcct > 1:600457‑M1/1‑55 (MQ=255) atcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCANCNAATGNCTGCGGGCGNCCaa < 2:689714‑M1/58‑1 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggt < 2:592113‑M1/101‑51 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtg > 1:1667597‑M1/1‑50 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaaa < 2:160119‑M1/63‑1 (MQ=255) tcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAAt > 2:150957‑M1/38‑101 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcc < 2:1484323‑M1/101‑54 (MQ=255) aCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgactcg > 2:814643‑M1/1‑45 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaag > 1:582116‑M1/1‑40 (MQ=255) taccacaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAg < 2:604936‑M1/74‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagac < 2:512987‑M1/101‑64 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat > 1:1652211‑M1/1‑35 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat < 1:806761‑M1/101‑67 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat < 2:296073‑M1/101‑67 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGatat < 2:1095171‑M1/78‑1 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcc > 2:1068663‑M1/1‑32 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAc > 2:1232542‑M1/19‑101 (MQ=255) ccATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc < 2:836669‑M1/101‑72 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAcc < 1:359983‑M1/84‑1 (MQ=255) atacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgc > 2:717829‑M1/1‑28 (MQ=255) gttagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAg > 1:1533301‑M1/13‑101 (MQ=255) tagcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCt < 2:1138626‑M1/91‑1 (MQ=255) cggatatgcggggattaCTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt < 1:1072575‑M1/93‑80 (MQ=255) ggatatgcggggattACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttc < 1:409008‑M1/94‑81 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttc < 2:1598599‑M1/101‑81 (MQ=255) gcgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTa > 1:35758‑M1/9‑101 (MQ=255) cgcttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTAt > 2:447429‑M1/8‑101 (MQ=255) atatgcggggaTTACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa > 1:901337‑M1/6‑19 (MQ=255) tcttagGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGCCCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg > 2:1057420‑M1/7‑101 (MQ=255) cttatGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGc > 1:549025‑M1/6‑101 (MQ=255) atgcgggGATTACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt > 1:1249962‑M1/4‑17 (MQ=255) atgcgggGATTACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt < 1:988838‑M1/98‑85 (MQ=255) tgcggGGATTACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattg < 1:853404‑M1/99‑86 (MQ=255) cGGGGATTACTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcg > 2:1607011‑M1/1‑14 (MQ=255) atGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAAt > 1:33020‑M1/3‑101 (MQ=255) atGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAAt < 1:711752‑M1/99‑1 (MQ=255) gggATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtt > 2:955018‑M1/1‑12 (MQ=255) ggATAATTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttt > 1:1585063‑M1/1‑11 (MQ=255) GGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAgc < 1:1238829‑M1/101‑1 (MQ=255) aaTTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgta > 2:40998‑M1/1‑7 (MQ=255) aaTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGccn < 1:689719/101‑2 (MQ=255) aTTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag < 2:1132248‑M1/101‑96 (MQ=255) aTTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag < 1:1652975‑M1/101‑96 (MQ=255) ttCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtagg > 2:1065317‑M1/1‑5 (MQ=255) tCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgct > 2:485793/1‑101 (MQ=255) ccccGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCTCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctg > 2:1229028/1‑101 (MQ=255) cccGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctgc > 2:1365004/1‑101 (MQ=255) | CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCT > 11/24780‑24980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |