New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 108 | = 15407 | 0 (0.000) | 74 (1.320) +GGTGATGCTGCCAACT |
60/168 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
ATCGTCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 108/15309‑15407 | aTCGTCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGgg < 1:87046‑M1/101‑3 (MQ=255) gTCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtga < 2:687769‑M1/101‑6 (MQ=255) tCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATATCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgat < 1:111902‑M1/101‑7 (MQ=255) tCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgat < 2:1647822‑M1/101‑7 (MQ=255) ccACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatg < 1:1323993‑M1/101‑8 (MQ=255) cTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctg > 2:1624518‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctg > 2:155708‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctg > 2:1168988‑M1/1‑91 (MQ=255) gAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgcca < 1:1475854‑M1/101‑14 (MQ=255) aaaaTCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaa > 2:994065‑M1/1‑87 (MQ=255) aaaTCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaac < 1:892787‑M1/101‑16 (MQ=255) aaaTCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaac < 1:117067‑M1/101‑16 (MQ=255) cATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttac < 1:1586561‑M1/101‑20 (MQ=255) cATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttac < 1:1169869‑M1/101‑20 (MQ=255) tatCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGCCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactg > 2:1215077‑M1/1‑80 (MQ=255) tCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgat < 1:224771‑M1/101‑24 (MQ=255) cTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:361117‑M1/101‑25 (MQ=255) aTTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTTGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:1462238‑M1/101‑28 (MQ=255) aTTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttag > 2:1384407‑M1/1‑74 (MQ=255) ttGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:323609‑M1/1‑73 (MQ=255) ttGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagt < 2:547402‑M1/101‑29 (MQ=255) cTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgta > 2:1352447‑M1/1‑70 (MQ=255) tCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:1204274‑M1/101‑33 (MQ=255) cGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:1437224‑M1/101‑34 (MQ=255) cGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:107872‑M1/101‑34 (MQ=255) gACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:456374‑M1/101‑35 (MQ=255) gACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:1440004‑M1/1‑67 (MQ=255) aCCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 1:1129239‑M1/1‑66 (MQ=255) cATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:823234‑M1/1‑64 (MQ=255) aTAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:464074‑M1/1‑63 (MQ=255) aTAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt < 2:821181‑M1/101‑39 (MQ=255) aaCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:495144‑M1/101‑41 (MQ=255) aaCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:1125389‑M1/1‑61 (MQ=255) aaCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:534996‑M1/1‑61 (MQ=255) aCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 2:1026829‑M1/101‑42 (MQ=255) aCGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 2:1424654‑M1/1‑60 (MQ=255) cGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:259033‑M1/101‑43 (MQ=255) cGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt > 2:223735‑M1/1‑59 (MQ=255) gTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 2:1719416‑M1/101‑44 (MQ=255) tttAAAAACGTCGTTTTGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:1311063‑M1/101‑45 (MQ=255) tttAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:1340664‑M1/101‑45 (MQ=255) tttAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:1144801‑M1/101‑45 (MQ=255) tttAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 1:1297276‑M1/1‑57 (MQ=255) tAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga < 1:678524‑M1/101‑47 (MQ=255) aaaaCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 2:113944‑M1/101‑49 (MQ=255) aaaaCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:553787‑M1/101‑49 (MQ=255) aaaaCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:906613‑M1/1‑53 (MQ=255) aaaaCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:823239‑M1/101‑49 (MQ=255) aaaCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 2:829356‑M1/101‑50 (MQ=255) aaaCGTCGTTTGGTTATCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgcttttgaggg > 2:274887‑M1/1‑52 (MQ=255) aCGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:833855‑M1/1‑50 (MQ=255) gtcgtTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc < 1:1183037‑M1/101‑54 (MQ=255) tcgtTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc < 2:1546898‑M1/101‑55 (MQ=255) tcgtTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc > 2:85860‑M1/1‑47 (MQ=255) cgtTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:1182508‑M1/101‑56 (MQ=255) gtTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 1:1478036‑M1/1‑45 (MQ=255) ttCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 1:1228406‑M1/1‑39 (MQ=255) tctctcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc > 2:599025‑M1/1‑38 (MQ=255) ctctcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct < 1:1068166‑M1/101‑65 (MQ=255) ctcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 2:471949‑M1/101‑67 (MQ=255) ctcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 1:1346508‑M1/101‑67 (MQ=255) tcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt > 1:240785‑M1/1‑34 (MQ=255) tcAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt < 1:200962‑M1/101‑68 (MQ=255) aGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 2:148192‑M1/101‑70 (MQ=255) gTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct > 2:810726‑M1/1‑31 (MQ=255) gTCTTCCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgattctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 2:1672629‑M1/101‑71 (MQ=255) tCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta > 1:1370676‑M1/1‑30 (MQ=255) tttCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatc < 1:265807‑M1/101‑74 (MQ=255) ttCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 1:1551136‑M1/101‑75 (MQ=255) ttCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 1:639596‑M1/101‑75 (MQ=255) ttCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 2:1091207‑M1/101‑75 (MQ=255) ccccGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagc < 2:906608‑M1/101‑77 (MQ=255) ccccGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagc < 1:76757‑M1/101‑77 (MQ=255) ccGTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg < 2:853306‑M1/101‑79 (MQ=255) gTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc > 1:513433‑M1/1‑21 (MQ=255) gTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc > 1:1184651‑M1/1‑21 (MQ=255) gTTGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc > 2:1704616‑M1/1‑21 (MQ=255) tGAGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc < 1:1278443‑M1/101‑83 (MQ=255) aGCTCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 2:453352‑M1/101‑85 (MQ=255) tCGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:157706‑M1/101‑88 (MQ=255) cGTTTACAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt < 2:1129234‑M1/101‑89 (MQ=255) cAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct < 2:1478030‑M1/101‑95 (MQ=255) cAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct < 2:1255251‑M1/101‑95 (MQ=255) cAACCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct > 2:1559713‑M1/1‑7 (MQ=255) aaCCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 1:994070‑M1/101‑96 (MQ=255) aCCTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac < 2:1136274‑M1/101‑97 (MQ=255) | ATCGTCCACTTGAAAATCATATCTTATTGCTCGACCATAACGTTTAAAAACGTCGTTTGGTTCTCTCAGTCTTTCCCCGTTGAGCTCGTTTACAACCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 108/15309‑15407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |