| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 10 | = 54363 | 0 (0.000) | 53 (0.890) +GCTGCCGGATG |
37/178 | 0.8 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 44 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 10/54263‑54363 | tcaggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACg > 2:1558977‑M1/59‑101 (MQ=255) aggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAacggc < 1:881466‑M1/45‑3 (MQ=255) ggcaacggctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCaacggct > 1:962737‑M1/56‑98 (MQ=255) caacggctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGgcaacggctgc > 1:715929‑M1/54‑96 (MQ=255) cGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcg > 1:372557‑M2/1‑94 (MQ=255) cGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcg < 1:930002‑M2/101‑8 (MQ=255) cggctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATcaggcaacggctgccgg > 2:449680‑M1/51‑93 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggat > 2:1438471‑M2/1‑91 (MQ=255) cggcgTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaa > 2:105552‑M2/1‑81 (MQ=255) ggcgTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTGCCGGTTTGTAGGCCTGAAAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaac > 2:18871‑M2/1‑80 (MQ=255) gcgTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacg < 1:1309161‑M2/101‑23 (MQ=255) cgTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgc < 2:979059‑M2/101‑24 (MQ=255) gTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgcc < 2:724885‑M2/101‑25 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttat > 1:440275‑M2/1‑73 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttat > 1:1491191‑M2/1‑73 (MQ=255) cGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatcc > 2:1619965‑M2/1‑71 (MQ=255) cttatccgaCCTACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgac < 1:366310‑M1/97‑34 (MQ=255) atcCGACCTACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgaccta > 2:1655452‑M1/2‑65 (MQ=255) ccGACCTACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacg < 1:1217743‑M1/101‑39 (MQ=255) gCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggt < 1:282682‑M2/101‑41 (MQ=255) acctACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggtt < 2:1198322‑M2/100‑42 (MQ=255) acctACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggtt > 1:551402‑M1/2‑60 (MQ=255) ccTACGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggtta < 1:789877‑M2/101‑43 (MQ=255) cTACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttat > 1:593916‑M1/1‑58 (MQ=255) tACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttat > 2:1360672‑M2/1‑58 (MQ=255) tACGGTTATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatg > 2:1369894‑M1/1‑57 (MQ=255) aCGGTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgt > 1:1047757‑M2/1‑56 (MQ=255) gTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttc < 1:1619971‑M2/101‑48 (MQ=255) gTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttc < 2:804387‑M2/101‑48 (MQ=255) gTTATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggctatgttcc < 2:544037‑M2/101‑49 (MQ=255) ttATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttcc < 2:709411‑M2/101‑49 (MQ=255) tATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccg < 2:1217738‑M2/101‑50 (MQ=255) tATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgt < 2:487594‑M2/101‑51 (MQ=255) tATGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgt < 1:810192‑M2/101‑51 (MQ=255) tATGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctgg < 1:1493376‑M1/101‑51 (MQ=255) aTGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtt < 2:943626‑M2/101‑52 (MQ=255) aTGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtt < 1:1230956‑M2/101‑52 (MQ=255) aTGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggc > 2:872089‑M1/1‑50 (MQ=255) tGTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgttt > 2:95370‑M2/1‑49 (MQ=255) tGTTCC‑GTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggct < 1:69512‑M1/101‑53 (MQ=255) gTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgttt > 1:1102001‑M2/1‑49 (MQ=255) gTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttg > 2:594132‑M2/1‑48 (MQ=255) gTTCCG‑TTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttg > 1:197323‑M2/1‑48 (MQ=255) ttccgtttgTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcg < 2:1658949‑M1/97‑55 (MQ=255) tccgtttGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgta > 2:1306465‑M2/4‑46 (MQ=255) tccgtttGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgta < 2:902088‑M2/98‑56 (MQ=255) ccgttTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtag > 1:1028234‑M2/3‑45 (MQ=255) ccgttTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtag > 2:527894‑M2/3‑45 (MQ=255) ggTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtagg < 1:611745‑M2/101‑58 (MQ=255) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttgg > 1:1075473‑M1/1‑43 (MQ=255) tGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcct > 2:183977‑M1/1‑40 (MQ=255) tGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctg < 1:458985‑M2/101‑62 (MQ=255) tGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggccta < 1:1638098‑M2/101‑62 (MQ=255) tAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgat > 1:1149722‑M2/1‑38 (MQ=255) aGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgata > 1:1135897‑M2/1‑37 (MQ=255) 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tGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacg > 1:1516574‑M2/1‑32 (MQ=255) gATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgc < 2:369317‑M2/101‑71 (MQ=255) gATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacg < 1:701820‑M1/101‑71 (MQ=255) aTAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgca < 2:424804‑M2/101‑72 (MQ=255) aTAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgca < 2:1697328‑M2/101‑72 (MQ=255) tAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcac < 2:800370‑M2/101‑73 (MQ=255) aaGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcaca < 1:338046‑M2/101‑74 (MQ=255) 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caGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgca > 1:1419139‑M2/1‑20 (MQ=255) aGCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatga < 1:1369900‑M1/101‑83 (MQ=255) gCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgag < 1:1286597‑M1/101‑84 (MQ=255) gCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgag < 1:1655458‑M1/101‑84 (MQ=255) gCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgag < 2:1249171‑M1/101‑84 (MQ=255) gCGTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgag > 1:139648‑M1/1‑18 (MQ=255) gTCGCATCAGGCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcag < 2:1286591‑M2/101‑86 (MQ=255) 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cAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggca < 1:1605753‑M1/101‑93 (MQ=255) cAGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggca < 2:1505865‑M1/101‑93 (MQ=255) aGTCAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggc > 1:424809‑M2/1‑8 (MQ=255) aGGCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggc < 1:881466‑M2/101‑94 (MQ=255) aGGCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctttgagattggggcaa > 1:781785‑M1/1‑8 (MQ=255) ggCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggct > 1:962737‑M2/1‑7 (MQ=255) gCAACGgctgtcggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctg > 2:818088‑M2/1‑6 (MQ=255) gCAACGgctgccggatgcggcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggcaatt < 2:70656‑M1/101‑96 (MQ=255) cAACGgctgccggatgcggcgtaaacgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgc > 1:715929‑M2/1‑5 (MQ=255) aaCGgctgccggatgcgtcgtgaacgccctatccgacctacggttatgttctggctcgttggcctttggcaacgattatcctatgagattggggcaattac < 2:926766‑M1/101‑98 (MQ=255) | TTTTTTACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTGTCCGGCCTACGGTTATGTTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 10/54263‑54363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |