| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 5 | = 1347 | 70 (1.050) | 69 (1.480) +TTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCC |
49/140 | 0.0 | 73.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 97 | = 17078 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 5/1248‑1347‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGGATAAACCGGTCATCACGATGAATCAAAATTTCGCCCAGCTGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGCTTCTCCACCGTTTGGCGAATCG < 97/17078‑16980 |||||||||||||||||||||||||||||| GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTT < 2:576226/101‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTT > 1:508350/1‑101 CCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTC > 2:41212/1‑101 CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCC > 2:1431572/1‑101 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TTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGG > 1:170002/1‑101 TTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGG > 1:1291212/1‑101 TCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGG > 1:243667/1‑101 TCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGAT < 1:328372/101‑1 CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATA < 2:502901/101‑1 CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATA < 1:1530623/101‑1 GGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAA < 2:404259/101‑1 ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACC > 1:1130068/1‑101 ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACC > 2:1297678/1‑101 GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGG < 2:1384901/101‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGT < 2:18989/101‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGT < 2:513184/101‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGT > 1:1691916/1‑101 TAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTC < 2:1080673/101‑1 AAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCA > 1:686046/1‑101 AAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCA < 1:106995/101‑1 AATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCAT > 2:400957/1‑101 AATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCAT > 1:1113360/1‑101 ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATC > 1:1201888/1‑101 tcattaCAGGCGTAATACCACACCTGTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCTCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATCA < 2:256411/95‑1 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATCA < 1:1520267/101‑1 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATCAC < 1:663611/101‑1 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATCAC < 2:1355920/101‑1 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTTTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGGTCATCAC < 2:1570196/101‑1 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GGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 5/1248‑1347‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGGATAAACCGGTCATCACGATGAATCAAAATTTCGCCCAGCTGTGTTCCCCGCGCCAGCGGGGATAAACCGCTTCTCCACCGTTTGGCGAATCG < 97/17078‑16980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |