New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 5 | 1 = | 0 (0.000) | 72 (1.080) | 53/200 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 70 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 5/98‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT > 70/1‑97 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATG > 1:611822/1‑101 ACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTT > 2:419059/1‑101 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTT > 1:75849/1‑101 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTT > 2:12612/1‑101 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTT < 2:167931/101‑1 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTT < 1:12612/101‑1 AAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTC > 2:685037/1‑101 AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACA > 1:859699/1‑101 agTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT < 1:999562/99‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT > 1:1557/1‑101 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT < 1:1061270/101‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT < 2:1519514/101‑1 TGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTC > 2:1060399/1‑101 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCA < 2:1605250/101‑1 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCA > 2:1617886/1‑101 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAAC < 2:851312/101‑1 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAAC < 1:1163569/101‑1 GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACG > 1:894229/1‑101 ACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCC < 2:1581732/101‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGA < 1:1402223/101‑1 CGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAG < 1:1579497/101‑1 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGA > 2:1031088/1‑101 CATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAG < 1:183055/101‑1 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGTTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGA > 2:59781/1‑101 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGA < 1:1701236/101‑1 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGA < 1:1711169/101‑1 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGGCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGA > 2:1535790/1‑101 TCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAG < 1:1631163/101‑1 CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGG < 1:1708379/101‑1 TCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAA < 1:279945/101‑1 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCATATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAAT < 1:533774/101‑1 ACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATT < 1:27760/101‑1 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAA < 1:1617892/101‑1 GCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGG < 1:326712/101‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGG > 2:1122889/1‑101 AGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGAT < 1:39137/101‑1 GTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAA > 2:542989/1‑101 GTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAA < 1:1184124/101‑1 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATC > 1:308064/1‑101 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCC > 2:1452701/1‑101 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCC > 1:157095/1‑101 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTACCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGACATAAAATCCC > 1:1656750/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAATTCCCC > 1:149306/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCC > 2:246514/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCC > 1:161103/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCC > 2:1518595/1‑101 TTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCC > 2:1337784/1‑101 TTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCC > 2:321050/1‑101 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT > 2:753724/1‑101 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTG > 1:613241/1‑101 TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGT < 2:34216/101‑1 GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTT < 1:1031093/101‑1 GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTT < 1:1383592/101‑1 GTTTAACCGTTAACGTAGCGCTTATGCGATTTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTA < 2:765608/101‑1 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTA > 2:1596557/1‑101 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTA < 1:624046/101‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACT > 2:1651686/1‑101 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTA > 2:513485/1‑101 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAA > 2:1635566/1‑101 AAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTAT < 1:87117/101‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTAT < 1:123461/101‑1 GTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGG > 2:44721/1‑101 GCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAAT > 2:1561473/1‑101 CTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGT < 1:1430111/101‑1 TTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTT > 2:246367/1‑101 TATGGGATGTTTCCCCCACATTCAGCGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTA < 1:693820/101‑1 TATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTA < 1:1029825/101‑1 ATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAA < 1:725506/101‑1 ATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAA < 1:419064/101‑1 TGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT < 2:40653/101‑1 TGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT < 1:456516/101‑1 TGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT < 2:982904/101‑1 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 5/98‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCTTTTTGGTTAACTAATTGTATGGGAATGGTTAAT > 70/1‑97 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |