New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 43 | 7 = | 0 (0.000) | 58 (0.880) +A |
47/198 | 0.3 | 62.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 5 | = 1333 | 71 (1.070) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 43/104‑7 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC < 5/1333‑1234 | TCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACT > 1:171546/1‑101 TTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAA > 2:1207994/1‑101 TAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAAC > 2:1285075/1‑101 AGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACT < 1:1643634/101‑1 AGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACT > 1:813652/1‑101 GTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTT > 1:368663/1‑101 TTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTA < 2:366915/101‑1 TTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAA < 2:1079165/101‑1 TTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTT > 1:66677/1‑101 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 2:961505/101‑1 GGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:1402641/101‑1 GTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 2:1533094/101‑1 GTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGCTGTGGTATTA < 2:1145806/101‑1 TAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 2:690297/1‑101 TAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:1691236/101‑1 TAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:1534066/101‑1 ATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 1:703336/1‑101 CAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 1:775427/101‑1 ATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 1:608722/101‑1 ATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 2:368450/101‑1 GACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 1:497896/101‑1 GACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT < 2:224721/101‑1 ACTGTTCTTCACGCCATCTATTAACATGTTCGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 2:919793/101‑1 CTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 2:1389500/101‑1 GTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG > 1:986759/1‑101 GTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACG < 1:257282/101‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 2:1602978/1‑101 GCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTG < 1:471006/101‑1 GCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA > 2:1312201/1‑101 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAA > 2:1038352/1‑101 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAA > 1:490450/1‑101 ATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATT < 2:88345/101‑1 TATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT > 1:913939/1‑101 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:1312207/101‑1 GTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:807757/101‑1 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA < 1:1175865/101‑1 GTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 2:1681825/101‑1 GTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 1:607586/101‑1 CAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT < 1:860304/101‑1 AGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 2:1598289/101‑1 GTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA < 1:855839/101‑1 GTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA < 2:551960/101‑1 TATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAG < 2:813647/101‑1 TATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCA < 2:979346/101‑1 TATGGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATCACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCA < 2:113711/101‑1 GGGGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT > 1:358209/1‑101 GGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTNTCNCGATANCTGGTCAGCAATTCT > 2:855884/1‑101 GGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCT > 1:302359/1‑101 GGATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCT < 2:44487/101‑1 ATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGG < 1:1580854/101‑1 ATGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGG > 2:1657960/1‑101 TGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC > 1:1321690/1‑101 TGTTTCCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC > 1:1180163/1‑101 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 2:224254/101‑1 CCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:363837/101‑1 ATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGG < 2:339286/101‑1 CACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGC > 1:1695951/1‑101 CACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGC > 2:393643/1‑101 ACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC > 2:25553/1‑101 ACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC > 1:1139841/1‑101 | TCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 43/104‑7 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC < 5/1333‑1234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |