| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 222 | 1 = | 0 (0.000) | 72 (1.080) | 55/200 | 0.2 | 99.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 6 | = 51305 | 1 (0.020) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
TTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 222/94‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTT < 6/51305‑51209 TTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTT < 1:1161922/101‑1 CACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTAT < 1:1254888/101‑1 ACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATC < 2:554641/101‑1 ACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGAATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGATATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGAACAGCTGGTTATC > 1:1233005/1‑101 CGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCT < 1:873684/101‑1 CTTCGAGGCGCTGTTCAAAAGGGAATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCTTTTCATCGTCCAACAAAATGGGGGCAGTACAGCTGGTTATCTCCT > 2:557136/1‑101 CTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCT > 1:34426/1‑101 CTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCT > 2:991967/1‑101 TTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACATCTGGTTATCTCCTT < 1:1409690/101‑1 TTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTT > 1:1602899/1‑101 TCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTG > 2:347654/1‑101 CAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGC > 1:531538/1‑101 AAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCT < 1:525617/101‑1 GGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGG < 1:991972/101‑1 CTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGc < 1:1113175/101‑2 CTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGT < 2:858141/101‑1 CTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGT > 2:975137/1‑101 TTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTG < 1:434315/101‑1 TTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGT < 1:1071659/101‑1 TTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGT > 1:350192/1‑101 CAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT > 2:776024/1‑101 CAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTT < 1:491360/101‑1 AAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTG < 1:615972/101‑1 GTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCT < 2:442259/101‑1 GTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCT < 1:686715/101‑1 ATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCT > 1:1044829/1‑101 ATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCT > 2:1213579/1‑101 ATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCT > 1:725284/1‑101 TTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA < 1:333147/101‑1 TTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGCTTGTTCTCTCTATT > 2:1700534/1‑101 GCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAT < 2:89862/101‑1 GCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAT < 2:962882/101‑1 TTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTG > 1:1303106/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTTGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTAT > 2:645218/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTAT > 2:336609/1‑101 ATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTAT > 2:210969/1‑101 TATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATA < 2:882151/101‑1 ATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATAT < 2:69229/101‑1 ATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATAT > 2:1053091/1‑101 ATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATAT < 1:1716984/101‑1 TTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATG < 2:1014756/101‑1 TAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGC < 2:1203799/101‑1 TAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGC > 1:1685115/1‑101 GGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATAAGCGC > 2:228396/1‑101 CTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAAT < 2:512625/101‑1 CTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAAT < 1:603352/101‑1 ATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAC > 2:1078463/1‑101 TTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACG > 2:713255/1‑101 CCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAG < 2:1303100/101‑1 CCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAG < 1:347654/101‑1 TTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCA < 2:458335/101‑1 TCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAA > 1:1622658/1‑101 CATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAA > 2:720731/1‑101 CATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAA > 1:886681/1‑101 ATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAG > 2:221838/1‑101 ATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAG > 1:1637609/1‑101 TCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATAGGCGCGAATACGAGGGCAAAGG < 2:1193171/101‑1 AACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGC < 2:703231/101‑1 ACAAAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCG < 1:1394816/101‑1 AAATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCG > 2:1121999/1‑101 ATGGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGAT < 2:906791/101‑1 GGGTGCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGG < 1:177051/101‑1 GCAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTT < 2:666300/101‑1 CAGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTC > 1:1133866/1‑101 AGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCTCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCT < 1:263790/101‑1 AGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCT < 1:1226422/101‑1 AGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCT < 1:111261/101‑1 AGTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCT > 2:1462655/1‑101 GTACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTT < 2:228801/101‑1 TACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTT > 2:627130/1‑101 TACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTT < 1:3606/101‑1 TACAGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTT > 1:523072/1‑101 TTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 222/94‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAAAGGCGCGGCGGCGATGGGCTTCTTT < 6/51305‑51209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |