| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 218 | = 1999 | 0 (0.000) | 55 (0.980) +GGTGATGCTGCCAACT |
46/168 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 218/1900‑1999‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |||||||||||||||| ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTG < 2:304270/101‑1ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTG < 2:59690/101‑1 CGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGA > 1:10509/1‑101 ATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATG > 2:1102349/1‑101 ATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATG < 2:824009/101‑1 TTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCT < 1:248300/101‑1 ATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCC > 1:245737/1‑101 ATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCC > 1:1088544/1‑101 TCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCA < 1:445327/101‑1 CTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAAn < 1:1378940/101‑2 TGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACT > 1:1436566/1‑101 TGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:870881/1‑101 GGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:203953/101‑1 GAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:1462845/1‑101 TGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:1455563/101‑1 GGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 2:811805/101‑1 GGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 2:19926/101‑1 CAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:1624258/101‑1 AGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 2:78306/1‑101 GCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:1244711/101‑1 GTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 2:634668/1‑101 TTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 2:1351060/101‑1 TAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:1423603/1‑101 TAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:479968/101‑1 TAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 2:1646112/1‑101 AATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:394791/101‑1 TCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGTCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:1059922/101‑1 AAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:184258/1‑101 AAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:1062143/1‑101 AACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:938132/101‑1 ACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:761068/101‑1 CCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:119969/1‑101 GATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:1467267/1‑101 ATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 2:1676897/1‑101 TTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:973136/101‑1 TTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:245737/101‑1 TTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:35446/101‑1 TGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 1:625195/1‑101 GAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:585092/101‑1 AAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGCTTTTCCTGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGCCTGATGGGGATTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:1157613/1‑101 AGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 1:1461312/101‑1 AGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 1:90964/101‑1 AGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 2:10509/101‑1 GGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 2:1695430/1‑101 GGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 2:455370/101‑1 GATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:1505524/1‑101 TTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 2:1102245/1‑101 TAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:1222926/101‑1 GGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT < 2:870876/101‑1 GTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 2:888769/101‑1 TGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 2:761512/101‑1 CAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG < 2:1462839/101‑1 CAACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG > 2:1457751/1‑101 AACGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:922380/1‑101 ACGTTAATTGCTGATTTTGCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:908129/101‑1 CGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:422559/1‑101 CGTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:539113/1‑101 GTTAATTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:62553/1‑101 TTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 1:933942/1‑101 TTGCTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < 2:1326154/101‑1 CTGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:441211/1‑101 TGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 2:1087854/1‑101 TGATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 1:951249/1‑101 ATTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATATCGGGTATGATGGTGCTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTGCCTCCTTTTCAGC > 2:237701/1‑101 TTTTCCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT < 2:1390434/101‑1 CCTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 1:1676903/101‑1 |||||||||||||||| ATGCCGATTTCATCCTGATGACTGGTGAACTGGCAGCGTTAATTCAAAACCTGATTGAAGGATTAGGTGGCGAAGCACAACGTTAATTGCTGATTTTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 218/1900‑1999‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |