New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 2 | 55659 = | 45 (0.680) | 30 (0.490) | 19/184 | 2.6 | 59.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 70 | = 22841 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CTCAGGCAACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTACGTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTATTGTAAGCTCCTGGAG‑TTCACTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 2/55766‑55659 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcactcgTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTT < 70/22841‑22743 CTCAGGCAACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGCCTACGTTCGTTCACCGCAGCCACTTACTATTCTAAGCTCGTGGAG‑T > 1:537041/1‑101 GGCAACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTACGTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTATTGTAAGCTCCTGGAG‑TTCAC < 1:1261112/101‑1 CAACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTACGTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTATTGTAAGCTCCTGGAG‑TTCACTC < 1:1341572/101‑1 AACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTACGTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTATTGTAAGCTCCTGGAG‑TTCACTCG < 1:1379231/101‑1 GTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTA < 1:1093437/101‑1 GCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATG > 1:1133346/1‑101 gctgcaTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAAT > 1:459052/7‑101 ctgcaTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATT < 1:623369/96‑1 caTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGT < 1:1315309/99‑1 TTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTA < 2:354525/101‑1 CGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAG < 2:703023/101‑1 CGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAG < 1:507742/101‑1 GTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGC > 1:658648/1‑101 tccCCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCAT < 2:187365/98‑1 TCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCAT < 2:1631632/101‑1 ACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAG < 1:700493/101‑1 ACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAG < 2:1134031/101‑1 CCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGC > 1:1217197/1‑101 CCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCA < 1:1440051/101‑1 CCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCA > 2:110411/1‑101 CCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTACGAATAATTTGTTAAGCATAGCA < 2:1119655/101‑1 AGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGA > 2:1716819/1‑101 AGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGA > 2:1172054/1‑101 AGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGA > 1:983696/1‑101 acttaTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTA < 2:734467/96‑1 cttaTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAG < 1:1023753/97‑1 cttaTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAG < 1:1716825/97‑1 cttaTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAG < 2:459047/97‑1 cttaTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAG > 2:784571/5‑101 GTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATT > 2:119967/1‑101 TAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTA > 1:329175/1‑101 AAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGGGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTAT > 1:1448454/1‑101 AAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTAT < 2:658643/101‑1 AAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTAT < 1:1037280/101‑1 cTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCC < 1:1688102/100‑1 ACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGA > 1:1710382/1‑101 TCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATT < 1:1324324/101‑1 CGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTT < 1:1130758/101‑1 CGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTT < 2:857035/101‑1 CTCAGGCAACACGCAAACGATTTACTCGTCGTATTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTACGTTCGTTCACCCCAGTCACTTACTATTGTAAGCTCCTGGAG‑TTCACTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 2/55766‑55659 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcactcgTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTGTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTT < 70/22841‑22743 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |