New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 195 | = 5423 | 0 (0.000) | 36 (0.540) | 24/200 | 1.8 | 80.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 25 | 29389 = | 18 (0.270) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CCGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 195/5326‑5423 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAAAAGGCGGCA > 25/29389‑29438 CCGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTC < 1:1429322/101‑1 CGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCC > 2:1105954/1‑101 TGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTC > 1:1561250/1‑101 TGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTC > 2:251878/1‑101 GTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCG < 2:392906/101‑1 GTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCG > 2:916272/1‑101 AAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCC > 2:1494558/1‑101 AGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCT < 1:1262888/101‑1 AGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCT > 2:1094324/1‑101 GTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTC > 1:181874/1‑101 GTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTC > 1:273364/1‑101 AACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGG < 2:1524187/101‑1 AACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGG < 2:290357/101‑1 CGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGA > 2:936073/1‑101 CGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGA > 2:34976/1‑101 GTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAG > 1:715571/1‑101 GTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAG > 2:759569/1‑101 TGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAG < 2:1363376/101‑1 AAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTT > 1:950545/1‑101 AGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTA < 1:459234/101‑1 GGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAG < 2:255711/101‑1 GGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:1481130/101‑1 GGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:933247/101‑1 GAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGG > 1:1145624/1‑101 AATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAACACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 2:481535/1‑101 ATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTG > 2:1287465/1‑101 ATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTG > 1:1173693/1‑101 ATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTG > 2:1223827/1‑101 GATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:153788/101‑1 TAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 2:1084764/101‑1 TGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGTAAAa > 2:1577483/1‑100 AGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGTAAAacac < 2:1145619/101‑5 GTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGATAGGGTGAGGGGCAAAacacg > 2:1523943/1‑96 AAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGTAAAacacgcg < 2:812939/101‑8 AAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGTAAAacacgcg > 1:527380/1‑94 AAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACAGTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGTAAAacacgcg > 1:1208536/1‑94 CCGTTTGTAAGAGTTAACCGTTGCTAAGGGAATGATAACGATGCAGTAAAAAATAATAACGATGAGGCGAACGACAAAGTTAAAAACGACTGCGGACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 195/5326‑5423 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTCTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAAAAGGCGGCA > 25/29389‑29438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |