| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 187 | 1 = | 0 (0.000) | 62 (0.930) | 47/200 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CTGTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 187/100‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 223/698‑619 CTGTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTT < 2:640638/101‑1CTGTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTT > 1:1351760/1‑101CTGTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGCGATGCTGCCAACTT > 2:793451/1‑101 GTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:364156/101‑1 GTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:437718/101‑1 TGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 2:473844/101‑1 ATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:680260/1‑101 TATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:1602035/101‑1 TATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:527736/1‑101 TATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:298951/1‑101 ATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:588078/101‑1 CCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:95595/101‑1 GTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:298951/101‑1 TTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:789581/101‑1 TTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:1657086/101‑1 TTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:1036396/101‑1 TGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:1609199/1‑101 GAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:701674/1‑101 AAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTGATAGCATTCTTGATATATCCTACTCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 2:270733/1‑101 AAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:815383/1‑101 AGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 2:1145499/101‑1 GTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:1222544/1‑101 GTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:1058279/1‑101 TTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:1485610/101‑1 TTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:17877/1‑101 TGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 2:217019/1‑101 GCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:135949/101‑1 GCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:477407/1‑101 TTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:1642598/101‑1 TTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:773999/101‑1 TTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTCATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:1070525/101‑1 AAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 2:1495551/1‑101 AGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 1:695935/1‑101 CTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 2:272744/101‑1 CTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 2:527389/101‑1 TTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:1268571/101‑1 TTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 2:389933/1‑101 TTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGCGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 1:271585/1‑101 ACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 2:146560/101‑1 CGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:1566981/1‑101 CGAATTTTTCATAGAATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 1:838613/101‑1 TTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:855685/101‑1 ATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:83599/101‑1 TAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:695930/101‑1 ATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 2:1074939/1‑101 ATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:267179/101‑1 ATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 1:476738/1‑101 CTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 2:1540825/101‑1 ATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 1:847390/1‑101 ATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTTCCTCC > 2:986870/1‑101 ATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:1542864/1‑101 ATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:793710/1‑101 TATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:762495/1‑101 ATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 1:294255/1‑101 CTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 1:1170791/1‑101 TAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 2:1594790/1‑101 ATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC > 2:379876/1‑101 TCTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 2:884778/1‑101 CTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:1227445/1‑101 CTCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 2:1139872/1‑101 TCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 2:1032538/1‑101 TCTTCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 2:236455/1‑101 CTGTGGGTATATTTCCGGGTTGAAGTTTGCCTTTAAGAACTTAACGAATTTTTCATAGCATTCTTGATATATCTTAATCTCTTCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 187/100‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 223/698‑619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |