New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 183 | = 3335 | 143 (2.150) | 152 (2.280) | 64/200 | 0.1 | 54.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 41 | 227 = | 108 (1.620) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 183/3236‑3335 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTC > 41/227‑315 CTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCG < 1:1122878/101‑1 CTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCG > 2:1406848/1‑101 TGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGT > 1:1499161/1‑101 TGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGT < 2:427579/101‑1 ACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGC < 1:716179/101‑1 CCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCT < 2:652848/101‑1 CCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCGaaag < 2:1492383/101‑5 CCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCGaaag < 1:1540317/101‑5 CCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTG > 1:548520/1‑101 CCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCGaaagg > 2:1200416/1‑96 CATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGAT > 1:1012870/1‑101 ATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATA < 2:792288/101‑1 ATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATA < 1:455446/101‑1 ATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATA > 1:397333/1‑101 ATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCGaaaggcca < 1:258659/101‑9 ATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGCCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCGAGGCATCAAATTTAGTGTGCTGATA > 2:1411916/1‑101 TGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATAT < 1:1476068/101‑1 TGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATAT > 2:1003844/1‑101 TGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATAT > 1:271555/1‑101 TGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATAT < 2:316343/101‑1 TGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATAT < 2:344638/101‑1 CCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATgg < 2:1386604/101‑3 CAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTT < 2:53805/101‑1 AAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGT > 2:552447/1‑101 AGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTA > 2:952906/1‑101 AGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTA > 2:1318335/1‑101 GTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAG > 2:1318306/1‑101 GTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAG < 1:1559969/101‑1 GTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAG < 2:284874/101‑1 GTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGAAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAG > 1:190375/1‑101 AAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGC > 1:87152/1‑101 AAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGC > 1:192353/1‑101 AACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCG > 2:483824/1‑101 GCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCAC > 2:1431475/1‑101 GCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCAC < 1:944632/101‑1 CGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCC > 1:781375/1‑101 CGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCC > 1:779812/1‑101 CGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGGTGGGAGAGTGCACCC > 2:1240351/1‑101 CCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAA > 2:805267/1‑101 CGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCTCCCTTGGTAAG < 1:290801/101‑1 CGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAG < 1:1591049/101‑1 GATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGG < 1:14003/101‑1 ATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGG < 2:500457/101‑1 gatctGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGT < 2:1192157/96‑1 TGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGg > 1:1255175/1‑100 GTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGA < 2:1292733/101‑1 AGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGG < 2:615913/101‑1 AGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGG < 1:1541887/101‑1 GTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTagatc > 1:1192162/1‑96 GTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGT > 2:754496/1‑101 GTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGT < 1:181197/101‑1 TGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTC < 2:332854/101‑1 GTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCc > 1:179118/1‑100 GTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCc > 2:1704910/1‑100 GTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCc > 2:1620963/1‑100 GGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCcccag > 1:1187808/1‑96 GGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCcccag < 2:513535/101‑6 GTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGT > 1:735666/1‑101 GTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGT > 2:936686/1‑101 GTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGT > 2:771802/1‑101 TCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTT < 1:1442642/101‑1 CCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGAc < 2:1532564/101‑2 CCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGAct > 2:1292475/1‑99 CCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGAct > 1:772659/1‑99 ATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCT > 2:587259/1‑101 ATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCT > 1:1490913/1‑101 ATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCT > 2:1623837/1‑101 GCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGg < 2:356519/101‑2 CGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGgg < 2:1470277/101‑3 GTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCA > 2:15927/1‑101 GTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCA < 1:1704916/101‑1 TAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGTCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAG < 1:677581/101‑1 TAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAG < 2:102217/101‑1 AGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGC < 2:775964/101‑1 AGGGAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGC < 2:368640/101‑1 GAACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACC > 2:12320/1‑101 ACTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCAC < 1:1292481/101‑1 CTGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACT < 1:9333/101‑1 TGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTT < 2:1662862/101‑1 TGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTT < 2:80268/101‑1 TGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTT < 1:447910/101‑1 TGCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTT > 2:200687/1‑101 GCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTt < 1:483829/101‑2 GCCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTt < 2:1044455/101‑2 CCAGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTtt < 2:961051/101‑3 AGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTa > 1:303659/1‑100 AGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTa > 2:1153357/1‑100 AGGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTa > 1:1332197/1‑100 GGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTag < 1:870023/101‑3 GGCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGATCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTat > 1:1687219/1‑99 GCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTagg < 1:1401989/101‑4 GCATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTagg > 2:1105814/1‑98 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 2:362027/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 1:350943/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 1:580715/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 2:715559/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 1:771692/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 1:1364562/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTaggtt > 2:400161/1‑96 ATCAAATTTAGCGTGCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCACTTTTTagaga > 1:68435/1‑96 CTGACCCCATGCCGAACTCAGAAGTGAAACGCCGTAGCGCCGATGGTAGTGTGGGGTCTCCCCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATTAAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 183/3236‑3335 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCACTTCTTTTCTC > 41/227‑315 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |