New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 182 | 1 = | 0 (0.000) | 61 (0.970) +CCAACT |
51/188 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GTCGACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 182/96‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 223/698‑616 |||||| GTCGACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAAC > 1:494828/1‑101 GTCGACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAAC < 2:251803/101‑1 CGACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTT > 2:1096532/1‑101 GACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATGCGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:558819/101‑1 ACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:875033/1‑101 ACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:1423828/1‑101 CGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:1105223/1‑101 GAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 2:865068/1‑101 AGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:1057488/1‑101 CAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:1086372/101‑1 CAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 2:602208/1‑101 AACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 2:1563779/101‑1 ACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:420876/101‑1 ACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:1350263/1‑101 ACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:566893/1‑101 CAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:466691/101‑1 ACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:583925/1‑101 CCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATGCGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:814355/101‑1 CGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:349004/1‑101 ATGGGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 2:184250/101‑1 ATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:1653389/101‑1 ATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:57449/1‑101 TGCGTCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1288818/101‑1 TGCGGCGCTGGGGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:503775/101‑1 GCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1105218/101‑1 GCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:1105681/101‑1 CTGGTGCACCACCCGCTCCACCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:534819/101‑1 TGGTGCAGCATACGCGCCATCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:201127/101‑1 GGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:566935/101‑1 GTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:1379443/101‑1 GCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:701177/101‑1 CAGCATCCGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:242243/101‑1 CAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:1718929/101‑1 CGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:831/101‑1 CGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:1598769/101‑1 GCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 1:875038/101‑1 GCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 1:1615084/101‑1 CGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:628121/101‑1 GCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:350389/1‑101 CAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 2:306362/101‑1 AGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:1614236/101‑1 AGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:410599/1‑101 GCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:1435551/101‑1 CCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 2:1466963/1‑101 AGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 2:1193679/101‑1 GGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:1278152/101‑1 GACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1376250/101‑1 GACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1551431/101‑1 CAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:1569927/101‑1 AGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 2:1160575/1‑101 AGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:1185446/1‑101 TACGTTCTGGCAGATGAGCTGGCGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGCCTTATTGTTCTATCAGATG > 2:390683/1‑101 TACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG < 2:1179068/101‑1 CGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:546799/1‑101 GCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 2:919165/1‑101 TGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:796513/1‑101 GCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < 1:1096537/101‑1 AGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 2:983206/1‑101 AGATGTGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 2:407674/1‑101 TGCTGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT < 1:703920/101‑1 CTGGCGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 2:1427307/1‑101 TGGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > 2:1704921/1‑101 GCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 2:494823/101‑1 |||||| GTCGACGAGCAACAACCGGATGCGGCGCTGGTGCAGCATACGCGCCAGCAGCCGCAGGACAGCTACGTGCTGGCAGATGTGCTGGCGGTGATGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 182/96‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 223/698‑616 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |