New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 161 | = 8872 | 0 (0.000) | 59 (1.040) +TGGCGGCTTACGCCG |
48/170 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 52 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 161/8773‑8872 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCTCTAAAC > 52/1‑100 ||||||||||||||| TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAT < 1:1068791/101‑1 TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAT < 2:326032/101‑1 AATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGG < 2:273830/101‑1 AATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGG > 1:1342783/1‑101 AATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGG > 2:222803/1‑101 ATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGC < 1:779514/101‑1 TCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCT < 2:1247564/101‑1 CATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTT < 2:1606933/101‑1 ATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTA < 1:1166776/101‑1 TAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTAC < 1:510103/101‑1 TTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAA > 2:1424675/1‑101 TTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGGGTTCGCCGCCGCTGAGAC > 2:16528/1‑101 GTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTTAAACTT > 2:1090182/1‑101 TTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTT > 1:1083697/1‑101 TGTTATTAGCAGCGGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTA < 1:887272/101‑1 TGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTA > 1:215688/1‑101 GTTATTAGCAGCAGAACANNNNNNTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAA < 2:649430/101‑1 TATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATC < 2:1320235/101‑1 TATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACCCCGCCGTTGAAACTTTAATa > 1:1291633/1‑100 ATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCA < 2:1495471/101‑1 GCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCAC < 2:338114/101‑1 GCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCAC > 1:1350044/1‑101 AGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCC > 1:154670/1‑101 AACAATGCCGTGTTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCAC < 1:1396565/101‑1 AACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCAC < 2:979806/101‑1 CAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTTATCATCACCCCCCAacc > 1:1274550/1‑98 AATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCG > 1:1459059/1‑101 GTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGGAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGAACAC > 2:640491/1‑101 TGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACC > 1:1570395/1‑101 TAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACCCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTT > 2:249417/1‑101 AGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTT > 1:835480/1‑101 GTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTG < 1:717608/101‑1 TAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTTCGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCCCGCGGATCACCACTTTGCC > 2:774689/1‑101 AATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCc > 2:953869/1‑100 ATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGA > 2:456955/1‑101 TAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATTACCCCTTTGCCGAAG > 2:1707608/1‑101 GCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCCCCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTT < 1:16528/101‑1 GCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTT < 1:165819/101‑1 ctaAAAATATTCTTTTTTCCTGGATTTTAATGGCGTCTTGCGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTT < 1:1004277/98‑1 CTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTT < 2:1274545/101‑1 GAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTAC < 2:1083692/101‑1 AAAATAATCTTTTTCCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACC < 2:641683/101‑1 AAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCCCTTTGCCGACGTTTTTACCC > 2:215876/1‑101 AAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCC < 1:486449/101‑1 AATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCT > 2:64094/1‑101 AATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCT > 1:1387667/1‑101 ATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGGTTTTACCCTT > 2:799533/1‑101 ATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCCTACTCCGCCGTTGAAACTTTACTCATCACCCTCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGCTTTTACCCct > 1:399438/1‑99 TAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCCCCACGCGGATTACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTC > 2:1590398/1‑101 TAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCCTTGAAAATTTAAACATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTTCCCAAATTTTTACCCTTC > 2:339034/1‑101 AAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTCCGCCGCCGTTGAAACTTTAATCACCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCA < 2:943560/101‑1 AAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTTATCATCACCCGCCACGCGGATTACCACTTTTCCGAAGTTTTTACCCTTCA > 2:1230358/1‑101 AAGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCA > 1:1483391/1‑101 AGCTTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAAATTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTTCCGAAGTTTTTACCCTTCAG > 2:1177417/1‑101 TTTTTGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAG < 2:1399738/101‑1 TTGCCTGGATTTTTATGCGGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCC < 2:985381/101‑1 TGCCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCTCCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCG < 2:1121024/101‑1 CCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTTATCATCACCCGCCCCGCGGGTCACCACTTTTCCGAAGGTTTTTACCTTCAGCCGGCCGAT > 2:874969/1‑101 CCTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGAT > 1:339168/1‑101 CTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATA > 1:226943/1‑101 CTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATA > 2:236765/1‑101 CTGGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGGTGAAAATTTAATCATCACCCGCCCCGCGGAAAACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGCTA > 2:1658030/1‑101 CTGGATTTTTATGGCGGCTGACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTTCCCTTCAGCAGGCCGATA < 2:952416/101‑1 GGATTTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAA > 1:1648298/1‑101 TTTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACCCGGATCACACCTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAAAGTC > 1:1367799/1‑101 TTTATGGCGGTTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCT < 1:640496/101‑1 TTTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCT < 2:1401810/101‑1 TTATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTG < 1:1281122/101‑1 tagGGCGCCTTACGCCGCCTTTGAAACTTTAATCATCCCCCGCCACTCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGT < 2:117260/98‑1 TATGGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGT > 2:1079054/1‑101 GGCGGCTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGC < 1:1100356/101‑1 GGCGGCTTACGCCGCCGGTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGGGGC > 2:695286/1‑101 CTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATT < 2:1387661/101‑1 CTTACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATT > 1:564765/1‑101 TACGCCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCT < 1:774694/101‑1 CCGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCTCTAA < 2:1016011/101‑1 CGCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCTCTAAA < 2:668357/101‑1 GCCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCTCTAAAC < 1:339894/101‑1 ||||||||||||||| TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 161/8773‑8872 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGTTGAAACTTTAATCATCACCCGCCACGCGGATCACCACTTTGCCGAAGTTTTTACCCTTCAGCAGGCCGATAAACGTCTGTGGCGCATTCTCTAAAC > 52/1‑100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |