New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 13 | 11 = | 0 (0.000) | 61 (0.990) | 45/184 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 156 | = 9517 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
ATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCCCCGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 13/116‑11 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccccgccgTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTGCAAAT < 156/9517‑9418 ATGACGGGGCTGGCGTGTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCac < 2:1609056/101‑3 ATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCac > 2:1577570/1‑99 ATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGCGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCac > 2:841885/1‑99 GGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCG > 2:193089/1‑101 GGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTG < 2:946330/101‑1 GGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTG < 1:318221/101‑1 CGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTT < 1:468009/101‑1 GTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTG > 2:962226/1‑101 GCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGG > 1:1269505/1‑101 CGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGT < 2:1336270/101‑1 CGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGT > 1:57914/1‑101 GGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTG > 2:74956/1‑101 CGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATA < 2:1175551/101‑1 CTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATT > 2:1109404/1‑101 CTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATT > 1:509860/1‑101 CTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATT > 2:1656251/1‑101 TGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTAT < 2:1419348/101‑1 GCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATG > 1:297371/1‑101 GCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATG < 1:27479/101‑1 CTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGG < 1:1250369/101‑1 CTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGG > 2:121456/1‑101 TGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGT > 2:464079/1‑101 TGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGT > 1:1377869/1‑101 GGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTT < 2:1066820/101‑1 ATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCG < 1:1505792/101‑1 ATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCG > 1:608097/1‑101 CGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGT > 2:1007146/1‑101 CGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGT < 2:815703/101‑1 GGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTAT < 2:1269500/101‑1 GGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTAT > 2:234078/1‑101 GTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATC < 1:96677/101‑1 AGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCA < 1:591396/101‑1 CACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACC > 1:1439174/1‑101 GTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCGAATATTTATGTTGGTTCCGGCTCCATTTTCGGCACCTCC > 2:819413/1‑101 GTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCC > 1:387332/1‑101 GTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCC > 2:1566590/1‑101 TCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCAT > 2:51181/1‑101 CCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATT > 2:709051/1‑101 CGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTG > 1:360954/1‑101 CGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTG < 2:648321/101‑1 CGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGATTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTG < 2:1517893/101‑1 tTCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCCCCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCG < 2:717859/100‑1 ATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCG < 2:1296217/101‑1 GGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTT < 1:1656257/101‑1 gcGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTA < 1:841890/99‑1 GTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTA > 1:891622/1‑101 GCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATT < 2:28767/101‑1 CGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTA < 1:496798/101‑1 GTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGCTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAG > 1:814219/1‑101 GTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGG < 2:73061/101‑1 GTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGG > 1:1033345/1‑101 CTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATA > 1:107164/1‑101 TGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATAT < 1:1118561/101‑1 GATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATT < 2:297371/101‑1 CCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCt > 2:1352719/1‑100 CCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCA > 2:257603/1‑101 gtcaCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAA > 2:679403/5‑101 CCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAA < 2:55752/101‑1 CATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAG > 2:1109779/1‑101 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG < 2:489874/101‑1 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG > 1:23491/1‑101 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG > 1:1623410/1‑101 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG < 1:1007151/101‑1 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG > 2:908648/1‑101 ATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGG < 1:257603/101‑1 caCCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTT < 2:1247422/99‑1 CCGCCGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTG < 2:387327/101‑1 CGTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTGCAAA < 2:23491/101‑1 GTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTGCAAAT < 1:234078/101‑1 GTGGTGCTTGAAGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTGCAAAT > 2:777348/1‑101 ATGACGGGGCTGGCGTCTGCGGTCGCCGCTGTGCTGCTGGTATCGTATTTTGGTTCAGCACGTTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCCCCGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 13/116‑11 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccccgccgTGGTGCTTGGCGGTGCCAATATTTATGGTGGTTCCGGTTCCATTATCGGCACCGCCATTGCGGTTTTATTAGTGGGATATTTGCAACAAGGTTTGCAAAT < 156/9517‑9418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |