New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 121 | 1 = | 0 (0.000) | 87 (2.210) +ACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC |
36/118 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 121/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 223/1‑46 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAA > 2:147346/1‑101 ATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACT < 1:98057/101‑1 ATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:899387/1‑101 ATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTAT > 2:290192/1‑101 ATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:232149/101‑1 TGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:1326934/101‑1 CCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:883898/101‑1 GAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:204564/101‑1 AACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:933104/101‑1 AACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:1678638/101‑1 ATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:1278785/1‑101 ATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:1071425/1‑101 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TGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:899382/101‑1 TGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT > 2:824519/1‑101 CATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:1036100/1‑101 ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 1:164128/1‑101 ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 2:831667/1‑101 ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 1:1012451/1‑101 TGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT > 2:569140/1‑101 TGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 1:1389635/101‑1 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TCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA < 2:1140751/101‑1 CAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAC > 2:1184329/1‑101 CAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAC < 2:1198537/101‑1 AATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:50893/1‑101 AATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:1495530/1‑101 ggtttgccgtTGAGGCAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCCCCGATTTTGCGAACGAC > 2:52716/11‑101 tttgccgtTGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 2:58168/93‑1 ttagtaaactAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG > 2:151952/11‑101 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cccgttttcAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:748203/92‑1 gccagcacAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG > 1:311444/9‑101 gtaaactAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 1:534871/8‑101 cgttttcAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 2:365856/8‑101 cgttttcAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 2:758308/8‑101 gttttcAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGATCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 2:1022180/7‑101 gggagGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGtaac > 1:1212459/6‑97 cagcacAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 2:1087028/7‑101 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ATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGAGGTAATGACTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 121/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 223/1‑46 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |