New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 113 | = 14496 | 24 (0.360) | 41 (0.640) | 26/192 | 1.5 | 78.1% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 147 | = 9950 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14393‑14496 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAACCAG < 147/9950‑9854 AAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACG > 2:766055/1‑101 GGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGT > 2:761891/1‑101 atgtgaaACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCA > 2:1406306/8‑101 atgtgaaACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCA > 1:970390/8‑101 gaaACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCG < 1:1129579/98‑1 ACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCA < 2:896626/101‑1 CTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAG > 1:1713743/1‑101 GGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCT > 1:1589731/1‑101 GGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCT < 2:647989/101‑1 GATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC < 1:608765/101‑1 ATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCT < 2:757011/101‑1 ATGCGGCATAAGCTCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGACATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCT < 1:1068494/101‑1 GCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTT < 1:233355/101‑1 CGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGTCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTC > 1:981007/1‑101 CGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTC < 2:869812/101‑1 CGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTC > 2:1459930/1‑101 GGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCT < 2:1127644/101‑1 GCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTT < 1:1456564/101‑1 GCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTT > 1:739542/1‑101 CGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTA < 1:1060069/101‑1 CGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTA < 2:41612/101‑1 GTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTAC < 2:779534/101‑1 GTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTAC > 2:644517/1‑101 GTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTAC > 1:824831/1‑101 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTc > 1:750103/1‑100 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTT > 1:1480058/1‑101 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTT > 2:684678/1‑101 ACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTG < 1:164829/101‑1 ACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTG < 1:1491463/101‑1 ACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTG < 2:168982/101‑1 CCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCT < 2:1674310/101‑1 CTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTA > 2:375286/1‑101 TTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAA < 1:1257552/101‑1 TTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAA < 2:1217222/101‑1 TATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAAT > 1:933173/1‑101 TATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATAAGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATATTTTTCTTACGTTGGCTAAT > 2:1668623/1‑101 TCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGTCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATAC < 1:198985/101‑1 TCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATAC < 1:421436/101‑1 TCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATAC < 2:1509183/101‑1 TCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATAC < 1:46499/101‑1 GCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTT < 1:1694927/101‑1 CTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAA > 2:781837/1‑101 CGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAACCA > 2:3067/1‑101 GGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAACCAG > 2:1374898/1‑101 GGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAACCAG > 2:600908/1‑101 AAGGAATAAGTACATCATTGCGGATGCGCTGCTTTAGGGTGGCGCATTTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14393‑14496 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTCTTTCTTACGTTGGCTAATACGCTTAACCAG < 147/9950‑9854 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |